G426362



Basic Information


Item Value
gene id G426362
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 14051748 ~ 14062044 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU489588
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TGGCGGGGAAAGAGATAAAATTAGATTTGAACCATGTATTACGTCGCAGCTCCTTATAAAGTTACCATTCCTTTGGCAAGTATGTATATGCCAAAAACAGTTCTTACACTCATTTGGCACTTGATGAGTACCATTACAAGAACAGAGCTGGACGATGACGTCACTGTTTTCTCCAGTGCTGATATATACAGGTGCTGGTCATATAATTAGAATATCGTGAAAAAGTTCATTTTTTTATTGTAAATTATTTTAAAAAATGAAACTTTCATATATTCTA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU489588 True 10277 lncRNA 0.36 2 14051748 14062044

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_14011581_14044797 NA coding upstream 6788 14011326 ~ 14044960 (+)
CI01000304_14005720_14006514 CREBZF coding upstream 44888 14005720 ~ 14006860 (+)
CI01000304_13989055_14004354 SYTL2A coding upstream 47222 13989055 ~ 14004526 (+)
CI01000304_13947668_13967998 PICALMA, PICALM, PICA coding upstream 82558 13946158 ~ 13969190 (+)
CI01000304_13932457_13932762 NA coding upstream 118664 13931949 ~ 13933084 (+)
CI01000304_14108490_14112755 NA coding downstream 46446 14108490 ~ 14113061 (+)
CI01000304_14131633_14155156 NA coding downstream 68795 14125318 ~ 14155278 (+)
CI01000304_14179009_14221165 NA coding downstream 116965 14179009 ~ 14223133 (+)
CI01000304_14231227_14261460 NA coding downstream 169029 14231073 ~ 14262163 (+)
CI01000304_14304022_14317252 HYOU1 coding downstream 241978 14304022 ~ 14318025 (+)
G426307 NA non-coding upstream 73586 13976965 ~ 13978162 (+)
G426592 NA non-coding upstream 178630 13872905 ~ 13873118 (+)
G426526 NA non-coding upstream 310188 13739700 ~ 13741560 (+)
G426348 NA non-coding upstream 362152 13680625 ~ 13689596 (+)
G426377 NA non-coding upstream 433018 13615987 ~ 13618730 (+)
G426375 NA non-coding downstream 22994 14085038 ~ 14095622 (+)
G426352 NA non-coding downstream 53705 14115749 ~ 14123481 (+)
G426343 NA non-coding downstream 173833 14235877 ~ 14241431 (+)
G426379 NA non-coding downstream 212433 14274477 ~ 14288222 (+)
CI01000304_13578347_13595075 NA other upstream 472901 13578049 ~ 13595097 (+)
G425718 NA other upstream 1612662 12436554 ~ 12436605 (+)
CI01000304_10555326_10571933 NA other upstream 3496044 10555216 ~ 10572164 (+)
G424251 NA other upstream 3858853 10188822 ~ 10189404 (+)
G424246 NA other upstream 3924426 10116343 ~ 10127322 (+)
G426312 NA other downstream 268004 14330048 ~ 14330886 (+)
G426828 NA other downstream 886846 14948890 ~ 14950592 (+)
G427860 NA other downstream 1823410 15885454 ~ 15889591 (+)
G428017 NA other downstream 2021186 16083230 ~ 16083714 (+)
CI01000304_16505174_16506124 NA other downstream 2442818 16504764 ~ 16513625 (+)

Expression



Co-expression Network