G425048


Basic Information

Item Value
gene id G425048
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 11192185 ~ 11209025 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU488078
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU488078 True 16728 lncRNA 0.37 3 11192185 11209025

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_11170412_11182604 SLC7A1 coding upstream 9544 11169866 ~ 11182641 (+)
CI01000304_11140964_11155540 PAXBP1 coding upstream 36293 11140964 ~ 11155892 (+)
CI01000304_11011297_11032025 NA coding upstream 160099 11009578 ~ 11032086 (+)
CI01000304_10927170_10992558 NA coding upstream 199627 10927170 ~ 10992558 (+)
CI01000304_10586097_10589143 NA coding upstream 602577 10585348 ~ 10589608 (+)
CI01000304_11215537_11253484 MTUS2A coding downstream 5912 11214937 ~ 11253581 (+)
CI01000304_11264394_11268134 SLC46A3 coding downstream 55369 11264394 ~ 11268134 (+)
CI01000304_11288992_11297645 VPS36 coding downstream 79967 11288992 ~ 11298149 (+)
CI01000304_11301321_11304134 THSD1 coding downstream 91853 11300878 ~ 11304432 (+)
CI01000304_11308263_11317998 TPTE2, TPTE coding downstream 98023 11307048 ~ 11318063 (+)
G425073 NA non-coding upstream 54477 11137389 ~ 11137708 (+)
G425027 NA non-coding upstream 70011 11116120 ~ 11122174 (+)
G425058 NA non-coding upstream 119453 11072329 ~ 11072732 (+)
G425052 NA non-coding upstream 120029 11066492 ~ 11072156 (+)
G424936 NA non-coding upstream 126628 11064518 ~ 11065557 (+)
G425081 NA non-coding downstream 71502 11280527 ~ 11280867 (+)
G425044 NA non-coding downstream 71938 11280963 ~ 11281207 (+)
G425085 NA non-coding downstream 112906 11321931 ~ 11321987 (+)
G425030 NA non-coding downstream 120643 11329668 ~ 11338444 (+)
G425036 NA non-coding downstream 138254 11347279 ~ 11355129 (+)
CI01000304_10555326_10571933 NA other upstream 636481 10555216 ~ 10572164 (+)
G424251 NA other upstream 999290 10188822 ~ 10189404 (+)
G424246 NA other upstream 1064863 10116343 ~ 10127322 (+)
CI01000304_09564068_09565679 HRH2B other upstream 1626612 9561005 ~ 9565778 (+)
G423614 NA other upstream 2242763 8949036 ~ 8949422 (+)
G425718 NA other downstream 1219680 12436554 ~ 12436605 (+)
CI01000304_13578347_13595075 NA other downstream 2347426 13578049 ~ 13595097 (+)
G426312 NA other downstream 3121023 14330048 ~ 14330886 (+)
G426828 NA other downstream 3739865 14948890 ~ 14950592 (+)
G427860 NA other downstream 4676429 15885454 ~ 15889591 (+)

Expression


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