G424891


Basic Information

Item Value
gene id G424891
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 10713964 ~ 10723908 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU487898
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU487898 True 9923 lncRNA 0.36 2 10713964 10723908

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_10350748_10388571 CADM2A coding downstream 325362 10349869 ~ 10388602 (-)
CI01000304_10284509_10291314 NLE1, NLE1.S coding downstream 422650 10284509 ~ 10291314 (-)
CI01000304_10220812_10226103 NA coding downstream 487861 10219589 ~ 10226103 (-)
CI01000304_10209150_10210418 NA coding downstream 503073 10208635 ~ 10210891 (-)
CI01000304_10191594_10192287 RNASEKB, RNASEK coding downstream 521607 10190574 ~ 10192357 (-)
CI01000304_10812673_10812980 NA coding upstream 88625 10812533 ~ 10815238 (-)
CI01000304_11065581_11077156 NA coding upstream 341331 11065239 ~ 11077156 (-)
CI01000304_11083948_11091592 PITPNAB, PITPNA coding upstream 359930 11083838 ~ 11091592 (-)
CI01000304_11110559_11121354 SLC43A2B coding upstream 386555 11110463 ~ 11122171 (-)
CI01000304_11124801_11135838 NA coding upstream 400249 11124157 ~ 11137342 (-)
G424806 NA non-coding downstream 133952 10565628 ~ 10580012 (-)
G424813 NA non-coding downstream 149232 10452461 ~ 10564732 (-)
G424810 NA non-coding downstream 152582 10547680 ~ 10561382 (-)
G424817 NA non-coding downstream 222844 10433180 ~ 10491120 (-)
G424831 NA non-coding downstream 394933 10318730 ~ 10319031 (-)
G424818 NA non-coding upstream 45807 10769715 ~ 10822649 (-)
G424892 NA non-coding upstream 54848 10778756 ~ 10785257 (-)
G424907 NA non-coding upstream 125293 10849201 ~ 10849483 (-)
G424932 NA non-coding upstream 175199 10899107 ~ 10899901 (-)
G425104 NA non-coding upstream 210473 10934381 ~ 11001594 (-)
G424808 NA other downstream 171299 10444355 ~ 10542665 (-)
CI01000304_10160458_10161768 VAMP2 other downstream 549634 10160458 ~ 10163762 (-)
CI01000304_09737662_09738777 NA other downstream 974493 9736746 ~ 9738777 (-)
CI01000304_09566730_09575706 NA other downstream 1144930 9566730 ~ 9575706 (-)
CI01000304_11338304_11348212 ILK other upstream 623112 11338019 ~ 11348212 (-)
G425580 NA other upstream 1144769 11868677 ~ 11872906 (-)
G426106 NA other upstream 1612793 12336701 ~ 12340228 (-)
CI01000304_12559311_12559998 NA other upstream 1834946 12558854 ~ 12560135 (-)
G426147 NA other upstream 1972090 12719497 ~ 12805926 (-)

Expression


Co-expression Network