G452541


Basic Information

Item Value
gene id G452541
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000319
NCBI id null
chromosome length 6428943
location 5336085 ~ 5353023 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU519578
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>TU519575
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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU519578 False 1875 lncRNA 0.46 9 5336085 5343993
TU519577 False 5715 TUCP 0.38 8 5339522 5346994
TU519580 False 8194 lncRNA 0.38 6 5343510 5353023
TU519575 True 2797 lncRNA 0.38 3 5344058 5346994

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000319_05112104_05116909 NA coding upstream 219011 5111633 ~ 5117074 (+)
CI01000319_04949418_04952350 PDK2B coding upstream 383735 4949305 ~ 4952350 (+)
CI01000319_04931863_04933044 NA coding upstream 402999 4931653 ~ 4933086 (+)
CI01000319_04907275_04915465 WIPF2B coding upstream 420489 4907006 ~ 4915596 (+)
CI01000319_04869169_04900787 PLAK, JUPB coding upstream 435185 4869169 ~ 4900900 (+)
CI01000319_05435510_05450379 NA coding downstream 82206 5435229 ~ 5450632 (+)
CI01000319_05618356_05625888 FLOT1, FLOT1A coding downstream 265333 5618356 ~ 5626767 (+)
CI01000319_05651284_05669061 KIFC1, ZBTB22B coding downstream 298091 5651114 ~ 5671460 (+)
CI01000319_05684798_05685353 NA coding downstream 331393 5684416 ~ 5685353 (+)
CI01000319_05704764_05712826 NA coding downstream 351060 5704083 ~ 5713885 (+)
G452590 NA non-coding upstream 15081 5320045 ~ 5321004 (+)
G452574 NA non-coding upstream 41556 5294318 ~ 5294529 (+)
G452518 NA non-coding upstream 124104 5211768 ~ 5211981 (+)
G452504 NA non-coding upstream 167803 5164179 ~ 5168282 (+)
G452455 NA non-coding upstream 176335 5157380 ~ 5159750 (+)
G452597 NA non-coding downstream 3065 5356088 ~ 5427852 (+)
G452658 NA non-coding downstream 105308 5458331 ~ 5459625 (+)
G452547 NA non-coding downstream 146760 5499783 ~ 5503223 (+)
G452681 NA non-coding downstream 153505 5506528 ~ 5507227 (+)
G452685 NA non-coding downstream 159770 5512793 ~ 5513079 (+)
CI01000319_04787066_04788609 EIF1B, EIF1, GM6900 other upstream 545556 4787040 ~ 4790529 (+)
CI01000319_04515268_04534770 NA other upstream 800060 4515268 ~ 4536025 (+)
G452043 NA other upstream 1791366 3500279 ~ 3500512 (+)
CI01000319_03402932_03447997 BTR26, BTR25, BTR24, BTY, BTR22, BTR18 other upstream 1915485 3402112 ~ 3448275 (+)
G451662 NA other upstream 2001261 3333281 ~ 3334824 (+)
G452545 NA other downstream 671 5353694 ~ 5356035 (+)
G452543 NA other downstream 6677 5359700 ~ 5371484 (+)
G452735 NA other downstream 355139 5712686 ~ 5712732 (+)
G452884 NA other downstream 769621 6122644 ~ 6124939 (+)

Expression


Co-expression Network