G424547


Basic Information

Item Value
gene id G424547
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 10532246 ~ 10543770 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU487539
CTTCACTGTGCTTACTGCAACACCTGTGTAAGGATAATGACACAGAAGAGAAGATCTTTTATGAATAAAGTCGTTATTTCTGTTTTGTTTTTGCACACAAAAAGTATTCTCTGCAGTCACGTCAACAGTTTTAACAATGTCTTTAGTACCTTTCTAGACCTTGAAAGTGTTGGTTAAATTGCTGTCTATGGACGAATCATACACCTCTTGGATTTCATCAAAAATATCTTAATTTGTGTTGAACCTTCATTCATCTTCAGAACACAAATTAAGATATTTTTGATGAAATCCGAGAGGTATGTGACTGGTCCAACTGCTTACGGGTGTGGAACGACAGGAGGGCAAGTAATTAATGACAGAATTTTCATTTTTTTGTGAACTAATCCATTAAGGTTGAATTTCTTTAATGCAATCTACTTGAATAACTCATGTAAAATCTCCTAAATTATTTAGTCTATGACTCAATTAATTTAATATTTTTAGTGAAATGTGCTTTTTTATTTTAAGTTGACTCTCAAAAGTGTGTGATTTAGAGTGAATAGAAATGACATGTATATATTTGACTTTGAATTATGTTGTACAATTAAAAGACTGTATGCTGATAGTATAGCATAAGTAAGAACAAACTTGTTACTGCACCGGCAATAGCAAACTTATTGCTCACTGAACAAAGCATCATGCTTCATATTATTAGTACATGCAGTTATTCACAACCTAACCATAAGCTCTGCTCTTGTGCACAATGGTAATGATCAAAACTTCAACATTTAGTCATTAAGCAGACGCTTTTATTTAAAGCGACTTACAAATGAGAATAGTAGAAGCAATCAAATCAACATGAGTGCAACAGTACGCAAGTGCCGTGTCCCAGTCCCAGTGTGGATAGGGTCAAGCGGACAGGTAGTAGGGTGACTGGAAAGGATGAGTTTGGAAACATCTGCCTCCAAGAGCAAAGAGAAGGAAGGGAGAGCATGTGTGTTTTCCGTTAAGATGTGATTGTCAGTATGTGGTGTGGAGAATTGGCCGCTGATAGTTGTTATTTTATGTGTGAAGAATGTGGCAAAGTCATCAGCTGTAATTGATGTAGGAGCGAGGGGAGGAGGGCAAAGAAGACCAGAGAAGGTTTTGAAAAGTGTGCGGAAATCAGTAGAATTGTTAATTTTATCGTGATAGTATGTGGTTTTAGCATTTGAGACAAGTGTAGAGAAAGAAGAGAGGAGTGACTGATATAAGCTAAGGTCAGTAGGATCTTTAGATTTGCGCCAACTCCTCTTTGCAGCCCTGAGTCTAGACCGATGCTCAACATAACAGAAACTTTCAAATATCAAACATAACTGAACATTAAACATTAACAGATATTTCCCTTCACTCAAAAACACATAAAATAACTAAGGCTGGGAAGCGATAAAAAATTATAATCTAATTAATTACATGATGTGGCGATTAATTAATCTAATTGATTGCAAATTTATCGTACATCAAATTTGGCTGATAAATTATCCCCAAAAGATAATTTGAAGTCATTTGTCTAAAGCATCAAATAGACATTACAAAAAGTATATTCAGAAAGAAATATTTTATTTGATTCAACATAGAATTTATTACACAATCTTTTGGACCACGAGGATGAGTAAATGATGACTGAATTTTAATTTTTGGGTGAACTAAATCTTTTTTTATTATTATTATTATTATTTTGATTATCAATATGGAAATATGAAATTGAAAGGAAACATATGGTCAACTGATGTTTTATGAATTATTTTCTTAGAGAAGTTAATTTACTGAAGGCTACCAAGAAAGCTAGGTTACTAAGTTTATTAAATGAATTCACAATATGTGCACATTTATTATTAATGTGGGGGGGTGACACGTCATGCAGGCACAATAGCTGTATGACAGATGTATCACTTTTATTTTGTTTTTGTTTTTTTTATTTAAAATATTCACAAACTTGTTGACTATAGCCTATCATGACCTATAGGCTATATAGGTGTTGAGCACCCAGGGAAAAATATGAGATATTCTCTATTATTTTAAACAATAAAAAATGACTGCAGCTTTCAGACGTGACGTTCTTTTCCTTTTTTAACGTGAAAGCGCTTTAACCCTTTCAAGCGTGAGTTTAAAATATTCTAACTGACCCCCCAGAGTGAGTTTTTTTTAAGGCGACCGTTATTTTAGAACGTTTGCCCTTATCATTTCCATGGCGACGCGTCTTGCGTGTCGCGAACGCTGAACGCAGCCACAATAACACTGTATGACAGATGGATCGCTATTATTTTGTTTTTCCTTTTTTATTTAAAATATTCACAAACTTGCTTACCATGTCATCAACCATATGATATTCCGATTCTCAAATATGTGTAAGTAAGTGTGTTCTGTCGTTTAAAAACCTTTATAAACGATCTTTATCTTGATCTATAATGCGAGATGGGCGCCGCCATCTTAGTTTGCGCTGCAGTTCACAGAGTCCTGTCAGTCAGATTTACAGCATGTGAATTCATCAGTTTCTCCCGAAATATATGCAAGTAAGTGGCTGGTGAACTGGAAGAATAATAGAGTAAACTTTATAGTTACTTAGGCCCATTATGTGTGTCTGATTTGAATAAATGTCGGCAAATTATACTTGAATGGATTGTTATTACTGCTTCCACTGATGTCTGACATCAGTGTGTATTTTATAAACTCTAAATGTATTGTTTTAATGGTGCTTATGCGTATTTAAATGTCTGAAACCTTAAAAGAAGCATTATGTGGCTGAAAACACTGCATAGCTTTGGTATATGACAAGAGCTGCGCGCGTCCGTCTCACAGCCAAAGCGCGAAAGAACAGTTTGAATCTCGCAGTTATGTGACGTCACTGAACGTTCGAAATCCCATATGTGGGACCGTACCGCTCAAAGGGTTAATGTAATGTGCAGAACGAATCAATCACTTATGGACGGTTCGGCTGTGGGCACCAACCGACAGAAACATAAAACGGCGCTTAATATTTGAATGTGATTTGTCATTTAAATCACATCAGTTGATCTATAACGTGCGATGGGTGCTGCCACCACAGCGAAAGCATGTTTGAATTTAGCAGTGAATGCTCTGATCTTACCGGTGTTGTAGTACACTTCAAAGGGTTCAAATCTATCACCTTTCATATCTTTATCGAACTGCATTCTATAGGCTTTATCACACAGTGAGATGTTGTAGTCGTCTGTTTGTTTTATTCATGTTTAATCAATCAAAGCGTTTCTACCTTATTTTTATTCAGTCACAGCGGTAGCTTGATGCCCATTGGGGATTTCCTGGAACAGCGTTTGTTATATTGAGTATTTGGAGTATCTGCTCAAGGGCGCCCTCCGGCGTCCAGTATGAAACAGACATGTTTTGGGCCAAGTAAAGCTCACTCAATCCTATTCAGGGTAAAAATAGGAAAAATAATTCCTCTCTCTAAAGAACATTGAGGGGAACATATAATCAATACGTTTTTCTCCAGCGTACATAAGTGTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCACAGTGGATGCATATGAGGCACGTAGTTCATATTAAATACATGGACTCCATTTTTGATTTTGCATACCTACTGACAAAAAATAAAAAAATTATTGAGACAGATTTTTATCATAATAATATAATATTTGATAATAAATCCTTAGACCTTTCTAATGATTTATAGACATACTGCTTGCATGTTAACAGTTAACCCCACATTTTGTCATACAAGTTTTAAATATTTTCTAATTATTATAGTTATATGTATAATTAAATACTATTGCTAAATACTTTAATAATGAAAGTTATTACAACAGTAATATTTCTTATTTGGTTTAATATTTTTATTTAGCAATAATGATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATTAGTCAAAATAATATATTAGCACAAAATTTCGGGCCAAATTGTGCAGCCCTACAAACAAGCAAAACAAGCCTGGTATTGTTTATAATTTTTTTTTTTTTTGATTTGTTTTATAAAATCGCATTTTAAATCGCAAATTGCAATTTTATCCAGAAAAATCGCAATTACATTTTTTCTCCAAATTGTGCAGCCCGTAATTAATTAATCTAATTAACGCATTAAACTCCCAGCCCTGAAAATAACATTTAATTTCAATATTTACTCTCCATTTCCAGCCATATGCAAAGCATGCTGGGAACTAACAATGGTGTCTCTAAATAAAACCACATAATTGAACTAATTCTCTAAAAATAAATAGGTAGCCCTCTTTCCTTAACTTTATTAGCTTAATCGTTCCTCAATTCAAGCCTCAAAACTGCGTAAGTTTCCTTAAAAAAAAAATAGGAAAATGTCTCTCTTGGTTTTATTAGTGTAATGTTCTCAATATTTAAAAAGAAGATAAGAATATAAGAACATTTGCTTGTTGATGTTTTGACAGCTTTTTGTTTTATTGTTATTCTGTAATAAACTAAATTTAAAACTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGAACACACACACACACACACCCACTCACCCACACTCATTCATTTGTTATTATTAACTAATAAAAAATATACATTTAGTCCTGATTCTTTTAGTGTTCACACTATCATTTTAAATGCTAAACCTAAATATACAAACAAAAACAGCTTTTATGAAGAAGAAGAAAAAAAAAAAAAAGCTTGTGCATTAAATGTGCTCATTTTATGTGTGTACATATGGTATTTTTACGAAGTGAAAATTCATGAAGAGCTTACAAAAAGTGTTAAGGAGCCAGGAATTCTTTCATTACACACAAAAACGAAGGTCTGCTGCAAGATACACAGTTCCGATACCTGTACTGAACTGTACTGTGTCGCATCTTGTGAAATCCCATTCTGTTTTGGTTCATTTAGATGTCTTTTGTCCATGTTGCATTGATATTTCAGTGAAACCTCACCAGAGTTAGTTTGGAAGCGGACCAAGGGGGTCCACTTGTTTGGTGCTTCGCTGTAGACATGTCTACAGAGCAG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>TU487538
TTGAAGTGATTATTTAACAACACTCCAAACTGCCTTCTTCATCTTTGCTGTGGTTTACAAGTCTGAGCTGGCAAATGTTTAAGGCTCAAATCCTGCAACCCATCTCCTACCATCATGTGACCTTTAGCCCCACCTAACCCCAAACTGCACCAACAGAAGTACAACAGAACAATTTAGATGAAAATTTGGGATGTGCAGAACTACATATTTTCATATCTCTGCAGGATTGTCTGAACGATAATTCATCTAAATTGTTTTATAATTATGGGTGATAAGACACATTTCAGACAGGCAGACAGACAGACATATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGACAGACAGACTCTAAAAGATCGAAAAAATCTACTAGAGGACTTGCGTCAATAGTAGCACTGAGATACGAGAACTGGACAGAAAAGATGTTGAGGTGATGATCACTGATGCCAACAGAGACACAACGAACCGACATGATGTCAGGACAGAAACAGAGAACTCAGACACCGCAACACATCAAACACTTCAACACTCAGGTACTAAGACTCATTTCATTATAGTAACATAACTAACATGCACATTTAAGTCAAATGAATGTTTAAGAAATATTTATCTTCATATCTGTGATCTACAGGAAGTGTTTGTGTGAAGATCAGAAGCTCCAGAGCAGCTGCAGTGTGTTTGGTGCTGCTGTGTGTTCTTCTGCTGACTGCAGTCATAGTGCTGGCCATCAAGCTCAGTAAAACGATTGATGAGTTTTACATCAAGTACAAAAACATCACAGAAGAGATAAATGAGTTAAATAACAGAAAATTAATCATGAAACAGAATACTACGATTTTATCAAATTATAATAAAACCCTGATTACAGAAAAATGGGCATTACAGAGCGAGATGAAAGAACTGTGGCAACAGATAGGTAAAATGGGTGGTAAAAAACTACACCAAAGCTACACAACTATTCAATATTTAAAGAATATTGTATGTATGTTTTGGGTTACTTGTTATAAATAAGTTGTGTCAGTCAGTGTGGATGGAAATAAAGAGCTAATTGTTGTACTGGTTGTTCTTACAGATGGATTGAAGTGCTATCAATCTAGTCTTTACTTCATCTCCACTGAGAAGAAGAACTGGACTGAGAGTAGGCGAGACTGTACAGAGAGAGGAGCAGATCTGATCATCATAAACAACAGAGAGGAACAAGAGTTTTTAAAAAGAGTTCCAGGTGGCACTGAAGTCTGGATTGGTCTGACTGACAGTGATGTGGAGGACACATGGAAATGAGTTGATGGCACCAACATGACCTCTGGGTTCTGGAGGGATGGAGAACCAAGTGATAGCACTGGTGAGGAGGACTGTGCCATAAATCTGTCATCAGGGTTTGCCGATTATTCATGTAATGAAAATTTTAAATGGATCTGTGAGAAGAACACATTTTAATTTGCATTGCTATAAAGAGTTGTTACAACATTTTTTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU487539 True 3196 lncRNA 0.35 1 10532246 10535441
TU487538 True 107 lncRNA 0.38 1 10543664 10543770

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_10528999_10530630 NA coding upstream 1399 10525290 ~ 10530847 (+)
CI01000304_10512196_10516865 NA coding upstream 15330 10511523 ~ 10516916 (+)
CI01000304_10504058_10505899 NA coding upstream 26230 10502988 ~ 10506016 (+)
CI01000304_10489464_10500854 NA coding upstream 31109 10489381 ~ 10501137 (+)
CI01000304_10473174_10473651 NA coding upstream 58521 10472092 ~ 10473725 (+)
CI01000304_10586097_10589143 NA coding downstream 7095 10585348 ~ 10589608 (+)
CI01000304_10927170_10992558 NA coding downstream 348917 10927170 ~ 10992558 (+)
CI01000304_11011297_11032025 NA coding downstream 431325 11009578 ~ 11032086 (+)
CI01000304_11140964_11155540 PAXBP1 coding downstream 562711 11140964 ~ 11155892 (+)
CI01000304_11170412_11182604 SLC7A1 coding downstream 591613 11169866 ~ 11182641 (+)
CI01000304_10451536_10470518 CD209 non-coding upstream 71578 10450410 ~ 10471255 (+)
G424376 NA non-coding upstream 278974 10253047 ~ 10253272 (+)
G424366 NA non-coding upstream 289033 10242979 ~ 10243213 (+)
G424351 NA non-coding upstream 311131 10219120 ~ 10221115 (+)
G424790 NA non-coding downstream 258932 10837185 ~ 10837475 (+)
G424794 NA non-coding downstream 272057 10850310 ~ 10850575 (+)
G424936 NA non-coding downstream 486265 11064518 ~ 11065557 (+)
G425052 NA non-coding downstream 488239 11066492 ~ 11072156 (+)
G425058 NA non-coding downstream 494076 11072329 ~ 11072732 (+)
G424251 NA other upstream 339351 10188822 ~ 10189404 (+)
G424246 NA other upstream 404924 10116343 ~ 10127322 (+)
CI01000304_09564068_09565679 HRH2B other upstream 966673 9561005 ~ 9565778 (+)
G423614 NA other upstream 1582824 8949036 ~ 8949422 (+)
CI01000304_08671901_08672203 NA other upstream 1859691 8671770 ~ 8672555 (+)
G425718 NA other downstream 1850452 12436554 ~ 12436605 (+)
CI01000304_13578347_13595075 NA other downstream 2978198 13578049 ~ 13595097 (+)
G426312 NA other downstream 3751795 14330048 ~ 14330886 (+)
G426828 NA other downstream 4370637 14948890 ~ 14950592 (+)
G427860 NA other downstream 5307201 15885454 ~ 15889591 (+)

Expression


Co-expression Network