G363972


Basic Information

Item Value
gene id G363972
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000158
NCBI id null
chromosome length 1938735
location 1204852 ~ 1214069 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU415148
TTGGAAATTAACATTTATTAATATGTTTAATAAATGAACAAGTTAAATAAAAAATAAAAAAATACACATATATTAAATTGCTTATTAATAAATGTTCACCTTTTGATTATTATTGTTGCCTCTAGTAATTATATGTCTGATTTTTAATTTCCAACCTATTTTGGGTTAATTTTAAGCCAGCCATATGGTCATTTTTAAACAATAGGTGAGTTAAATGAAACTGCACAGTACGTTGGGCAAAGATTTAACCCAACCACTGTGTTAAAACGACCCAATCGCTGGGTCTGTCCATTTTCAACCCAACTTGGGTTATTTTTTTAAAGTGTACCTGTTTCTGTGCGTCAAAAAGAATACAATATTGGAGTATTCGTTTGGTCACGGTGATGGCTAGTAGTGTACACTGATAGTTTTTTGTTTTTGGTGCCAGAAAAAGTTAAAGAGTGGGGGAGGGGTGAAGATGATGAACACTGCCCCAGAAAATATTATTTCGTTCGTGCTGACATTTTATTGAGTTGACATTTATCTCGGAGTTGTTTTTTAATAATTAAGATCTTTAACATATTGTGTTGATTTGGCTATTTCTCCACATGAATGCCAGTTTTGTCTCCTGAAATCACTGTGATTTGAATGACAATTTATTTGTTACCTGTCAGAATACGCAACTCAAATGAAAGGTTTGCTTTGGTATGGAGATTTTCACTTAACGTCTCTGGACAAGCAGGCCCGGTTCTATGGAAAGCAAGAGCACCTTTAGTTGAAACCAGGGTCGTAACCACCATATACATTGAGGGGAACCCAATAATTTGAAATGGCCAAATTGTGCCCCCAGTATTTTATATTCTTGATGCTGCTCTGCTGTACTCCATTATGCATCGCTCTGTTTGTTGTTAGGATGACAAAAAAAGTTTTAAAAGTTACATTTTTAGGCTGGTCTGCCTCAGCCGTCTAACAGCGCTCATCACTGTCAGAATGAGTGAGCTGGCCAATCAAATCAAAGAAGGCGGGGCTTACTGTTCACAGAAGATCAGTGCGAATTACAATGAGACGCTTTCGTTTTAGCAGTGAAAGAGTATGTGGTGAGTAAGTAGCTAAACATTTAATATTTGACGACTGTTTTGATTGAAATATTGAGCGACCGATAGTAGCTAATATCCAGTGATACAAACTACTCAACATTTTTATGTTTATTAACTACAATTTAACTACAGTGTAACTACAATTTAACTACCCCCATCCAACCGCCCCACCCCACCCCCGCTCCACTGCGTATTTGTGTTTGCGCTCTTGAAAGGTTCTATTTATGTGTTTTTGCAGTGTTGAGCAATGTATCACAGACATCTCTTGAATGCAATGGCCAATCAGAGGTGTTAAATGTAGTCAGAATCCACTCAGCACTCAAAACTCCAGATTTTTTTTTTTTTTGACTCTGAGTTCTGCATGCTCTTGAATCCCCTCATTATAACAAAGTGCAGACACGGTGTAAATAAGAGATTCATTATGCAGTTTAGATTATAATATGATTACTTCAATCATATTTACTTTATATGATTACTTCGTGAGATCGCGATGAACTGAGGTGAATGACAGCTCTTTGGTGATTATAAAGAGAGCGCTCTTTGTGTGCATTCTGGGCTATAGCAGGCTGTTGCAATTATTTGTAAAAGTAATAACCTGTTAAATCTTGTAAATATCTCACTGTACATTGCTATTATTGCTATGGTGGTGCTCAGGAGCCATTGCTTACACATTACTTCTGCACTTTACTAGAGCATCCTCACTAATTTTAGAAGCACCTTCAGTGATTTGATAATGGAACCGGGTCTGTGGACAAGACAACTGCATTCTTCTTCCGACACTCCAGTTATACTGCAGAGCGACAGCCTGCGCTCCAGTCTGTGGACCCAATCGAGTTAAGATGAACTTTTATTATGAGCCGACAGGGATGTTGATTAAGTTGACACCCTTCCATAAACCAAAACCTTTAATTGTTTGTGCATTACATAAATATGTGAGCTGTGAGACTGGTCAACTTTGGGGTGGCAAAACTAATTTTTAGGGTGGCAGCTGCCACCCTTGTGGCCACACCCCTGAGTTTCTGTTAATTTCCGTTGTTTTCTTTGAAATTTTGGGGGTTTGCCACTTTTATTTACAGCGAGAGTGTAGAATAGACAGAAAGAAGAGAGGGAGAGAAGAAAGGAAAGAAGGAATGAATGGGAACATGAACACATAGACTCAAACCCACATCTCCCACATCAGGACACGTGCACTAACAGCTGTACCATGGCTCCTACATTGTCTTTCTTTTTGGTTGATCTTAATCTCATACGTAAAATCCAAGTATGAAATTTGCATAGATACAGTAGGGCTCCCACAGTCAGAGAAATCCTGGAATCGGGGTGATTTCCAGGCCTAGAAAACTTGTGAATATTAATTAAATCTTAAAATGTCTTGGAAATTTTTGTAAGAAATATCAATTTATCTAGTTATTCTAAGATCTATAATATATTTAATTGTCTAGAAATTGTTATTTGTACTTTTTATTTTAAAAATCCTTATCCAAATTTAATTTTTCCTTTTTTTTTTAAAATCCAGTAATGAAAAACTACTTGGAAATTTAATTGGTCAAAAAGTGTGGGAAACTTATATGATCATCGTGTTATGAATGAACGCAATAGTATGTGTTCTTTTTTTATGAATGTTCATTCATTTTATGCATTGGCTGAAAGTGTGGGAATGGAAAGATAAAATCCCTATGGAAGCTTGACTCATATGTGATTTTCATGGCCTATTCAGTGTGAATGAAAAGCTTTACCCATAATACACGTATCAAACCAGTGTTTAGTAGTAGACAGACTGTATTTAGTGTATTGTTTTCAGACATCACAAGCTGGTTTAAATCGTGTGATAAAAATATGTCTTTTTGGAAAGTGATGTCAGATCAAGTGACAAAATAAGCTTTTGACACAATGTTTTATTTGATAGGAAGTGCAGAATCAGTCAGTTCTGCTTTAACACTTAAACTGTTTGAATTTGACAACCGCTAGACTGTATGGTGTTGTAGCACCGGCAGGTTTTAAAGAGGTGACGGCTTTGAGAAGATCACAGAACCTTTTATCTCTCCTCTTGAAAGAAAAGTGGACAAGTGGTTAACTGTCAAGGAGGATGGTTTGTGTGATATGAGGGAGAAAAAAAAGGAAAAACTTTAAAGCTGATGTCATAATGGCTTGGAAAGCTTGCATAGCACAAAATTAGTCTGTTCCATTGTTGATGAAAGTTATAGGCTGCATTTTTAGTTTGGTGATAACCATAACCATAACCTTCCCAATGAACATATTTAAGCAAGAAACATACCATGTGAAAGCTTCTATCTGCGCAAGCTCAATTTCACATTTGCGTTTTCATTGCTGCAACAGGCACTATAGCTAGCATTAGCATAAATTGTCTTCTTATATGGTTTGCTTTCTCTTCCATGTCAAGTACTATGATGGCAAAGCAACAATTAGGGTAAGATAATATTGTGGATAGCCTCCTTGTTAGCGCGCCTGCCTCCCATGCTGGAGACCCGGGTTTGAGGCCCGCACAGAGTGGGGCGAGTAGGAACTGAGGGATTACATTGGGCAAGTTAAAGTTAGTTAAACTGTCGAAGTTTAAAACCAACTACTTAAGTCTAATGACAGACATTTGAAGGTAACGAAAAACTTTTTATTTATTAACAAAAAGTTATTTGCATATTTTAGAACTGTTTATGGTCACTAAATAGCTTTTCTGAGGTAAATATGACGTTATATATGTGACATAAGCTGTTTTATTGACGTCTTTCCGTGGTTGAAACTGAGCGATTACATGAGACATAATATGGATTTTGTAAGTTGTACTGTATCTTTTAACATACCTTCTGATGTTCGTTCTTGTTTATTTCCTGCTGTAACTAGTAGTAAAGCGGAAGAGATGATCTGTTCATGTGCCGCTTCACACTGCCACTTTGCTTAACTGAGGTGCTACAGCGATCTGTCATGCCACATTAAAAAGTGCCAAAACTGTATTTTTGTAATAAAATGGACAGAATGTGAAATTTGAGACTGTTTCATATCAGAAGTAACAAAGCTCAAAGGTTATTGCAATGTTTTGGATGGGAGGCACGCTACAATGTTCTGATCATTCATCAACTGAAAGTGAAAGTGACTAGTGTAGCCAAGTATGGTGGCTCAGAATTTGTGGTCTGTGTTTCACCCATCCAATTGCACACACACAGCAGTGAGTATTGAACACACACACACTGTGAACACACACCCGGAGCAGTGGGCAGCCATTTTTGCTGCAGCGCCCAGGGAGTGATTGGGGGTTAGATGCCTTGCTCAAGGGCACCTCAGTTGTGGGTAATGAGAGTGGAAGAGAGCACTTGTTCATTCACTTCCCCAACCTTCATTTCCTGTCAGTACTGAGACTCGAACCTGTGAACTTCGGGTTACAAGTCAGACTCTCTAACCATTAAGCCACAACTGCCCTGAAAACAGCGTGGAATAAATCTTGGGATTTAAGAATCAATACTGGTTCATAAAAATGAGAATCAATTAAAATCAAGAAATTTGATTTTTTTTACCCAGCCCTATTTATGGCTGTCTTATTTTCTTCATTTTCAAACATTAAACCATCAATCTTTTATTGTGACCTTTAAAGCTTGACAATAAAAGAGAGGATTATAAGCCCTTACATTTTGGGAAGATGGTTGGTGAATGTTGCATTCCCAAATGCATGTTAGTGACCCAAATTTGCAACACATACAGACATAAGTTTCCGAGACACTGAAAACACTGGATCATGAGCCGCTCGCAGTGCCGTGCTTCACTCTGAAACGCACAGCACACGTTTAATTAAATCACAGCCATATCACGATTTCTGTTTTATTTCTATTCATGTTGCGGCCTCAGAAATGTTATGCTGTGCAGCGTTTGCCTTTGCAGTCTTTGAAGCTGTGAGCTTCTGGAAACATACAGGTGTGT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU415148 True 9085 lncRNA 0.37 2 1204852 1214069

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000158_01192157_01194797 SSBP3, SSBP2 coding downstream 10055 1192144 ~ 1194797 (-)
CI01000158_01116779_01131501 ACOT12 coding downstream 73175 1116728 ~ 1131677 (-)
CI01000158_01106641_01108816 NA coding downstream 96036 1106562 ~ 1108816 (-)
CI01000158_01103049_01104386 NA coding downstream 100378 1102796 ~ 1104474 (-)
CI01000158_01023714_01028130 WDR45 coding downstream 176698 1023346 ~ 1028154 (-)
CI01000158_01247736_01251443 NA coding upstream 33490 1247559 ~ 1251458 (-)
CI01000158_01262724_01264911 NA coding upstream 47936 1262005 ~ 1264911 (-)
CI01000158_01339302_01340074 HAPLN1B, HAPLN1 coding upstream 125167 1339236 ~ 1340074 (-)
CI01000158_01341073_01343685 NA coding upstream 127004 1341073 ~ 1344035 (-)
CI01000158_01366017_01386733 EDIL3B coding upstream 151391 1365460 ~ 1386733 (-)
G364030 NA non-coding downstream 161596 1043002 ~ 1043256 (-)
G363963 NA non-coding downstream 208771 995019 ~ 996081 (-)
G364015 NA non-coding downstream 225284 979337 ~ 979568 (-)
G364011 NA non-coding downstream 236203 968428 ~ 968649 (-)
G364010 NA non-coding downstream 237795 966820 ~ 967057 (-)
G364076 NA non-coding upstream 39978 1254047 ~ 1335935 (-)
G364116 NA non-coding upstream 144087 1358156 ~ 1437480 (-)
G364115 NA non-coding upstream 144394 1358463 ~ 1434166 (-)
G364112 NA non-coding upstream 211954 1426023 ~ 1447805 (-)
CI01000158_00717478_00721819 STAMBPA, STAMBP other downstream 482340 717291 ~ 722084 (-)
CI01000158_00286848_00307666 NA other downstream 889463 286545 ~ 307666 (-)
G364103 NA other upstream 242065 1452257 ~ 1501547 (-)
G364203 NA other upstream 473897 1687966 ~ 1688828 (-)

Expression


Co-expression Network