XLOC_013511


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013511
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 32782613 ~ 32815354 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00027362
tgctttgttttaacCATCTCCCCTTCTCCTCAGGTTCAAGCACTCTGTTTGCAAGGATAACAGGTAAAAGCCTCAATAAATTCCAATTTTGAATGGCCTGACCTGCCAGCTTCATTCCATGCCAACTGACCTCACAAGGCTTTGAGAAAGCATCAGAGCCATTATATTTAAACTGGCTGATTCAACGGTTAAGTATTGGGAGATGCAAAGGACAAAAGTGATCCCAAAGGCAGTATGACGCAACATACAGGACCACTCAGTGGGCCGACCAATAAACACCAGTATTCCCTTGGACACTGCTTGCAGTTAACCGAATCTGGAATGAAAGTCATgatcagagagagaaagagagagaaagaagaaaacaaaatgtacaaCTAATCGGTTGATGATATGAGGTGATAATTACCTGTCTCATTACTAATTTCTCCATCTGCACATGGAACACAGTCATAACAGCAGACAGGTCTTCCTTTCTGAGCAGCCTTTCTGGTGCCTGGAGAACAGCTTTCGCTGCACACAGACCTTGGTTTCttcatgtgttaaaaatacatgcatttaaaaacattgaacCTCATGCATTTctcataaatttattatttttgtatatactTTAGTACATTGTGAGTACTTTGCAcataaaatataacttaaaattaATAACCCAAAAACTCCCCTGTGAATTCATTAgtattttatgaacatttttaaaatttaatttagttaaatgAGTATGTTCATGAATTCCATTGTAAGTAGGGCTTATGTGCAAATTCATTTATAAAGTACTGTTATGTAGATTACATATGCAGAAATTTAGTGGAGTATTCCAGTCCCTGAACAATCtaaagtttgtttattatatatctcaaaaatgcaaaaaagtcCAACAGGCCATATGACTAACAATAGTTTTTCAATTAAAAGGTCCACCAAAGGATTTACGCAGTAGCGTAATCCTctaatttattttgaatataaaaaTGCAGCTAcccatttatataaaaaaatatatttgaatagtTTTTAAAGTGTTGTGTTTTTTAATAGGTTTTGC
>TCONS_00027363
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>TCONS_00027364
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Function

GO:

id name namespace
GO:0005737 cytoplasm cellular_component

KEGG:

id description
ko00904 Diterpenoid biosynthesis
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00027362 False 1057 lncRNA 0.35 3 32782613 32814481
TCONS_00027363 False 1132 lncRNA 0.38 2 32805784 32814560
TCONS_00027364 True 6410 lncRNA 0.36 1 32808945 32815354

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013510 olfcg9 coding downstream 73285 32674212 ~ 32709328 (-)
XLOC_013509 BX908401.2 coding downstream 255509 32525411 ~ 32527104 (-)
XLOC_013508 NA coding downstream 473050 32308476 ~ 32309563 (-)
XLOC_013507 BX649622.1 coding downstream 634983 32146708 ~ 32147630 (-)
XLOC_013506 olfcw1 coding downstream 642719 32135370 ~ 32139894 (-)
XLOC_013512 NA coding upstream 81211 32896565 ~ 32899998 (-)
XLOC_013513 NA coding upstream 222480 33037834 ~ 33039857 (-)
XLOC_013514 NA coding upstream 227408 33042762 ~ 33047444 (-)
XLOC_013515 CABZ01032906.1 coding upstream 259364 33074718 ~ 33080454 (-)
XLOC_013516 CABZ01032906.2 coding upstream 265489 33080843 ~ 33085006 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 13240382 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013505 NA non-coding downstream 740251 32039501 ~ 32042362 (-)
XLOC_013504 BX908386.2 non-coding downstream 773557 32005058 ~ 32009056 (-)
XLOC_013520 CU463109.1 non-coding upstream 899003 33714357 ~ 33735250 (-)
XLOC_013521 NA non-coding upstream 967110 33782464 ~ 33796612 (-)

Expression


Co-expression Network