XLOC_013512


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013512
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 32896565 ~ 32899998 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00027365
AGACATACAACTTACGTGGTGCTCTGTCTTGTAAAGGCCGCAGCACAGAAAATGTGTCCTCTGTTGGATTGTACAGAAAATGTTGAGTTACCTAGTGTGGGTATGTGCAGCAATTTTCCTTCTGGGTTCTTATTTCAAATACCAATGaatctgttatttattttgttttttaccttAATTTTCAGGTTGGGGTTTATCCCAAGTGTCTTGGTGCTCCACTTCCTGGCAGAACCTCACAGGTACATCTGGAGCTGAAAATGCAATTATTTTCTTTGCAATTATGAAATGTTATTTGACATTTTCAATTGTAATACCTGGTTCAGAGAAGATTCAGTCTTTAAAGAGGCTTTCATCTTTTGGCAGAATAAGCAGATCATGAAACATACAATTTGTGCACAATTATTATGGAAGTCGATATCTGGTTATACTGACAGTGATAAGGGAGTCATAGTTTTACCTGCTAGTAACAATGAAAATTTAAGGATAGGAGAAGGATTTACAAGATTCTGAAAGATAATATCTTTTAACATTTACAAGAAGAAGTGGTCCTGTCCTTCTAGACCAGTTCTCATCTTATGCCTATGAAGTTCTCAGTGTATTTCAGCTTGTGGTTATTTTTGAGTGGATACATTTTGAGACATTGTATCCCATTGTGTCATTCTTTGACACAGAAGCTGACACATTGTACTTGCCAGTGACTAAAGGGTTCCTGATGCTTTCAAACCTAACTCTTTCAATGATGAAGCGGATGAATCTTTCAGTAAAGGAAATTGATTTTGAAGTGAGCACTGAAAACTTCTGGAAGATAAATTCTTTAAACAGATACAAAGGGAGTGGTGCTTTCAACCTATGCCTATAAAAGTCTCAGGGCATTTTACAACATTTCTGCGTGTGATTCTTAAGTGGGTACAATTGATACATTGAGTCAAATTGTGTCATTCTTTGACACAGAATCTGAcacattgtatttgttttggcTCTGGCAAACTGGGTTTCCTAAACTATTCACCTTAATTACTGAAATcctattttataaaattattttcttctCGGCCAGTTTATTGTGACCCATTATGTTTAAATGTTAGTTTCCCCTATGAGCATTTCTTGTCCAGTGGACTCAATTTAAAAGTTAGCTTGTGTTAGACTTTCTCCTAGccatataatatacagttgaagtcagacatattatcccccctttgaattagtttttcttgtttttaaatattttccaaatgatgttgaacagaggaGGAAGGAAACAAGGAAACAATCCTttaacaaggaaattttcacagtatgtctgataatatttttcctctagagaaagtctcatttgttttatttcagctagaataaaatcagtttttaattatttaaacccattttaaagtaaaaaataattagcccctttaagctttatttttttctgatagtctacagaataaaccatcattatacaataacttgcctaattaacctaatctgcctagttaaactaattaacatagttgagcctttaaatgtcactttaagctgtatagaagtgtcttgaaaaaatatctagtcaaatattatttactgccatcatggtaaagataaaataaatcagttatcagaaatgagttattaaaactattatgattagaaatatgttttaaaaaatctgctctctgtaaacaaaaattggggaaaaaataaactggggggctagtaattctgtataatatgtataatatataactgtatatattatttaagtgacttttacttaaactaaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagattgatTTGGAAGAGGTACAATGTACTTCTATTAAAAATAGGTTcagaatattacatttatttatatttgtgcacaaaCTGTAGGTGAGTGATGTCTATTCAGCAATCGGAATCATGAACGAGCCTGTAATTGAGTCAGCTTTTGAGTCATGAATGCTGTGAAGCTTTTACAGTTTGTTGTTACAGTATTCATGTAAAGCGAGTTACCTTGACTAGTGGAGGGAATTTCAAAACAGGCCTGCTGTTGCTTTTCTGTAGCTTTTTGGTGGTCACGGACAAATGCTGTTGAAACATTACAGATGAAACAGATGTTATATCTgtctaacaaacaaaaattacattgTACTGCACAGATCTTTATAGCTTGAGAGTGCTGTTGCTTCTAATTAGCAATTAAAAGTTATGTGTGCCTCTTAAAATGTAATACTCAATTTATGAATGTAATAACAgtagttttttttgcaaaatgttaaaataacaatattactgGATTCAGCTGAAAACATTATGGTAAAGCACATGTCACAAGAGCTTgtgcattacatttaatttactgtTATTAAGGAACATTTTTGAGCATATCACAATGTACTTAAAACATCAAATATCTGTTTTACTAATTAAAACttacaattacatttacatttacagcatttacatGATGTTAGCTAAGGTCGTACAAAAggacctgaaaaagaaaaaaactgctcAGTGATCATACATACACTTTTGTCTGGCAGTAATACAAGTGGTGTATTTTTACCTTTTGCCCTGATATGTTTTCGGGGTGTTGGAGCTTTTGGTGCAGGTGGGACCCTTGGTGTTGGtagacttttttctttatttagtttctttttttttgtaggaaGTATCGCAAGGCTCATCATCTGATGTGTATATTTTCTTTCTATGATCACAATCAGGGTAGTTAATTTTACAAAGCATGATTGGATTATAacaatgtcttgttttttttaaatgtaagaagaagaaaacacaaacaaacttaaaaataagtTCAATATAATTTTTCTAGTAAAAGTTTTTTTCCATCATTCTTAAGAAAGTTAGGAAATGGCCaaaatataatagtaaaaataacgaaacctttgcttgtttaaatctggcataattgtgtattttttcatgttgcaaaaatacaaacaaacagttGATGATACATTTAAAACTAAACATACCCGATTTACCTGATAAGTGTGATTGAGATGTAAAAACTACGGCtgaatttaatattataattaaatatatttacttttgtTACTCACATGAACTTTGTTTAGCTTCAGAAGActgaatatttttgttaaaagtaaaatgtgtgttttgacAACTTACTTGGGAATTCTTTTTGCAGGCATTTCAGATTCCGAGATGTCAGATGTGTAGCATGCCTGTTTCCATTTCTTTGAAATCTTGTCAAAAGATGCTGAAAGAAATAGAGTATGTAACAATTCATGAATGTAATAGTCTATGGAATGTCATGTATTATTGAATTCATCCattgtttaatattgtttatttacaattaacTTCTGTGTACCTGACTCGTAGAATTCTGGCCTGATGC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00027365 True 3434 lncRNA 0.31 1 32896565 32899998

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013511 NA coding downstream 81211 32782613 ~ 32815354 (-)
XLOC_013510 olfcg9 coding downstream 187237 32674212 ~ 32709328 (-)
XLOC_013509 BX908401.2 coding downstream 369461 32525411 ~ 32527104 (-)
XLOC_013508 NA coding downstream 587002 32308476 ~ 32309563 (-)
XLOC_013507 BX649622.1 coding downstream 748935 32146708 ~ 32147630 (-)
XLOC_013513 NA coding upstream 137836 33037834 ~ 33039857 (-)
XLOC_013514 NA coding upstream 142764 33042762 ~ 33047444 (-)
XLOC_013515 CABZ01032906.1 coding upstream 174720 33074718 ~ 33080454 (-)
XLOC_013516 CABZ01032906.2 coding upstream 180845 33080843 ~ 33085006 (-)
XLOC_013517 olfcd3 coding upstream 190445 33090443 ~ 33093741 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 13354334 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013505 NA non-coding downstream 854203 32039501 ~ 32042362 (-)
XLOC_013520 CU463109.1 non-coding upstream 814359 33714357 ~ 33735250 (-)
XLOC_013521 NA non-coding upstream 882466 33782464 ~ 33796612 (-)
XLOC_013522 NA non-coding upstream 1046344 33946342 ~ 33949859 (-)

Expression


Co-expression Network