G359178


Basic Information

Item Value
gene id G359178
gene name NA
gene type unknown
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000152
NCBI id null
chromosome length 3381324
location 1337660 ~ 1344005 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU409694
CAATTATTATTATTATTATTGGTGCTCAATTATTAATAATGGTTCTTATTATTATCAATTTTGAAAACAATACTGCTTAATATTTTTGTGTAAAGTACTATGATATATGGTTTTTTTTTAGTGATTTTTTGGTGATTTTTTGGTTAACAGAAAGTTCAAGAAGAACAGCATTTATTTGAATGCTTTCTGAAGGATCATGTGACACCGAAGACTGGAGTAATGATGCTGAAAATTCAGCTTTGCCATCATAGGAATAAATTATATTTCAAAACATTTTAAAATATTAAACAGTTATTTTAAATTGCAATAAGTTTTGCAATATTACTGTTTTACTCTATTTTTCATTTAATAAATGCAGCCTTGGTGAGCATAAGAGACTTCTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAATTATTTCAAACTTTTGATCACCAGTGTGTTTGTTGGTATGTAAAGATTGTGATATGTTGGAACCCCTTGAAGATGTTTATCCCAATAAATAAATTTTTCAAAAAGAGTAACCACTGAGCGCTCCAAGTCTCCTTCAGGGTGTTTATTTGTTATGTTGCTCAGACATCTAATCTGTTGTGACGTTCTTGCTTGCTCTGTTTTGCTTTTGTTTTTTTATATGTTTGCCCTGATGTGTTGTTTGTATGCTTGCATGTATTGTTTTGTACTTGTTTGCTCTGGTCATTTGCGCTGTGTTTGTTTGCTCCGTTGTGTTATGTTGTTGATGGCTCTGATCTGTTGTGTTGGTCTTGCACGGTGTGTTTGCTCTGGTGTATTGTGCTGTCTGTTTTTCATTCTGCAGTGTATGTCAGTTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCAGGGAGTGTCCTATAGATACCAATTACATCCACTCAGGAAAAGACATAGCGAAAAAGAAGGAGGGATGGAGCAGAATGAGTGGGAGGGAATAGGACAGCGAATGCACAGGAGGGAGAACGAGTGAGAGAGAGGGAAGACGGCAGACAGACAGAGAGAAATTGGAGGAGAGAGATTCCGTCTGTGAGTGTAATAGTCTCCTGCTGTCAGACTCTGGGGAATGAAAGAGAGAAAGAATGAAGGAGAGAAATGGGAGGGAGATCATGGAGAAGAAAGGATGTATAGTGACAGAACTGAGGAAAAGAGAGAGCAAGAGAGGCTGCATGCACAGTGCATAAAAGACTAAAGTGAAGAACTGAAGGGGAGAAACAGTAGAGAGCTGTTTGAAAAGAAGGGGATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTTGCTGAGGAGAGAAGTGTATCTCTCCATTTAAAGTCTGATCACAGTGAAGTGTGGTCTTCACAATGCAGCGCACTCAATATTTAATACTAGCTTGAGTGTAGGTTCCTGTTCTATATATATATGTGTGTGTGTTTAGGATTTGAATGTGCGTGTGTATGTAAATGCTATCATTTATGAATGAATATGAGGAACGTACTATCTAATAATGCAGTGTGTGTTTGTGCAAGTGTGCTGTTATGTGGCATGGGACAGTGTGTGTTGTTGTGCACCCTACATTTGAGTCTTTTCTGTATGTGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGGTAATTATGAGAGAGGGCCTGCTTACAGTGAATGCTGCTGTGGTCTATTGTGTGTGTGTGTTCGGTTGAGAGCAGAGGGAGTCTTTGTGCTGCCGTCCGAAATAATTCCCATCATACTTCAGTTCTCAGAGAACAAAATAACTGAAAAAAGAGAGAGAGAGAGTATATTGATGTTACTTCTCATCTTCCAACTTTTCTGTCAACAGCAAACTTTGGAACACACACACACACACACACACACAATTATCAAGATAAATGAGGACATACTAGACTTCTGTTGTTTTTATTTAATACTGATTGGTGTAGGCGGCATGCAATCTAATATCACATGAGTAATTTTACCGTAATGGTATATATCACAATCTAGTTGTTTTGCTGCAAATTAAATTACAAAAGGTTTTTTATGTTACGTAACAATGCAGTAATGTCTGTTTTTAATAAGCTAGTGACTTAAATGCTTTAAAAATGAAAGGGACTTAATCTCTTTTTATTATATTGTTTTTTTTTTTTGTAACTTAATGGGCTCAAACTTAAAGATCAGATTATTCAAGTCTGGCATCAGTACAGAAACAGCTTTGTGTTATGTAACAGAGTTTAAAACAAAAGACTCAAAATAGTATTACGTTATAAATACTGTATGTACGGATGAGCCACTTTATCATAGAAACTTTAGTATGTACAGTATAAATTTATATATACACTATTATTTTTTGTTAATTAAATAGATCTAAAAATATATCATAATAAAATAATAATTATTATAATTATAATATATATATTATTTGTATTTATTCATATATATATATATTCACTTTTTTAAAGGGGTGGTTGATTATGATTTCACTTTTTTAACTTTATTTAGTGTGCAATGTTGCTGTTAGAGTTACGACACTCAAAGTTCACTGCAAACGGAGATATTTTCTTTTAAAGAATTCTCTAAGGACTACAACAAACGGCTGGTAGGGACTACATTGAGCTTCTTCCTGGGTTGGTGACATCACTAAGCCTAAAATTTACATAAACCCTGTCCCCGAGAACACGCAACAAAGGGGTGAGGCCATGTTATTGCAATACAGTATGTAACACAAATGCAATGTCATATGCATGTCATAAAAGCAAGATGACAACATAAGTTATAACCGTAATTAAACTAAACTATACCTGTTCTATCTTCATGCAGCATATATTCTCTGGCTCTGTAGGATCTTACAACAGTTCCCACACGAGCGATATATAGATTATCATGACAGAATATGCTAATCAATGACTTTAAGATAGTTAACTCCACATCAGCTACATAAATTCATCAACTAACCATTCAGAAACATGCTGTTGCATTCCACATGTTGTCACTTCTTCTTGAGTCTCTCTATCACTGTCCGACTCCAGTTTGAACATAAAAGGCTGAACAGTTTCTGACATTTTCAGTGAGTCTGAGGTAATCGGAGCTGCTAACATGAGCTCTTGAAACTCCACCCTCATTTAAAGGGACACACACAAAAACAGAGCGTTTTTGCTCACCCTCAAGAAATGACAAATTTAACATGCTATAAAAAATTATCTGTGAGGTATTTTGAGCTAAAACTTTACATACACACTCTGGGGACATCAGAGACTTATTTTACTTCTTGTAAAAGTGGCATTATGTGACCCCTTTAAGTAAAAGGCTGTCAGGATATGCAACAGATGTCTTATCAAGTAGATGTTTTATATGTGTTTTTGAGTTCAATCGCTCAAACCAAAGCATCAGTGAGGGTCAGACTACTTTTTATTTTTTTATTTTTTTGCCAAAGCCAGTTTTTACTAACATTTGGCACCTGGCCAGTGTTCATTTTGAAGCCCGCCTACCCTTAAAGAAATGTTTTTACATTTTAAAGTATAACAAACATTATTTATTATTTATTTTCACCTTTGAGGACATCCCCATAGGGAGGTTCTGTCAGGTTTAGCTAGCTTCTGTATGTATTTTTGTCCCTGAAGTATAGCTAAGTAAACACACACATTAATACACACAGCATATATACATTACCATCTACCAGTGATGCTTTTTTAATTTTGATGTGCTGTTTTATTCTCCTTCCTCAGTTCTGTCTTTTCCTTAAAACTAAGGGAAGCAAAACAAATAAACAGAAAACGGGTTTTTTCGTGTATGTGGGTTGAGGTCGCTTTGTCTTGAGGGTCAAGCTTCAGGTCATAGCGGTTGCCCCTGGTAACCTCCCCATCTGGTTGCATAGCAACCTGTCTCCTTTGTTCTAAAATGATTTAATTTATGGTTTATCTTCTTTACCCCCCTTCCTTCTTCTTTCACCTCTCACTGTCACTCCCTCTATCTGTCTCTATATCTCTCTTTCTCCCTCAGGACCCTGTTCTCTCCTCTCTTTGCTTCTATCCATCACAAGGCTCTCCGAGGCTCCTGGCGTCTGTCGGTGTGTGTATGTGTGTGTATGAGAGCGAGAGATAGACGGATAGTGAGCGAGAAAGTGCTCGAAGTTGAGTCTATACTGCTGTGTTTGTTAGTCGTGCGAGTATGTTTTTGGTGGCGTTGTGGTGGCTGAGGTCACCGTGTGTCTGTTTGCTTGATAAAGAGATCTCATATCTCCACCTCCTTGTAATTGACCTCTTATTTCTCAAAGTGCTTTATTGGCTGCAATTCGCTCAATACCTGCCAAAGCACTAAGTGCTCTTTTTCATTGGCTGCATCTCAAAAGCTAGTGAGCTGCCTAGACAGCGTTTTTGGGAATCATAGGCGTGTCCAAATGTTGAGCATCATAGGCTTGTCTGAATGTTTGACAGCAACTTAGTGAGCTGGCTACCTAGACAGCACTTTTGGGCATCATAGGTGTGTTTGAATGTTTAAACTGAACCTATAAAAATGAAAGCATAGTGAGCTACCTACCCTAGATTGCATTTTTGGGAATTATACTAGTGTAAGCATGTCTGAATGTATTTTAGATGAGTGTTGTCACGATACAGGAATTTCTAACTTTGAAACGATACCTTGAAAAGTATCGATATTCGATACCATTTTCGATACCACTAGGGAAAAAACATTGCATATTCTGTATAGATATAGATATTTTTAATATTATTTATGTTTTGTCCATCCATTGAAAGTCTAGAAAATAAAAAAGAATCATGAGAATTGAATCTAGACAGCACTTTTGTGTATCATAAGTTTCCATCCACCTATTTTTATGCGCATATTGTGATATGAGTGTAATAAAAAAAAATGCTAGATGGAAGAGCAAAGATGCGCAGACATTTTAAAAATGTGCATAAAAAACATATGCGCTTGATTGAATCGGATACATTTTTTATTTGATAAGAAAACGTGCATAAACAATTATGGAAACACATTTACCGAATAAATTCCTTGATGCGTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU409694 True 6304 TUCP 0.36 2 1337660 1344005

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000152_01296980_01330911 CADM3 coding downstream 6749 1296690 ~ 1330911 (-)
CI01000152_01241584_01266061 KIRRELB coding downstream 71599 1241150 ~ 1266061 (-)
CI01000152_01140574_01151786 NA coding downstream 184903 1140213 ~ 1152870 (-)
CI01000152_01000620_01011373 NA coding downstream 326287 1000399 ~ 1011373 (-)
CI01000152_00998440_00998727 NA coding downstream 338813 998269 ~ 998847 (-)
CI01000152_01375796_01378931 SDHC coding upstream 31438 1375443 ~ 1380019 (-)
CI01000152_01380778_01397434 ATP1A2A coding upstream 36135 1380140 ~ 1397434 (-)
CI01000152_01415414_01419131 MYP0, MPZ coding upstream 71305 1415310 ~ 1420063 (-)
CI01000152_01429044_01451054 LIG1 coding upstream 84860 1428865 ~ 1451054 (-)
CI01000152_01545763_01547190 NA coding upstream 201329 1545334 ~ 1547190 (-)
G359124 NA non-coding downstream 47587 1287518 ~ 1290073 (-)
G359126 NA non-coding downstream 152327 1184246 ~ 1185333 (-)
G359080 NA non-coding downstream 219154 1024434 ~ 1118506 (-)
G359139 NA non-coding downstream 228948 1108159 ~ 1108712 (-)
G359194 NA non-coding upstream 120073 1464078 ~ 1464328 (-)
G359198 NA non-coding upstream 122701 1466706 ~ 1467174 (-)
G359199 NA non-coding upstream 125240 1469245 ~ 1471571 (-)
G359200 NA non-coding upstream 127756 1471761 ~ 1471961 (-)
G359202 NA non-coding upstream 128294 1472299 ~ 1535242 (-)
CI01000152_00562189_00571618 CREMA other downstream 772376 560484 ~ 572648 (-)
CI01000152_01892421_01893463 CAMK2N2, CAMK2N1A other upstream 546853 1890149 ~ 1893866 (-)
CI01000152_02015257_02024292 CAPN10 other upstream 677534 2015257 ~ 2024292 (-)
G359788 NA other upstream 974263 2318268 ~ 2318734 (-)
G359800 NA other upstream 1024987 2368992 ~ 2459836 (-)

Expression


Co-expression Network