XLOC_011662


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_011662
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 43561404 ~ 43565736 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00024749
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>TCONS_00024748
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>TCONS_00024747
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00024749 False 4239 lncRNA 0.34 2 43561404 43565736
TCONS_00024748 False 4269 lncRNA 0.34 2 43561404 43565736
TCONS_00024747 True 4239 lncRNA 0.34 2 43561404 43565736

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_011661 NA coding upstream 16475 43543883 ~ 43544929 (+)
XLOC_011660 NA coding upstream 22894 43533795 ~ 43538510 (+)
XLOC_011659 NA coding upstream 41104 43519604 ~ 43520300 (+)
XLOC_011658 reep1 coding upstream 57301 43486436 ~ 43504103 (+)
XLOC_011657 chmp3 coding upstream 85124 43468732 ~ 43476280 (+)
XLOC_011663 cfap99 coding downstream 29956 43595692 ~ 43613566 (+)
XLOC_011664 znf365 coding downstream 57862 43623598 ~ 43638693 (+)
XLOC_011665 NA coding downstream 76081 43641817 ~ 43645960 (+)
XLOC_011666 adob coding downstream 94204 43659940 ~ 43661745 (+)
XLOC_011667 FO704777.1 coding downstream 277800 43843536 ~ 43850100 (+)
XLOC_011656 NA non-coding upstream 314329 43243870 ~ 43247075 (+)
XLOC_011652 CR925755.1 non-coding upstream 1059310 42469888 ~ 42502094 (+)
XLOC_011671 BX465227.2 non-coding downstream 376201 43941937 ~ 43942051 (+)
XLOC_011672 NA non-coding downstream 438385 44004121 ~ 44007838 (+)
XLOC_011675 NA non-coding downstream 683714 44249450 ~ 44255927 (+)
XLOC_011676 NA non-coding downstream 692315 44258051 ~ 44262819 (+)

Expression


Co-expression Network