G418590



Basic Information


Item Value
gene id G418590
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 963739 ~ 1020047 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU480823
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Function


NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU480823 True 12779 lncRNA 0.39 2 963739 1020047

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_00877256_00878179 PURG coding downstream 85560 876134 ~ 878179 (-)
CI01000304_00862451_00870277 NA coding downstream 91310 862153 ~ 872429 (-)
CI01000304_00852998_00861119 PPP2CA, PPP2CB, CDKL3 coding downstream 102372 852946 ~ 861367 (-)
CI01000304_00843412_00844705 HINT1 coding downstream 119034 843295 ~ 844705 (-)
CI01000304_00748608_00750261 NA coding downstream 212207 748315 ~ 751532 (-)
CI01000304_01030191_01033191 FUT10 coding upstream 9125 1029172 ~ 1033191 (-)
CI01000304_01054942_01133130 NA coding upstream 34895 1054942 ~ 1133130 (-)
CI01000304_01186035_01200177 SLC38A9 coding upstream 165814 1185861 ~ 1200808 (-)
CI01000304_01216763_01232729 DDX4, VAS coding upstream 196669 1216716 ~ 1232729 (-)
CI01000304_01365055_01365447 NA coding upstream 344754 1364801 ~ 1365559 (-)
G418601 NA non-coding downstream 12617 950880 ~ 951122 (-)
G418598 NA non-coding downstream 29375 934135 ~ 934364 (-)
G418584 NA non-coding downstream 36956 926504 ~ 926783 (-)
G418576 NA non-coding downstream 47161 909640 ~ 916578 (-)
G418573 NA non-coding downstream 57885 902842 ~ 905854 (-)
G418629 NA non-coding upstream 610 1020657 ~ 1020941 (-)
G418593 NA non-coding upstream 152151 1172198 ~ 1172813 (-)
G418595 NA non-coding upstream 153134 1173181 ~ 1175223 (-)
G418647 NA non-coding upstream 155720 1175767 ~ 1176008 (-)
G418594 NA non-coding upstream 157734 1177781 ~ 1178694 (-)
G419353 NA other upstream 1209337 2229384 ~ 2236106 (-)
G419354 NA other upstream 1242455 2262502 ~ 2266241 (-)
CI01000304_04263955_04264962 NA other upstream 3243698 4263846 ~ 4265201 (-)
CI01000304_04661808_04672936 PPWD1 other upstream 3641769 4661766 ~ 4672947 (-)
CI01000304_06480836_06483554 SUB1L2, SUB1A, SUB1 other upstream 5457404 6480743 ~ 6483986 (-)

Expression



Co-expression Network