G332945


Basic Information

Item Value
gene id G332945
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000113
NCBI id null
chromosome length 2886875
location 2747756 ~ 2755692 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU378519
AAACTTTCTATTCATCAAAAAATCCTGACAAAATGTATAACAGTTTCCACAGAAACATTAAAAAATAAAAAACATTGATAATAATCAGAAATATTTCTTGAGCATCAAATAATCATATTAGAATTATTTCTGACACTGAAGACTGGAGTAATGATGCTGAAAATTCAGCTTTACATCACAGGAATAAATTACATTTTACTATATATTCAAATAGAAAACAGTTATTTTCAAATTGTAATAATATTTCACAATATAACTGTATTACCATATTTTTTGAAATGCAGTCTTGGTGAGCGTAAGAGACTCAAAAAGCACTGAAAGCATTATATGTTGTGTGTTGATTTTATTTGCCGTGTTCACACACAGGCTCAGTCTGACGCTTGTGCACTGGGCTACAGCGCGGTCAACGTGAGCTCGGCAGCCTCCCAGCAATTTAAAGAGAAAGAAGAGAATCTTTGAGAAAGAGAATCTGTCAGATGTCTTTGAGAGTACGATTGTGTGTGTGTAATGGAAAGGGATGTTGCTGAGAGAGAGGGCACACACACACTAATACAGCAGAAAACAGCACCTCTGCCTTCCCTCCACGTCTGTCTATTTTAAAACCACACATCTTCCCTTTCACCCTCTGCCTCTCTCTCACTCTCTATTTGACCCTTTTGTCTCCATCTCCCACTTTCTCTTTCTTCATCTCATTTTCCCCATTTCTATCTATTTTTGTGATAACAATTTCTCTCACGTTCCCTGTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCGTGCTCTCTCTATGACCCTGTCTCACTCTCTCCCGCTCTCGTTCTCTCGTCTAGCTGCCAATTTTAACACTAAGCATCTCTCATGTGCATGCGCCGCACCATCCTTCTCTCTGATTCATTCCTCTCTTCCTCTTGCACTTGTCACTATCTCTCCGTTCTAAATGTGGCTCTGAAACCCTATCACCCCAATACGGCACAATAATTTATTCTGTGTTATGCTGAGAAGCACGCGCTGGTCTCAGAGCAGAGGTGGCTGATGGGAATAAAGGACCGCTGCAGCTTCAACACAAAGCAGCTGATCTCAGGGCAGCTCGAAACAACAGACTGACATTTTCTCTGTGTATAACCTGGAAACGGTACCTTTTTTATGATCAGTATAGTATCAGCAGCTGATCTCAGGGCAGCTGTTAAAAGTATATTTCACGCAAAAATGTAAATTCTGTCATCGTTTAGATAGACCTTATGCACCAGAGAAACAAGCGCACAGCCAGCAGTAGCTCTGTATATTTCTATGGCATCGCTGTCGAAGAGTGATTAGCTGCTGAAGTGGATTTACTTATTGTAGAGTTAACAAAAGTTATCATGAGCATTGTAATGTTTGAAGCGGATGTCATAAATGTAAGTAGAACGGGAAGATTTAAAAATGAGTGGTTCATTCATAAATCTGTAAGATCTTACCTTCATGCTATATATATATCTTACAATATTTTATAATTATAGTAATTGATTATAAAAACCACATAATCTCATTGTTAACACTTAATAAAACTTCAAAATTAATTATATCTCCATTATGTTTTTTTACACTTTTAAAAACCTTATTCGTCAATGACTCATATTTACAAACTTTTATGTTAGATGCGATTAGATGTATTCATATTTCGAATTAGCTTTTATTTTTGTATTTTCGTTCATTTTAGCTTAGATTTTTGCAGGTTTTTATGTGTTTTTGTCATTTTTATGATTTTTTCGAATTCTTTATTTTTATTTCAGTTTGAGGCAACATTTCTAATTTTGTTTAGTTAAGTTTTTTTTAAGTTTTTCATCTAATACTTATATTTTATTTCAGCTTTATTTTAATTACTGAAAATGATTTTTATGAGTTTTAGTAACTATTATAACTATGAACCAGAATCAGTATTATTATCAGTTATAGCATAGCAGAGGAAGATTCAGCATACTGCAGCATTGCGTTGTTTTCATATAGCAGCTTTGCTTAAAGTCAGCATGAAATGGATTATTGTAACTATTGTGATGTATATCCGAGTGAAACGGCTTTTTGAACAAGAAAAACTGTAGGGCGGGAGTTGATTTTGTCCATGTGGAATTGTTTGGATGGTTGTGGTTTGCTATTGGTGGATCTCATGTGAGTGACAGGTTGCCCCGCCCACACTCCAGTAAACACGCCATCAGAGGAGATGAGCTGCAAGAGGGAGGGGAAGTTATTTTGATTAAAGATTATGAGGCACATGAATTTAAAAATAAATAAATAAGGATGATGGGCACAGATAAATTATTTTGTGTATAAAAGCACATCATAGATAGTATAGTATAAATATAGCAGAGGATGGGTTACCAGTTGGCTTCATTATGTTAACAAAAAACCTTCAAAATACTGTGTGTGTGTGTAAGACAGAGAGAGAGACAGCTCAATCTCATTGCTCTCATTAGGATTTCAGGATTTCACGCTTCGTTATACTCTGACTTTGTCTTTAATTATGTCACTTAAGAGCAGTAGCGTTCAAACCTTTCTTCCTCTGCGATCTGACATTAACATGCGCCTCCACACACTCCACTCTCACAAGCAAATCAGCAGCTAAAAGCAGCACAAAACAAAAGGATAATGTCATTTTCTAGGTCTCTCTCTGTCCTTTACTGTCTATAGCCAGCTGCGTCTCGCGGCCATTAGCGTTCTGTCCACCCCCCATTTTCAATGCCACCAATTCCCAGAGCCAAGACTGAACCCCACCTCCACTCATTCACGCGCTGTTTTAATCTCTCCATCCTCCCACCTTGATCAATCCAGTCTCTGTGCCGCTGAGACACCAATGTCACAGGATCCATCACTCTTCTTCTTCTATCTTGGCACAAAATCAGAAATGATCACGCCACACACACACAGTTATTTTGCTCGTCAGATATCTGTTGAGGTATTTATGGTGAATTGTTGTACATATGCGCCGTATGTACATTTGATTAATTTATTGTATCTAATCTTCTCTTTATGTTTCATGGATGCAGAGATGTTGTACATGTAATTTAGCATAAACACAGTAAGTGTGTGATGGATGTGGAATATCTTGCTCTATATGAGAGGTTAAATGTGCAATAGGACATTTTCGGAGAGGCTAACAATAGCAAGCTAGCTTTTAAATCATAAGATCCCACCATCCCTTCAGAGCATCTCCAAAGCCACGCCTCCTTCAAAACACATGAACGCACACACACACAGCTGCTCTCAGTAAAGCATCACAAGAGACGGCATTAAACTACCTCATGTCTGAAAGCACAAAACATTACAATAATAAAGAACGTAAACAACTTAGAGAGCTCGTACCTTACTGCTGCAGATTCATTTTGGTGTTGATACCGTTGACATGGAAACACATAATTCTGAGTCTGAGGACTGAGTCTGAGGTTAGAGTTGCCATCTCTTAATTACGATAGTTATGGTATGGCGCAGCATAAGCTTGTTGTTTTGGAGGAACTGTAAAAGGTGGCTGCTGTTTGTTTGTGGTGCTCCGTGACTGACGTCTGTCTACATAAACTCTGCATGGCATAAAACTGGCTGATGACGTATGATGTCTGCGCAAACAGGGTGCGCAAGGGTATGTAAAAACATACGTTGACAGTCAGGTAGGACATTGTATTATTTAATTCGGACCAAATATAAAGATTGGATGAATATTTTATGGTCCTTCGCCTTCCACAGAATATATATTTAACATAGTGATTGCTATCAGGATATGAGGAGACTTTCAACCAGTATAACAAAAAATGTTTCTGTATGTTTCAGAATCACCTATTGCACCTTTAAGTCACTTCAGTTAAAGTATCTAGGCTAGTATCTTGATGACATTTGTGTGAGGCAGTATGTGTAGGTAGGGTGTCTGTAAGAGTTAGTGGATAATTGCACACAGATTAACACTCAAGCAGCCTCAGGTGGAGCAGTGTATGTGTGTAAGAGTGTGACTGAAGTATATGTAATTGTAGGGTGTGTGTGAGTAGCCTAGTTTCACAATATAATCACTGGTCTAGTGAAGTTTTACTATGCACCACAAGAGTGGTTGTTTTTTGGGGAGGATTTCTGAACAACATTGTTTTGAGAGGCTGTTTCAGAAGTTGTTATTTTTAAAAGATATGTACAGTATGGAAGTAGATAAAGCAACAATATGGTCAGATTTTTAATGACACTGTTGAATGGATTACATCAGTCATTACACACACAATTAATACACAACCAAATTTCATAAAAAAACACTACACTTACAAAGTTAATCAAGGTCATATCTAAGGCCGCATCCACATGAAGCCAGAGCTTTCCCTATCCGATATTTTTTTTCCTCATCTCAAGAAATATCTGCGTACACATGAAACCGACTCAAAACAATGTATAGTATACATGCCAGATCAGTATGTGGTGCTGTAATTCTGCCAAAGAGATACACTAAAAACGGAGAATAAGACTATATATGCATAACACCGGATCCGTCTGGACGAAACGCCGATACATTTCCGTCTGGATGGGCTCTAAATCAAGTTTAAAGGGGATTTATGTAGAATTCAGAAACCTTGTTATTAGTGACACCGGTGGCCGTTAAGTGAACTGCAGCCAGCAACTTATTAATCGTGTTCGCACTTCTGCACACGTAACGTTCAAGAGACTGAACATGATTCAAGGCCTCGATATTCTCACAGTGAATTTCTTTCTCGAAAACAGCAGTTAAGAAAGCATCTGATCATAGCGATGTGGATATGTTTGCACCAGCTCTGCAATTCACCACGTTTCAGATTACAAATGACAAAAATGTCCTGAGTCCTTCACTTAAAAATCAGTCTACAGGCTTTCATAGACAACCTAGGAGGTTGGGGAAGGTCTCGTTTTTTAAGTTTTGCCTTTTTAATTTTCCAAGCTCCTTCATATTCAAGATAAAAATCAAAATTGACCTTATTACTCATTCCTGTTCCTGCATGTTTCATTTGTACAAGTTATTCCAAGGGGGAAAAATGTCTTTG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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU378519 True 7911 lncRNA 0.38 2 2747756 2755692

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000113_02719034_02729100 RAI1 coding downstream 18656 2718742 ~ 2729100 (-)
CI01000113_02614236_02620012 NA coding downstream 127744 2614226 ~ 2620012 (-)
CI01000113_02604593_02611740 GID4, CQ039 coding downstream 135766 2604533 ~ 2611990 (-)
CI01000113_02585185_02588728 NOXO1 coding downstream 158959 2584692 ~ 2588797 (-)
CI01000113_02542996_02548587 SCO1 coding downstream 199169 2542996 ~ 2548587 (-)
CI01000113_02791507_02858943 FAM20C coding upstream 34866 2790558 ~ 2859353 (-)
G332940 NA non-coding downstream 43058 2703395 ~ 2704698 (-)
G332931 NA non-coding downstream 50962 2696225 ~ 2696794 (-)
G332978 NA non-coding downstream 147987 2599558 ~ 2599769 (-)
G332977 NA non-coding downstream 148636 2598836 ~ 2599120 (-)
G332975 NA non-coding downstream 155274 2592283 ~ 2592482 (-)
G332937 NA non-coding upstream 30625 2786317 ~ 2788496 (-)
CI01000113_02356565_02370009 NA other downstream 379425 2356565 ~ 2370009 (-)
G332837 NA other downstream 496543 2250845 ~ 2251213 (-)
G332649 NA other downstream 599198 2147214 ~ 2148558 (-)
G332160 NA other downstream 2300919 390227 ~ 446837 (-)
G332210 NA other downstream 2698271 47990 ~ 49485 (-)

Expression


Co-expression Network