G332405


Basic Information

Item Value
gene id G332405
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000113
NCBI id null
chromosome length 2886875
location 838581 ~ 846812 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU377907
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU377907 True 7635 lncRNA 0.38 2 838581 846812

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000113_00770409_00789987 OLFM2, OLFM2A coding downstream 47898 770133 ~ 790683 (-)
CI01000113_00616541_00627359 NA coding downstream 211222 616361 ~ 627359 (-)
CI01000113_00611039_00611881 P2RY11 coding downstream 226642 610860 ~ 611939 (-)
CI01000113_00593453_00601556 EIF3G coding downstream 237025 593382 ~ 601556 (-)
CI01000113_00529415_00542504 NA coding downstream 295561 529230 ~ 543020 (-)
CI01000113_00907179_00957938 COL5A3B, COL5A3, COL5A3A coding upstream 60129 906941 ~ 958094 (-)
CI01000113_01096667_01106622 RDH8 coding upstream 249510 1096322 ~ 1106870 (-)
CI01000113_01137145_01178626 CAMSAP3 coding upstream 290185 1136997 ~ 1178626 (-)
CI01000113_01180049_01192316 XAB2, SYF1 coding upstream 333024 1179836 ~ 1192316 (-)
CI01000113_01208541_01221483 STXBP2 coding upstream 361077 1207889 ~ 1222083 (-)
G332415 NA non-coding downstream 83619 754741 ~ 754962 (-)
G332414 NA non-coding downstream 86682 751655 ~ 751899 (-)
G332393 NA non-coding downstream 116725 721657 ~ 721856 (-)
G332389 NA non-coding downstream 132320 705979 ~ 706261 (-)
G332384 NA non-coding downstream 148593 689750 ~ 689988 (-)
G332427 NA non-coding upstream 16522 863334 ~ 869739 (-)
G332458 NA non-coding upstream 130488 977300 ~ 977523 (-)
G332524 NA non-coding upstream 270999 1117811 ~ 1118547 (-)
G332574 NA non-coding upstream 392859 1239671 ~ 1239956 (-)
G332523 NA non-coding upstream 399481 1246293 ~ 1246573 (-)
G332160 NA other downstream 391744 390227 ~ 446837 (-)
G332210 NA other downstream 789096 47990 ~ 49485 (-)
G332649 NA other upstream 1300402 2147214 ~ 2148558 (-)
G332837 NA other upstream 1404033 2250845 ~ 2251213 (-)
CI01000113_02356565_02370009 NA other upstream 1520804 2356565 ~ 2370009 (-)

Expression


Co-expression Network