XLOC_012203 (BX571712.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_012203
gene name BX571712.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 31181950 ~ 31185243 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00024041
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>TCONS_00024044
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>TCONS_00024043
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>TCONS_00024042
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Function

GO:

id name namespace
GO:0042982 amyloid precursor protein metabolic process biological_process
GO:0042983 amyloid precursor protein biosynthetic process biological_process
GO:0042984 regulation of amyloid precursor protein biosynthetic process biological_process
GO:0042985 negative regulation of amyloid precursor protein biosynthetic process biological_process
GO:1903018 regulation of glycoprotein metabolic process biological_process
GO:1903019 negative regulation of glycoprotein metabolic process biological_process
GO:0010559 regulation of glycoprotein biosynthetic process biological_process
GO:0010561 negative regulation of glycoprotein biosynthetic process biological_process

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000097985

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00024041 False 154 lncRNA 0.37 2 31181950 31183876
TCONS_00024044 False 2508 lncRNA 0.35 2 31182644 31185243
TCONS_00024043 False 2099 lncRNA 0.36 3 31182644 31185243
TCONS_00024042 True 2168 lncRNA 0.37 3 31182644 31185243

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_012202 pkdccb coding downstream 17731 31151215 ~ 31164219 (-)
XLOC_012201 BX571712.1 coding downstream 84409 31096326 ~ 31097541 (-)
XLOC_012200 eml1 coding downstream 99569 30976484 ~ 31082381 (-)
XLOC_012199 evla coding downstream 205972 30897292 ~ 30975978 (-)
XLOC_012198 yy1a coding downstream 318698 30857008 ~ 30863252 (-)
XLOC_012204 rpusd2 coding upstream 19821 31205064 ~ 31212420 (-)
XLOC_012205 pcmtl coding upstream 28924 31214167 ~ 31221774 (-)
XLOC_012206 bahd1 coding upstream 91194 31276437 ~ 31344400 (-)
XLOC_012207 ivd coding upstream 161317 31346560 ~ 31360956 (-)
XLOC_012208 BX539317.1 coding upstream 199191 31384434 ~ 31384548 (-)
XLOC_012193 NA non-coding downstream 588892 30573572 ~ 30593058 (-)
XLOC_012190 NA non-coding downstream 772191 30398949 ~ 30409759 (-)
XLOC_012189 NA non-coding downstream 812425 30306215 ~ 30369525 (-)
XLOC_012188 NA non-coding downstream 901237 30278131 ~ 30280713 (-)
XLOC_012218 NA non-coding upstream 942654 32127897 ~ 32136128 (-)
XLOC_012219 CR407546.1 non-coding upstream 1060886 32246129 ~ 32246255 (-)
XLOC_012228 NA non-coding upstream 1948576 33133819 ~ 33138376 (-)
XLOC_012229 NA non-coding upstream 1960351 33145594 ~ 33162478 (-)

Expression


Co-expression Network