XLOC_011734


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_011734
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 49414820 ~ 49421370 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00024768
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>TCONS_00024769
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00024768 False 6335 lncRNA 0.41 2 49414820 49421370
TCONS_00024769 True 5508 lncRNA 0.42 2 49415044 49421370

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_011733 zgc:113176 coding upstream 108134 49276061 ~ 49306686 (+)
XLOC_011732 tiam2a coding upstream 196318 49081828 ~ 49218502 (+)
XLOC_011731 CABZ01088109.1 coding upstream 395169 48964632 ~ 49019651 (+)
XLOC_011730 hs1bp3 coding upstream 453122 48947762 ~ 48961698 (+)
XLOC_011729 NA coding upstream 510798 48897360 ~ 48904022 (+)
XLOC_011735 CGA coding downstream 30662 49452032 ~ 49452502 (+)
XLOC_011736 AREL1 coding downstream 63270 49484640 ~ 49530045 (+)
XLOC_011737 LO018408.2 coding downstream 89496 49510866 ~ 49511000 (+)
XLOC_011738 NA coding downstream 130523 49551893 ~ 49553677 (+)
XLOC_011739 CU929037.2 coding downstream 175742 49597112 ~ 49601114 (+)
XLOC_011727 NA non-coding upstream 753176 48661290 ~ 48661644 (+)
XLOC_011726 NA non-coding upstream 756658 48657825 ~ 48658162 (+)
XLOC_011725 NA non-coding upstream 795636 48616823 ~ 48619184 (+)
XLOC_011742 CU655820.1 non-coding downstream 700873 50122243 ~ 50190705 (+)
XLOC_011747 NA non-coding downstream 1004234 50425604 ~ 50426685 (+)

Expression


Co-expression Network