G429688


Basic Information

Item Value
gene id G429688
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000304
NCBI id null
chromosome length 18613800
location 18465779 ~ 18476268 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU493343
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ATCTTTTATCAAGGCTGCATTTATTTAAAACAGTAAAACCTAATATTGTGAAATTATTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU493343 True 10059 lncRNA 0.40 3 18465779 18476268

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000304_18456463_18461381 NRIP1B coding downstream 4398 18456361 ~ 18461381 (-)
CI01000304_18419836_18444486 USP25 coding downstream 21293 18419074 ~ 18444486 (-)
CI01000304_18356754_18371739 NA coding downstream 91847 18349995 ~ 18373932 (-)
CI01000304_18343532_18348936 NA coding downstream 116146 18343281 ~ 18349633 (-)
CI01000304_18021327_18022049 NA coding downstream 443670 18021051 ~ 18022109 (-)
CI01000304_18481215_18483117 NA coding upstream 4856 18481124 ~ 18484668 (-)
CI01000304_18541563_18569559 GDPD5A coding upstream 65010 18541278 ~ 18569559 (-)
G429705 NA non-coding downstream 52683 18412884 ~ 18413096 (-)
G429686 NA non-coding downstream 77913 18380955 ~ 18387866 (-)
G429697 NA non-coding downstream 133747 18331736 ~ 18332032 (-)
G429710 NA non-coding upstream 49813 18526081 ~ 18526328 (-)
G429711 NA non-coding upstream 50153 18526421 ~ 18526623 (-)
G429685 NA non-coding upstream 63343 18539611 ~ 18540344 (-)
G429499 NA other downstream 227460 18237719 ~ 18238319 (-)
G429331 NA other downstream 541095 17923863 ~ 17924684 (-)
CI01000304_16854877_16860888 YPEL2A, YPEL2B, YPEL1, YPEL2, YPEL1.L, YPELD, YPELC other downstream 1598541 16854565 ~ 16860911 (-)
CI01000304_16769537_16780398 SUPT20, SUPT20H other downstream 1684820 16769417 ~ 16780398 (-)
G427376 NA other downstream 3204374 15258964 ~ 15261405 (-)
G429673 NA other upstream 110174 18586442 ~ 18591856 (-)

Expression


Co-expression Network