XLOC_011606


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_011606
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 37900431 ~ 37922022 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00024727
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GGGAGGGTCATAACAACAATAGGCCATAGATCTGCACTGATCTCCATCTAAACCAGAGATATACATCTCAAATAGAGCGTAAAGGCATTGATCTAAATACGGAATACCGGGATTACTGTACTGGTTCATGCTGTTTAATGAGAACGCTTATGTGAACACCTAAATACACGagGTTAAAGGTCAGACTTGGAGATTTCAGCGTTCCAGCACTCCATGTCTTCACATCAGTCTTCATTAACCGTCTGGATCTCCTCAGTCTATATGCAATGTCCACCTCTCTCACTCCCAACAAACAACATATGCTCTGTGAGCTGGCTACTGTTAGCCATCATAATAGCAGAGCTGGGTGGAGGAGGGATGATGGAGGAGGGCTCTTTCATTTCATTTGCCTCGATGTAGGAAGTAGCATTCAAAAGTAAATACTGATGAcaaaagactaaataaaaaaagactgagTGCTGggccagtttttctttttttttttttagcatttgaaGCTTGACCACAGCTgacaaaagaaagaacaaaacagagagactgtttttgattgtcagtaaacatgtcaggctgttCATACTTCTTTTCCTTTCCACGTCAAACATAATCCTTGTATAAATAGACCACAGGGTACGTACCTAACTTTGTGCTTAGTTAAAactttcagtatttatttatttatttattcatttatttgtttgttcatttttttttatttagtcattcaattatttataatttttttattcatttatttattcatttaagcatttatttatttattccttcatttattgatttatttattaatttatgcatttatttattaataatttatttatttagatgtttatttattttttattcgcatttacttatttatttatttgtccacttatttatttattttttcatttatttatttatgcattaatttattggttcgtttatttatttttttattcatttatgaatttattttaaattttgatttttgatttttaattaattaatttatttgtttgtttatttatttatttatttactcatgcatttatatgtttatttagttatttgtttaattatttatttatttattcgtttaattatttatttatgcatttatttatttgtttgtttttttgtttgtttgtttgtttgttaatttatttatgcatacatatatttccttgtgtggagtttgcatgttctccctgcgtttgtttgggtttcctttgggtgctccggtttcccccacagtccaaagacgtgtggtacaggtgaattgggtaggataaaattgtccgtagtgtttgtgtgtgtgtgaatgagtgtgtgtggatgtttcccagggatgggttgtggctggaagggcatccgtgcgtaaaaaacttgctggatgggttggcggttcattgcgctgtagcgaccccggattaataaagggaccaagacGACAGGTAAATGAATGAGTATTtccttgatttattttattttgtttttaagaaaacagtcacaaacaatttgttaattatttctctacattatttatctttattatagTCAAATGTAACCctttgaattaaatataaaatgtaataaaaatgaaatagtgtatttttttaaataagatttcCACTCAGTCTGAGGAAActaaatttataattatataaaatataataaacctgaACATTAATCTTTACAGTATAGATTTTAAACTCCTTTGGCTCCTCCTTGTGGCTGTTTTggaaattaagtgaagttttcaATGTTAACAACAGGGGGCAGGTCACCCTTCATTTTGTTGCTGTatacaatctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctctccccatacACAAGTGTTATAAATCAAATCATGTTTTCTTCAgtggttttacagtgtgtttggtCTCATCCCTGATTCAGAATGACATCAACCCCAGCATTAATCACAAAATCCTACACACAGCAGGCAGTTTCACAGTGCATAAGGCAGTTTCTTTCACTGTGCGTCTATTTTCAAAGGTTATCTTTAAAGCACaatcagttattttaaattagatgCTTCCAGACTGAAGCTACACAAAGATGACAGCATAATAAAAAACAGCAGCCAGAAGAATGCACAGTGAGAAGTTGCCTTAAAGGCCATGTTTCGCATGCtaaagcaatgtgtttgttcCACATTCAGACATTTATGAGGTCAATTGAactgctacacacacacatacacacacacatacacacagagcagACTTGTTTTTAGCCCACTGAACTGTAAAATGTGCTGTTTTTTGGTCTCCTCCCCCAGAGTTTGTTCCATGTGTGTATGTCTGCTAAAGCTATCAACGCTCTGCCCCAtccatctctctgtctctcactcAATGCTTTTTCACTGCCTCTAGTAGATAGAACAACTACATGGGATTAACCCTTAAAGGTGAAGCAAGAAGTATTAAGTTACTATACTCCATTAATGACTTGTCACCCACAAAATTGTAAATGCTGCATTAGACATTAGAACACATAGCTGCTAGGAATATTAGAAGTGATccacctaaaataaaaatgaaatcaaaatttacttaTCTTTTATTATATGTACATTACAGACCAAATGTTTGGACACACCTTCTCATTCAAAGAGTTTTCGTGACTATGAAAATTGTACATTCACACTGAAGGCATCAGAACTATATGAATGAACACATGTGGAATTATATACATGACAAAAAAGTGTGAAACAACTGAAAATATGTCATATTCTAGGTTCTTCAAAGTAGCCACCTTTTGCTTTGATTACTGCACACTCTTGGCATTCTCTTGATAAGCTTCAAGAGGTAGTCCTCTGAAATGGTCTTCCAACAGTCTTGAAGGAGTTCCCTGAGATGCTTAGCACTTGTTGGCCCTTTTGCCTTCACTCTGCTGTCCAGCTCACCCAAACCATCTCGACTGGGTTCAGGTccggtgactatggaggccaggTCATCTGACGCAGCACCCCATCACTCTCCTTGGTCAAATAGCCCTTACGCAGCCTGGAGGTGTGTTTGGTGTCATTGtccttttgaaaaataaaatatggtcCAACTAAACTCAGTCCGGATGGAATAGCATGCCGCTGCAAGATGCTGTGGTAGCCATGCTGTTTCAGTATGCCTTCAATTTTGAATCTCACCATCACACCTCCTCCTCCATGCTTTACGGTGGGAACCAGGCATGTAGAGTCCATCCGTTCACCTTTTCTGCGTGACACAAAGACACGGTGGTTAGAACCAAAAATCTCAAATTTGCACTCATCAGACCAAAGCACAGATTTCCACTGGTCTAATGTCCATTTCTTGTGTTCTTTAGCCCAAACAAGTCTGCTTGCTGCCTGTCCTTAGCAGTGGTTTCCTAGCAGATATTCTACCATGAAGGCCTGGTTCACACAGTCTCCTCTTAACAGTTGTTCTAGAGATGTGTCTGCTGCTAGAACTCTGTGTGGCATTGACCTGGTCTCTAATCTGAGCTGCTGTCAACCTGCGATTTCTGATGCTGGTGACTCTGATGAACTTATCCTCCGTCTTGCTTTTCTGGGGCGGCCCGCATGCGAGTCAGTTACTTTGTAGCACTTGATGGTTTTTGTGACTGCATTTGGGGACACTTTCAAAGTTTTCCCAATTTTTCAGTCTAACTgactttcattttttaaagtaagGATGGCCACTCGTTGTTCTCtactttgctgttttttttcttgcaCTGAACCCAGAAAGCAGCATGTACCGCACCAATCTATACTGAACAATCTACTGTTCAAAAGTGtgaacagtttatttatttaaaatctatatatttatatattttatatttatgtatttttatattcaaatatattaccaaatattaaaaaagtgaaaatgtaaacaaaaatgaaagaaaaatgactgaaaactgcAATAATTATTTTAGGTgtaacaaattaaagtaattcAAATTATTCACATGTATCACCAATTAAACATCCTCAGGTGCCTTTTATGCTAttgcgtttttgttttaaaatattttattttattcacacactgtaaaaaagtttgtaattttaaggtttattttcagcagctggggtgctggaaaaaacttaaaataaaggacgttaaattacagaaatttactgtaaaataacagaaactgttgaattacaggaatttacaaaaaatttgtatatgtattttaatgtccattattttacaataaatctcTATAATTTCATGGCCatattttacggtttatttccggcaccccagctgcccgaaataaaccgtaaaatttcagattttttttacagtgaagttgAATaccataattcattcattcaggtaaATAACTTCCAGTATATTTGGGATTTGGCATCATGAAAGAATTCTTTTGATTCCATCTGCCTCAGCAGCACATTCAGAGGTAACTATCTGCAATTTTATAGAATTATTTCAAGGTTAGCATGGAAAAGTTTAATAATTCCAGATGTAGCTATCCTCTAGTAACTTGCACTGTAGTAAAATATTTGGAAATAATCCATCTCAAAATAATGGACCTTACATATTGGATATCCAGTCATCTGATTACTGCATCCTGAATTAGATTTTCATTCCTGATTAGAATAATGTTGAAAATCCAAGAAAGATGAAGTAATAAAAGTGTTTAAAGTTCAAACATTTGTCTTACAATGAAGAAAACTCTGTTCACTTAAACTGAATGTGATTTGCATACATCCCCAAAATCAGACACAcaacaataaaactgaaataacttAAATGGAGCAACAACTCTGCTGCACATGAGATTGTAAAATTAAACATTCAGCTCCATTATACAAACTTTTAGAGGCTTTAGAGTTCATTTAGAGGTTTTAGTTTGTCTAGTCATATATTATTAATGACTTTAAAAAGTTAACATCCACCAGAGTTTCAAGATTTGGTCTGCCAAATCACTTTTTAGG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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00023095 True 8372 lncRNA 0.34 3 37900431 37922022

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_011621 NA non-coding downstream 1000275 38922297 ~ 38929367 (+)

Expression


Co-expression Network