XLOC_013515 (CABZ01032906.1)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_013515
gene name CABZ01032906.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 33074718 ~ 33080454 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00026630
ATGGCCTTCATGTCACACAGAGAGATCAAATTATTAGTAGATGAGCTCTACAAGCAGAATGTCACAGGACTGCAGTGGATTGGCAGTGATGCCTGGATCACAGATGACTCTCTAGCAGATAtctatggtcacactttacttaCTGGCTCTATTGGATTTGCTGTCCGCAATGCTCAAATACCTGGACTGGGCTCTTTTCTACAGAAAGTTAATCCCTCTCAATTTCCTAACAGCATATTTGTTAAAGATTTTTGGGAGCATGTCTTTGACTGTTCATTCACTACTAGTAAATTAACAAAAAGGTGTAATGGATCTGAAAACTTAAGTGATGTGCAAAACTCTTTTACAGATTTGACTGACTTAAGGTtctcaaacaatatatataaagcTGTTTATGCGGTAGCTCATGCAATTAATAATCTACTCTTATGTGAGGAAAATAAAAGCTCCAGTCCTAACGCCTGTCTGAAACTTGCAGAAATAAAGCCTTGGCAGCTTTTAAACTCCTTGCAAAGTGTAAATTTCACAACACCTGGGGGAGAAAGTGTCTTCTTTGATAGCAACGGGGATTCACCAGCAAGATATGAGCTGATCAATCTTCAAAGTGTTGACAGAGGCAAAATAGATGTGGAAACTATTGGCTACTATGATGCCTCTCTGCCTAAAGATCAACGGTTCTCCATGAATAATGTTAAGGTAGTCTGGAGAGAAGGGGGAGATCAGGTGCCTGTATCTGTGTGCAGTACAAGCTGTCCCTCAGGCACCAGGAAAGCAATGCAGAAAGGAAGACCGGTCTGTTGTTATGACTGTATACTGTGCCCACCAGGAGAGATTAGTAACAAAACTGATTCAGTTGATTGCCTTAAATGCCCTGTTACACAGTGGTCAAATACAAGAGGAGATGCCTGTATCCCAAAAGAAATTGAATTTTTGTCATATGATGAAATAATGGGAATACTTTTGGGATTGTTTTCTTTAATTGGGGCATTTTTTACTATAGTAGTCACACTTATTTTCTATATTTACAGAAGCACACCTATAGTAAGAGCTAACAATTCAGAACTGAGTTTCCTACTGCTCTTCTCACTGACTCTGTGTTTCCTCTGTTCACTCACTTTCATTGGTCGTCCCACTGAGTGGTCGTGTATGTTGCGACACACAGCGTTTGGGATCACTTTTGTCCTCTGTATCTCATGTGTTCTGGGGAAAACATTAGTGGTGTTAATGGCCTTCAAAGCTACACTTCCAGGAAGTAATGTCATGAAATGGTTTGGGCCTCTTCAACAAAGACTCAGTGTTGTTAGCTTTACTTTTATACAGCTCCTTATATGTGCACTTTGGTTAATATTATCACCACCATTTCCATATATGAACATGAAGCATTACCAAGAAAAAGTTATTTTAGAATGCAATGTAGGTTCAGCTACTGGTTTCTGGGCTGTACTGGGTTATATTGGTCTCCTGGCTgtcctttgctttgttttggcttTTCTCGGAAGGAAACTACCTGACAATTTCAATGAGGCTAAATTCATCACATTCAGTATGCTCATATTTTGTGCTGTATGGATCACATTTATCCCAGCTTATATCAGCTCTCCTGGAAAGTTTATCGTAGCTGTGGAGATATTTGCTATTTTGGTGTCATCCTTTGGATTACTTTTCTGTATTTTCTTGCCAAAGTGCTATGTAATTTTACTGAGACCAGAAATTAACACTAAAAAGCATGTCATGGCGAAGATAAATAAATAGTCATTAATATAAACTGTACTTGCTAAAATAATACATTGCAATTTGTATATTATAAAAGGAAAATAACTGAGATATAAACATGTTTTGTGCTATAGATAAATTCATTGTCAGACATTACACTACAATAAATATACCTGTAAGAAAAGTTGTGTTTTTTAGCATAGAGCTAAAAAGCTGTTAATTATCATAGAGCAGATTTGAGATTTACCAGACATTTATGTTACATTTTCATAGTCACAAAACACTTCTAATACAATAACGccaaagaagaaaaataattatagactcaattattataaaacattataaaaagaaaaaaaatatttttaacatagCAAATTGCACCATTGTAACACTGATAGAAAAAGAAATTTAAGTCTTATagagctttaaaaaatatatatatatatatacatacacacaaacacacacctagtTCTTCAATTTTATGAATCTTGCTTATATATATTGCCATTTTTGATTcacctataataataaaaaaattgcgtATAATGATACCCAACAATGCCCAATAAAACTCTCAACCATAAAGATTATATTAAACTTACTgaacaaaaaagataaaaatcaaataattgaCAGTCTCATACCCtacataaaactatttttttttccacaaacagGACATAAACTGCATACATTTGGGTTAATCACAGAATAAACAGCAACTGTACCATGTAAAATTCACTTTTAGAGATCGCCCTTTTTTTCCAATGGAAGTTTATAAAAACTCTCCATACAGGTTGTATGTCCTGATCCAACCCTTATAGAgaggaggaactatgacgtcactttgtaggctaatcggctgctagcataaaactggttccctcgtgaaaatccctttcaaatttcccataggcttttcgaagattgcaaataataagctctgtgttcaaacactgttcattacacttacatgttttgtccagccggataatcctcacacgaaaatacaactttgagcacttttggatcttaaatgcaaacgcaagatttgaaaagctaacattaggctataaatggACTACACTGCCCTCAGGGCGCCcgcctgtgacgtcagccccaccctgctacagacgacttgtcaagcttatttttagaaataatatccCTGACAAAGagtctctgtttattatattataatccacgctatatattataaacaaataaatacgcaaaaacactTACACCTACGTGCCTTTTGGACCGTTTTTACGTggtaaatacatctgttttgctttgcggttgttctaaaagttttaaaactgcgtgtataaatctgcctacatTGTATTAtcatcagacatatttaaataagtgtatcgcgcGCGTGCACACAGCTTGCTTAtcttaacagacgacagaaatgaggcgtgaggaggaacaagtctatcaaatgcctgcaagttccatcatcatggacacagagcaacatatttaatattccttttatgtcacgacgtacagcgaaaagcagcccaatacagtcacatctgctatacgttttatgaaggagtgtaaatattgcagttatgacagagtaaaatgtgttcagatgaagaaaaaaagacgagaaatcactagatcacgttaaaatgacagtcaacaacttgatagcaaccttctttttaaagaagcatggcCGAATTAAAAATTGAAGAgggtgctgtaactgatgtgttttatgtcatagaacaaaacgtgaaagtatgtTGAATTTGTGttagccacggaccttatttaagcgattttactgaaccccatacaaaaaacccattgactttgggacgagggaaccggaagtgctaaaatgctgaCTCGCtcccgggtttttgcatacaaattgatgtcatagttcctccacacTATTGGTCTCTTCAAACAGTGTCAACTgttcatttcaattttttttcttgcatttaaaacgtttgtaaaaaatgttttactaatAGCCATATTACTTGTAGAGTTAATTACTTTAGGAATGTGGTCTTTGTTGTTGGGAACTAatcaataaatcattatttttttcttaaaaatgctACATATTCTTAAGACCCCTTTATATAAAGTAGTCTATTTAGTTTAATGTTCCTAAAGTCAAACAAATGTCTTAGCCCAGGTCAGCAGTTTGTCTCTAAACAAAGCTAGCAACATGTCATTAATTATCATGCACTATTTAATACTCATCACTGTCAACTGTATTCTTCGACAAATTCAATGGTTTCTATTCATTAACAAAACTCTTATTGGAAAAACTCCACTATGTTTGCAGTCACTTCTTATCATTCAGGAAACACGTCGAAATCTGTGCTCTAGTAATTTCATTAACCTTTGCATACCCAAAGTTCACACTTGATTTGGTCACCactcttttcagttttctgctgctgatgcttggAATCATCTGCAGCAGACCTTAAAGCTCAAGCCTTTCATTTCACTATCATCTTGTAAAAAATTCAATTCAGtcaatagttcattcattcagtcattttcttgtcggcttagtccttttattaatccggggttgccacagcagaatgaaccgccaacttatccagcaagtttttacgaagcggatgcccttccaggcgcaacccatctctgggaaacattcacacacacactcatacactacagacaatttagcctacacaattcacctgtaccacatgtctttggactgtgggggaaaccggagcacctggaggaaactcacacaaaggcagggagaacatgcaaactccacacagaaacgccaactaagccgaggttcaaaccagcgaccttcttgctgtgagatgacagctcTACCTACCGCGCCACTACCTCGCCCGTCAATAGTTCATGATcactgtaattgtttttagttttttgttggtTTCATATGTTATTGTCTGCATTTGTgaaattgttatattatataagttatagttattaataaaataaataaagttatatatattaataaaacttatgcaatctgcatccccgaaatgaaagtacaaagactgccacctggtggtgcaaagaaaaaactttttttatatgaactttttagattgctttagtacaatttgtgtatgataatagaaatgcagaatatgtgactttttaaaaaaataaataatacattaatgcagtcataaacatgtgttggcagttaatatgccagtgattatgcttcacaaaagttgcattatgcctttaccaatatcaaa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Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112564

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00026630 True 5462 mRNA 0.36 4 33074718 33080454

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013514 NA coding downstream 27274 33042762 ~ 33047444 (-)
XLOC_013513 NA coding downstream 34861 33037834 ~ 33039857 (-)
XLOC_013512 NA coding downstream 174720 32896565 ~ 32899998 (-)
XLOC_013511 NA coding downstream 259364 32782613 ~ 32815354 (-)
XLOC_013510 olfcg9 coding downstream 365390 32674212 ~ 32709328 (-)
XLOC_013516 CABZ01032906.2 coding upstream 389 33080843 ~ 33085006 (-)
XLOC_013517 olfcd3 coding upstream 9989 33090443 ~ 33093741 (-)
XLOC_013518 olfcx3 coding upstream 168542 33248996 ~ 33254039 (-)
XLOC_013519 olfcu1 coding upstream 252957 33333411 ~ 33337703 (-)
XLOC_013520 CU463109.1 coding upstream 633903 33714357 ~ 33735250 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 13532487 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013509 BX908401.2 non-coding downstream 547614 32525411 ~ 32527104 (-)
XLOC_013521 NA non-coding upstream 702010 33782464 ~ 33796612 (-)
XLOC_013522 NA non-coding upstream 865888 33946342 ~ 33949859 (-)
XLOC_013527 NA non-coding upstream 1146898 34227352 ~ 34227899 (-)
XLOC_013529 NA non-coding upstream 1471074 34551528 ~ 34554617 (-)

Expression



Co-expression Network