XLOC_011621


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_011621
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 38922297 ~ 38929367 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00024733
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>TCONS_00024732
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00024733 False 7019 lncRNA 0.36 2 38922297 38929367
TCONS_00024732 True 7011 lncRNA 0.36 2 38922297 38929367

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_011620 NA coding upstream 137776 38783161 ~ 38784521 (+)
XLOC_011619 NA coding upstream 139340 38778981 ~ 38782957 (+)
XLOC_011618 GPR68 coding upstream 196763 38724473 ~ 38725534 (+)
XLOC_011616 ccdc88c coding upstream 206052 38602602 ~ 38716245 (+)
XLOC_011617 NA coding upstream 256838 38665041 ~ 38665459 (+)
XLOC_011622 NA coding downstream 255661 39185028 ~ 39188768 (+)
XLOC_011623 zgc:174356 coding downstream 313070 39242437 ~ 39316202 (+)
XLOC_011624 BX469913.1 coding downstream 496725 39426092 ~ 39426212 (+)
XLOC_011625 NA coding downstream 699155 39628522 ~ 39628821 (+)
XLOC_011626 BX469926.2 coding downstream 763215 39692582 ~ 39692696 (+)
XLOC_011609 NA non-coding upstream 669231 38248048 ~ 38253066 (+)
XLOC_011606 NA non-coding upstream 1000275 37900431 ~ 37922022 (+)
XLOC_011629 NA non-coding downstream 836940 39766307 ~ 39784142 (+)

Expression


Co-expression Network