G433700


Basic Information

Item Value
gene id G433700
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000306
NCBI id null
chromosome length 11491657
location 6128651 ~ 6168315 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU497986
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU497986 True 16031 lncRNA 0.37 3 6128651 6168315

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000306_06106248_06107449 GM2573, CS056, WDR83OS coding upstream 21113 6106143 ~ 6108175 (+)
CI01000306_06097961_06104051 SLC22A7A coding upstream 24314 6097590 ~ 6104337 (+)
CI01000306_06074861_06096200 TTBK1, TTBK1A coding upstream 32364 6074861 ~ 6096287 (+)
CI01000306_06055478_06066083 NA coding upstream 62238 6055478 ~ 6066413 (+)
CI01000306_06051975_06053165 TMEM246 coding upstream 73886 6051438 ~ 6054765 (+)
CI01000306_06258779_06262616 STX10 coding downstream 88774 6257089 ~ 6264303 (+)
CI01000306_06281314_06288766 TRMT1 coding downstream 112699 6281014 ~ 6289053 (+)
CI01000306_06303064_06327102 NA coding downstream 134242 6302557 ~ 6327477 (+)
CI01000306_06355528_06390936 SIPA1L2 coding downstream 186393 6354708 ~ 6391189 (+)
CI01000306_06426490_06435408 NA coding downstream 255460 6423775 ~ 6435558 (+)
G433128 NA non-coding upstream 122665 5996828 ~ 6005986 (+)
G433134 NA non-coding upstream 156545 5922225 ~ 5972106 (+)
G433123 NA non-coding upstream 219419 5907287 ~ 5909232 (+)
G432961 NA non-coding upstream 236359 5891860 ~ 5892292 (+)
G433120 NA non-coding upstream 237467 5890961 ~ 5891184 (+)
G433702 NA non-coding downstream 33628 6201943 ~ 6207505 (+)
G433683 NA non-coding downstream 84990 6253305 ~ 6254494 (+)
G433705 NA non-coding downstream 99326 6267641 ~ 6268956 (+)
G433709 NA non-coding downstream 101043 6269358 ~ 6270538 (+)
G433715 NA non-coding downstream 107056 6275371 ~ 6277148 (+)
CI01000306_05976516_05985251 TMEM178A, TMEM178 other upstream 142363 5975822 ~ 5986288 (+)
G432958 NA other upstream 468482 5658928 ~ 5660169 (+)
G432678 NA other upstream 1606115 4522182 ~ 4522536 (+)
G432583 NA other upstream 1800829 4326402 ~ 4327822 (+)
G434545 NA other downstream 951002 7119317 ~ 7119859 (+)
CI01000306_09225597_09230504 NA other downstream 3057250 9225512 ~ 9231333 (+)
CI01000306_09263755_09288503 NA other downstream 3105584 9263589 ~ 9289035 (+)
G435590 NA other downstream 3544534 9704707 ~ 9737144 (+)
CI01000306_09860935_09865155 SH2D5 other downstream 3691898 9860480 ~ 9865724 (+)

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