CI01000308_01757068_01765055


Basic Information

Item Value
gene id CI01000308_01757068_01765055
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000308
NCBI id null
chromosome length 1982671
location 1755870 ~ 1766109 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>CI01000308_01757068_01765055.mRNA
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>TU502876
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000308_01757068_01765055.mRNA False 3887 mRNA 0.37 11 1755870 1766100
TU502876 True 2806 lncRNA 0.38 2 1763152 1766109

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000308_01751621_01754826 NA coding upstream 850 1751541 ~ 1755020 (+)
CI01000308_01667660_01683460 MIPEP coding upstream 72272 1667660 ~ 1683598 (+)
CI01000308_01645574_01648364 CADM2 coding upstream 107303 1644246 ~ 1648567 (+)
CI01000308_01594565_01626825 CADM2, CADM2B coding upstream 129045 1594565 ~ 1626825 (+)
CI01000308_01132580_01134190 FKRP coding upstream 621456 1132025 ~ 1134414 (+)
CI01000308_01775458_01781291 NA coding downstream 9312 1775412 ~ 1781291 (+)
CI01000308_01829826_01849607 NUMBL coding downstream 63726 1829826 ~ 1850544 (+)
CI01000308_01855056_01857722 NA coding downstream 88623 1854723 ~ 1859663 (+)
CI01000308_01894236_01939093 DPF1 coding downstream 128136 1894236 ~ 1939888 (+)
CI01000308_01951635_01956348 NA coding downstream 185535 1951635 ~ 1956362 (+)
G438174 NA non-coding upstream 13939 1741559 ~ 1741931 (+)
G438170 NA non-coding upstream 21668 1733404 ~ 1734202 (+)
G438036 NA non-coding upstream 214005 1534018 ~ 1541865 (+)
G438033 NA non-coding upstream 292440 1443373 ~ 1463430 (+)
G438125 NA non-coding downstream 24367 1790467 ~ 1798846 (+)
G438130 NA non-coding downstream 55215 1821315 ~ 1857127 (+)
G438032 NA non-coding upstream 229364 1421020 ~ 1533788 (+)

Expression


Co-expression Network