G452455


Basic Information

Item Value
gene id G452455
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000319
NCBI id null
chromosome length 6428943
location 5157380 ~ 5159750 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU519482
CCATTCGTCTCTCTTTGTCTCAGGACACAATTCCCCTGGGTCAGAACGTTGAGGCAGAAAGTTCCAACAATTAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGTAATAACAGGCTAACGTTTGTACGGTAGGCTTAAGGCAGAGACGAGGGGGAGGGCAGGATTACAGGAGCAATGAAGGGGAAGAGACTTTGCAGGCTGGTCTCAATTCATTTAACAAGCCTTAAAGGGGAGGAAAATAAACTTCAAAGCCAAATACACATTTGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACATTTTTCTAAGAGCACACATACATGTTGCTGTGGGCTTGATTCACAGATGTCAGATTAAAGAATAAACACATTCCACTGTCTTTGAGGCTTCAAGCCAGATTGGCAAAACCGCCACAAAGAGCTGCAGTATTTCAAGCAGCTGATTCACTTCAGAGACCGTCCGTTTCATGAAAAACAGACCGTATGAGCATGACTTCCAGTGCACCTTTGCAAAAATGTGCTAAAATTGCCAAGTAGAGTACAAAGCATGACCATGTTGGACATGAAGCTTAAGTTTTACTCCATTTCCCTCCCAAATCAAGTGCTGAGCTTATAAACTGACATACAGTACTCTGATAAGGGTTACTATTTCACAAAAAAAGTGAAACTTTCAGCCCCAACATTACATTACAAAGCAATAAATACTGTAAATGACAAACAAAATGAACGTTGCCGTCTTCAAATCTAAGTGAAGACAGCCCAAGAGAGATAAAGGGAGAGAAAGACATCAACGATAACACAAAAGTGGTACAGTGTTGATATTTACATCCTGCACAGAGCTTAAAAACCAAAGTATATTTACATACAGATGGGTGGAGCAAAACTGGTCAAACCAAACCCACCGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAGACTAATGAAACAGAACAGGAGAATAGCATGAACATCACAGAAAGTTGGAAGATGGGCCATTGAGGGCCTCAGAACAGGGTTTATTGAGAAGCTAACAGATGTGTTCTCGAGAAAAGATATCTGTTATTTTGGACAGTTTGTGGATCGATACGATTGACTGAGACCATTTAACGTTACGATTCTCAACTCATGTGGAGATTTCACAAACATTTTATAGAACTGTTCTACCACAAAGGCCTTTAATAAGAGTAGCTTAATTTATCAGAAAAATGATGTTGATTGAAATGCTAAAACAGATAGAAAACGTACTGAAACACTGAATTACAATGCAAGGTTCAGTCTACAGACCTGACGTCATTCAAAAATGACTTTGAATGGATGAAGAATCTGTAATCTCACAAGAATAAATTAAGCCTAGACCTGGAGCATCATTAAAAGTTAATGATAATGCCCAGGAATATAAAGTCACTTCAGTACAACAATATTAATATGCTATTGTCTTGCATACGTCTTTCAATCATTCTTTCCCTTCTTTATGGTCAACAAGAACGTTTAACAGTTTCCCAACCAGCTCTTCTTCGCTGTGCCTTTGTTCCACAGGGAAAAAGACCGCAGATGCTTTCTCAAAAGTCCATCCAATTCGCCATTTGAAAACAACAAATATATTTACTGGAAGTTAAAAGCAAGATATTAAAATAACTGTATAAAACCACGACATTTAGTCCCGCCTATTTCCCTTGACATTTACAACAAGATACATCATTTACCGTGACTGCTTGTTCCCTGCGAAATGTATTATTCCTCAGATAGGGAGATTGAGAGCAATGACTGAGCGTTAGCTAAACAAATCAAGGTAAAACATCCACTGTAAATGTCGATTTAAATAAATTAAGATAAAAATTAGACAGAGGACCTGCCCCTAGCCACTGAACCAATCGCATTTGACCTCCAAAGCACGTGTGGTGTTGCGTTATGGATGCACATGAACTTTGCTACGGGCCTACGCAGCCGTTCGGAGCACTCTCGATATTGACTAACTCTATTATCTGAAGCAAATATTAGCAGTATAACTCTGTTTGTTGTTGTTTGTTTCATGTACATGGCAGAGTGTCGGTGTGTGTGTACAGTATGTTTCTCGATAGACAGTAAACAAACATCAGGCTTTCCAGACCGCTGTGCAGTCGCTGGTAATTCTGAAATGCGTGACACCTGAATCAGTCTGTAAATGTGTGAATTAGAGCTATAGGGAGGAGGAGCCGTGTATGAGGTAAAGAGGGTGTAAGACTGTGTATGTGTTTGTCAGAGGAAGGGATGTGCTCTGTGGTGGCTCAGATGCTGTGGTGTGTAAGCTTGTTTTTTGAGTCACAGCCTCAGGTGCTGTTGGTCAGAGTAGATCCAGGCTGTACAGAACCTTCA
>TU519484
CCATTCGTCTCTCTTTGTCTCAGGACACAATTCCCCTGGGTCAGAACGTTGAGGCAGAAAGTTCCAACAATTAACCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGTAATAACAGGCTAACGTTTGTACGGTAGGCTTAAGGCAGAGACGAGGGGGAGGGCAGGATTACAGGAGCAATGAAGGGGAAGAGACTTTGCAGGCTGGTCTCAATTCATTTAACAAGCCTTAAAGGGGAGGAAAATAAACTTCAAAGCCAAATACACATTTGAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGATTCACATTTTTCTAAGAGCACACATACATGTTGCTGTGGGCTTGATTCACAGATGTCAGATTAAAGAATAAACACATTCCACTGTCTTTGAGGCTTCAAGCCAGATTGGCAAAACCGCCACAAAGAGCTGCAGTATTTCAAGCAGCTGATTCACTTCAGAGACCGTCCGTTTCATGAAAAACAGACCGTATGAGCATGACTTCCAGTGCACCTTTGCAAAAATGTGCTAAAATTGCCAAGTAGAGTACAAAGCATGACCATGTTGGACATGAAGCTTAAGTTTTACTCCATTTCCCTCCCAAATCAAGTGCTGAGCTTATAAACTGACATACAGTACTCTGATAAGGGTTACTATTTCACAAAAAAAGTGAAACTTTCAGCCCCAACATTACATTACAAAGCAATAAATACTGTAAATGACAAACAAAATGAACGTTGCCGTCTTCAAATCTAAGTGAAGACAGCCCAAGAGAGATAAAGGGAGAGAAAGACATCAACGATAACACAAAAGTGGTACAGTGTTGATATTTACATCCTGCACAGAGCTTAAAAACCAAAGTATATTTACATACAGATGGGTGGAGCAAAACTGGTCAAACCAAACCCACCGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTAATGAAACAGAACAGGAGAATAGCATGAACATCACAGAAAGTTGGAAGATGGGCCATTGAGGGCCTCAGAACAGGGTTTATTGAGAAGCTAACAGATGTGTTCTCGAGAAAAGATATCTGTTATTTTGGACAGTTTGTGGATCGATACGATTGACTGAGACCATTTAACGTTACGATTCTCAACTCATGTGGAGATTTCACAAACATTTTATAGAACTGTTCTACCACAAAGGCCTTTAATAAGAGTAGCTTAATTTATCAGAAAAATGATGTTGATTGAAATGCTAAAACAGATAGAAAACGTACTGAAACACTGAATTACAATGCAAGGTTCAGTCTACAGACCTGACGTCATTCAAAAATGACTTTGAATGGATGAAGAATCTGTAATCTCACAAGAATAAATTAAGCCTAGACCTGGAGCATCATTAAAAGTTAATGATAATGCCCAGGAATATAAAGTCACTTCAGTACAACAATATTAATATGCTATTGTCTTGCATACGTCTTTCAATCATTCTTTCCCTTCTTTATGGTCAACAAGAACGTTTAACAGTTTCCCAACCAGCTCTTCTTCGCTGTGCCTTTGTTCCACAGGGAAAAAGACCGCAGATGCTTTCTCAAAAGTCCATCCAATTCGCCATTTGAAAACAACAAATATATTTACTGGAAGTTAAAAGCAAGATATTAAAATAACTGTATAAAACCACGACATTTAGTCCCGCCTATTTCCCTTGACATTTACAACAAGATACATCATTTACCGTGACTGCTTGTTCCCTGCGAAATGTATTATTCCTCAGATAGGGAGATTGAGAGCAATGACTGAGCGTTAGCTAAACAAATCAAGGTAAAACATCCACTGTAAATGTCGATTTAAATAAATTAAGATAAAAATTAGACAGAGGACCTGCCCCTAGCCACTGAACCAATCGCATTTGACCTCCAAAGCACGTGTGGTGTTGCGTTATGGATGCACATGAACTTTGCTACGGGCCTACGCAGCCGTTCGGAGCACTCTCGATATTGACTAACTCTATTATCTGAAGCAAATATTAGCAGTATAACTCTGTTTGTTGTTGTTTGTTTCATGTACATGGCAGAGTGTCGGTGTGTGTGTACAGTATGTTTCTCGATAGACAGTAAACAAACATCAGGCTTTCCAGACCGCTGTGCAGTCGCTGGTAATTCTGAAATGCGTGACACCTGAATCAGTCTGTAAATGTGTGAATTAGAGCTATAGGGAGGAGGAGCCGTGTATGAGGTAAAGAGGGTGTAAGACTGTGTATGTGTTTGTCAGAGGAAGGGATGTGCTCTGTGGTGGCTCAGATGCTGTGGTGTGTAAGCTTGTTTTTTGAGTCACAGCCTCAGGTGCTGTTGGTCAGAGTAGATCCAGGCTGTACAGAACCTTCA
>TU519481
GCACACATACATGTTGCTGTGGGCTTGATTCACAGATGTCAGATTAAAGAATAAACACATTCCACTGTCTTTGAGGCTTCAAGCCAGATTGGCAAAACCGCCACAAAGAGCTGCAGTATTTCAAGCAGCTGATTCACTTCAGAGACCGTCCGTTTCATGAAAAACAGACCGTATGAGCATGACTTCCAGTGCACCTTTGCAAAAATGTGCTAAAATTGCCAAGTAGAGTACAAAGCATGACCATGTTGGACATGAAGCTTAAGTTTTACTCCATTTCCCTCCCAAATCAAGTGCTGAGCTTATAAACTGACATACAGTACTCTGATAAGGGTTACTATTTCACAAAAAAAGTGAAACTTTCAGCCCCAACATTACATTACAAAGCAATAAATACTGTAAATGACAAACAAAATGAACGTTGCCGTCTTCAAATCTAAGTGAAGACAGCCCAAGAGAGATAAAGGGAGAGAAAGACATCAACGATAACACAAAAGTGGTACAGTGTTGATATTTACATCCTGCACAGAGCTTAAAAACCAAAGTATATTTACATACAGATGGGTGGAGCAAAACTGGTCAAACCAAACCCACCGAACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTAATGAAACAGAACAGGAGAATAGCATGAACATCACAGAAAGTTGGAAGATGGGCCATTGAGGGCCTCAGAACAGGGTTTATTGAGAAGCTAACAGATGTGTTCTCGAGAAAAGATATCTGTTATTTTGGACAGTTTGTGGATCGATACGATTGACTGAGACCATTTAACGTTACGATTCTCAACTCATGTGGAGATTTCACAAACATTTTATAGAACTGTTCTACCACAAAGGCCTTTAATAAGAGTAGCTTAATTTATCAGAAAAATGATGTTGATTGAAATGCTAAAACAGATAGAAAACGTACTGAAACACTGAATTACAATGCAAGGTTCAGTCTACAGACCTGACGTCATTCAAAAATGACTTTGAATGGATGAAGAATCTGTAATCTCACAAGAATAAATTAAGCCTAGACCTGGAGCATCATTAAAAGTTAATGATAATGCCCAGGAATATAAAGTCACTTCAGTACAACAATATTAATATGCTATTGTCTTGCATACGTCTTTCAATCATTCTTTCCCTTCTTTATGGTCAACAAGAACGTTTAACAGTTTCCCAACCAGCTCTTCTTCGCTGTGCCTTTGTTCCACAGGGAAAAAGACCGCAGATGCTTTCTCAAAAGTCCATCCAATTCGCCATTTGAAAACAACAAATATATTTACTGGAAGTTAAAAGCAAGATATTAAAATAACTGTATAAAACCACGACATTTAGTCCCGCCTATTTCCCTTGACATTTACAACAAGATACATCATTTACCGTGACTGCTTGTTCCCTGCGAAATGTATTATTCCTCAGATAGGGAGATTGAGAGCAATGACTGAGCGTTAGCTAAACAAATCAAGGTAAAACATCCACTGTAAATGTCGATTTAAATAAATTAAGATAAAAATTAGACAGAGGACCTGCCCCTAGCCACTGAACCAATCGCATTTGACCTCCAAAGCACGTGTGGTGTTGCGTTATGGATGCACATGAACTTTGCTACGGGCCTACGCAGCCGTTCGGAGCACTCTCGATATTGACTAACTCTATTATCTGAAGCAAATATTAGCAGTATAACTCTGTTTGTTGTTGTTTGTTTCATGTACATGGCAGAGTGTCGGTGTGTGTGTACAGTATGTTTCTCGATAGACAGTAAACAAACATCAGGCTTTCCAGACCGCTGTGCAGTCGCTGGTAATTCTGAAATGCGTGACACCTGAATCAGTCTGTAAATGTGTGAATTAGAGCTATAGGGAGGAGGAGCCGTGTATGAGGTAAAGAGGGTGTAAGACTGTGTATGTGTTTGTCAGAGGAAGGGATGTGCTCTGTGGTGGCTCAGATGCTGTGGTGTGTAAGCTTGTTTTTTGAGTCACAGCCTCAGGTGCTGTTGGTCAGAGTAGATCCAGGCTGTACAGAACCTTCA
>TU519483
GCACACATACATGTTGCTGTGGGCTTGATTCACAGATGTCAGATTAAAGAATAAACACATTCCACTGTCTTTGAGGCTTCAAGCCAGATTGGCAAAACCGCCACAAAGAGCTGCAGTATTTCAAGCAGCTGATTCACTTCAGAGACCGTCCGTTTCATGAAAAACAGACCGTATGAGCATGACTTCCAGTGCACCTTTGCAAAAATGTGCTAAAATTGCCAAGTAGAGTACAAAGCATGACCATGTTGGACATGAAGCTTAAGTTTTACTCCATTTCCCTCCCAAATCAAGTGCTGAGCTTATAAACTGACATACAGTACTCTGATAAGGGTTACTATTTCACAAAAAAAGTGAAACTTTCAGCCCCAACATTACATTACAAAGCAATAAATACTGTAAATGACAAACAAAATGAACGTTGCCGTCTTCAAATCTAAGTGAAGACAGCCCAAGAGAGATAAAGGGAGAGAAAGACATCAACGATAACACAAAAGTGGTACAGTGTTGATATTTACATCCTGCACAGAGCTTAAAAACCAAAGTATATTTACATACAGATGGGTGGAGCAAAACTGGTCAAACCAAACCCACCGAACATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACTAATGAAACAGAACAGGAGAATAGCATGAACATCACAGAAAGTTGGAAGATGGGCCATTGAGGGCCTCAGAACAGGGTTTATTGAGAAGCTAACAGATGTGTTCTCGAGAAAAGATATCTGTTATTTTGGACAGTTTGTGGATCGATACGATTGACTGAGACCATTTAACGTTACGATTCTCAACTCATGTGGAGATTTCACAAACATTTTATAGAACTGTTCTACCACAAAGGCCTTTAATAAGAGTAGCTTAATTTATCAGAAAAATGATGTTGATTGAAATGCTAAAACAGATAGAAAACGTACTGAAACACTGAATTACAATGCAAGGTTCAGTCTACAGACCTGACGTCATTCAAAAATGACTTTGAATGGATGAAGAATCTGTAATCTCACAAGAATAAATTAAGCCTAGACCTGGAGCATCATTAAAAGTTAATGATAATGCCCAGGAATATAAAGTCACTTCAGTACAACAATATTAATATGCTATTGTCTTGCATACGTCTTTCAATCATTCTTTCCCTTCTTTATGGTCAACAAGAACGTTTAACAGTTTCCCAACCAGCTCTTCTTCGCTGTGCCTTTGTTCCACAGGGAAAAAGACCGCAGATGCTTTCTCAAAAGTCCATCCAATTCGCCATTTGAAAACAACAAATATATTTACTGGAAGTTAAAAGCAAGATATTAAAATAACTGTATAAAACCACGACATTTAGTCCCGCCTATTTCCCTTGACATTTACAACAAGATACATCATTTACCGTGACTGCTTGTTCCCTGCGAAATGTATTATTCCTCAGATAGGGAGATTGAGAGCAATGACTGAGCGTTAGCTAAACAAATCAAGGTAAAACATCCACTGTAAATGTCGATTTAAATAAATTAAGATAAAAATTAGACAGAGGACCTGCCCCTAGCCACTGAACCAATCGCATTTGACCTCCAAAGCACGTGTGGTGTTGCGTTATGGATGCACATGAACTTTGCTACGGGCCTACGCAGCCGTTCGGAGCACTCTCGATATTGACTAACTCTATTATCTGAAGCAAATATTAGCAGTATAACTCTGTTTGTTGTTGTTTGTTTCATGTACATGGCAGAGTGTCGGTGTGTGTGTACAGTATGTTTCTCGATAGACAGTAAACAAACATCAGGCTTTCCAGACCGCTGTGCAGTCGCTGGTAATTCTGAAATGCGTGACACCTGAATCAGTCTGTAAATGTGTGAATTAGAGCTATAGGGAGGAGGAGCCGTGTATGAGGTAAAGAGGGTGTAAGACTGTGTATGTGTTTGTCAGAGGAAGGGATGTGCTCTGTGGTGGCTCAGATGCTGTGGTGTGTAAGCTTGTTTTTTGAGTCACAGCCTCAGGTGCTGTTGGTCAGAGTAGATCCAGGCTGTACAGAACCTTCA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU519482 False 2332 lncRNA 0.39 2 5157380 5159750
TU519484 False 2335 lncRNA 0.39 2 5157380 5159750
TU519481 False 2033 lncRNA 0.39 2 5157681 5159750
TU519483 True 2038 lncRNA 0.39 2 5157681 5159750

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000319_05112104_05116909 NA coding upstream 40306 5111633 ~ 5117074 (+)
CI01000319_04949418_04952350 PDK2B coding upstream 205030 4949305 ~ 4952350 (+)
CI01000319_04931863_04933044 NA coding upstream 224294 4931653 ~ 4933086 (+)
CI01000319_04907275_04915465 WIPF2B coding upstream 241784 4907006 ~ 4915596 (+)
CI01000319_04869169_04900787 PLAK, JUPB coding upstream 256480 4869169 ~ 4900900 (+)
CI01000319_05435510_05450379 NA coding downstream 275479 5435229 ~ 5450632 (+)
CI01000319_05618356_05625888 FLOT1, FLOT1A coding downstream 458606 5618356 ~ 5626767 (+)
CI01000319_05651284_05669061 KIFC1, ZBTB22B coding downstream 491364 5651114 ~ 5671460 (+)
CI01000319_05684798_05685353 NA coding downstream 524666 5684416 ~ 5685353 (+)
CI01000319_05704764_05712826 NA coding downstream 544333 5704083 ~ 5713885 (+)
G452458 NA non-coding upstream 4326 5152726 ~ 5153054 (+)
G452427 NA non-coding upstream 98045 5058982 ~ 5059335 (+)
G452390 NA non-coding upstream 211928 4944953 ~ 4945452 (+)
G452351 NA non-coding upstream 379236 4777910 ~ 4778144 (+)
G452261 NA non-coding upstream 396056 4665120 ~ 4761324 (+)
G452504 NA non-coding downstream 4429 5164179 ~ 5168282 (+)
G452518 NA non-coding downstream 52018 5211768 ~ 5211981 (+)
G452574 NA non-coding downstream 134568 5294318 ~ 5294529 (+)
G452590 NA non-coding downstream 160295 5320045 ~ 5321004 (+)
G452541 NA non-coding downstream 176335 5336085 ~ 5353023 (+)
CI01000319_04787066_04788609 EIF1B, EIF1, GM6900 other upstream 366851 4787040 ~ 4790529 (+)
CI01000319_04515268_04534770 NA other upstream 621355 4515268 ~ 4536025 (+)
G452043 NA other upstream 1612661 3500279 ~ 3500512 (+)
CI01000319_03402932_03447997 BTR26, BTR25, BTR24, BTY, BTR22, BTR18 other upstream 1736780 3402112 ~ 3448275 (+)
G451662 NA other upstream 1822556 3333281 ~ 3334824 (+)
G452545 NA other downstream 193944 5353694 ~ 5356035 (+)
G452543 NA other downstream 199950 5359700 ~ 5371484 (+)
G452735 NA other downstream 548412 5712686 ~ 5712732 (+)
G452884 NA other downstream 962894 6122644 ~ 6124939 (+)

Expression


Co-expression Network