G330020


Basic Information

Item Value
gene id G330020
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000112
NCBI id null
chromosome length 5247617
location 3487307 ~ 3503308 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU375130
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU375130 True 12118 lncRNA 0.37 3 3487307 3503308

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000112_03393172_03448154 PRKCA coding downstream 39153 3391852 ~ 3448154 (-)
CI01000112_03367247_03384263 CACNG5B, CACNG5, CACNG5A coding downstream 101423 3366873 ~ 3385884 (-)
CI01000112_03291919_03299963 RAC3B, RAC3, RAC3A, RAC1, RAC1A, RAC1B, RAC3.S, RAC1.L coding downstream 187344 3291241 ~ 3299963 (-)
CI01000112_03205596_03209747 NA coding downstream 277361 3205434 ~ 3209946 (-)
CI01000112_03167204_03177153 NA coding downstream 310154 3167026 ~ 3177153 (-)
CI01000112_03506254_03517454 NA coding upstream 2364 3504455 ~ 3518742 (-)
CI01000112_03569282_03569449 NA coding upstream 65809 3569117 ~ 3569783 (-)
CI01000112_04031927_04033721 NA coding upstream 528532 4031840 ~ 4033830 (-)
CI01000112_04095809_04175244 NA coding upstream 591972 4095280 ~ 4175284 (-)
CI01000112_04190915_04191720 NA coding upstream 687416 4190724 ~ 4191720 (-)
G330012 NA non-coding downstream 1531 3469925 ~ 3485776 (-)
G330170 NA non-coding downstream 122639 3364385 ~ 3364668 (-)
G329975 NA non-coding downstream 212306 3272540 ~ 3275001 (-)
G330127 NA non-coding downstream 229244 3208491 ~ 3258063 (-)
G330014 NA non-coding downstream 242021 3195863 ~ 3245286 (-)
G330002 NA non-coding upstream 38974 3542282 ~ 3556118 (-)
G330010 NA non-coding upstream 56866 3560174 ~ 3851625 (-)
G330279 NA non-coding upstream 208231 3711539 ~ 3712031 (-)
G330301 NA non-coding upstream 254936 3758244 ~ 3773774 (-)
G329985 NA non-coding upstream 275054 3778362 ~ 3860190 (-)
CI01000112_03068505_03072256 NA other downstream 414577 3067320 ~ 3072879 (-)
G329672 NA other downstream 1467854 2016704 ~ 2019453 (-)
G329569 NA other downstream 1489448 1991666 ~ 1997859 (-)
G329559 NA other downstream 1677568 1791084 ~ 1809739 (-)
G329587 NA other downstream 1853985 1629776 ~ 1633322 (-)

Expression


Co-expression Network