XLOC_013445


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013445
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 25180539 ~ 25225436 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00027343
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>TCONS_00027344
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>TCONS_00027345
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Function

GO:

id name namespace
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GO:0006348 chromatin silencing at telomere biological_process
GO:0046907 intracellular transport biological_process
GO:0034613 cellular protein localization biological_process
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GO:0051649 establishment of localization in cell biological_process
GO:0070727 cellular macromolecule localization biological_process
GO:0008104 protein localization biological_process
GO:0044424 obsolete intracellular part cellular_component
GO:0044444 obsolete cytoplasmic part cellular_component
GO:0000407 phagophore assembly site cellular_component
GO:0032991 protein-containing complex cellular_component
GO:0005622 intracellular anatomical structure cellular_component
GO:0043227 membrane-bounded organelle cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00027343 False 9072 lncRNA 0.34 1 25180539 25189610
TCONS_00027344 False 1023 lncRNA 0.37 4 25180539 25225387
TCONS_00026542 False 861 lncRNA 0.36 3 25180539 25225387
TCONS_00027345 True 924 lncRNA 0.37 3 25180539 25225436

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013443 slco3a1 coding downstream 3309 25073984 ~ 25177230 (-)
XLOC_013444 BX901968.2 coding downstream 21762 25158661 ~ 25158777 (-)
XLOC_013442 st8sia2 coding downstream 128693 25027495 ~ 25051846 (-)
XLOC_013441 NA coding downstream 183469 24990268 ~ 24997070 (-)
XLOC_013440 chd2 coding downstream 190959 24933473 ~ 24989580 (-)
XLOC_013446 plin1 coding upstream 4198 25229634 ~ 25279323 (-)
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XLOC_013448 CR450716.1 coding upstream 290457 25515893 ~ 25516631 (-)
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XLOC_013450 NA coding upstream 471839 25697275 ~ 25745621 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 5638308 19542102 ~ 19542231 (-)
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XLOC_013439 AL935295.2 non-coding downstream 434138 24741499 ~ 24746401 (-)
XLOC_013437 NA non-coding downstream 618655 24497624 ~ 24561884 (-)
XLOC_013455 dre-mir-184-1 non-coding upstream 977867 26203303 ~ 26203389 (-)
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XLOC_013467 NA non-coding upstream 1829410 27054846 ~ 27066350 (-)

Expression


Co-expression Network