XLOC_013550 (AL627088.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013550
gene name AL627088.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 37409823 ~ 37415445 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00026673
AAGAGGGAAATAGAAGAAACAAGAACCTGGGAGTCAGTTGTGAATTTAAAGCTGCCGATGGCACAGCACAGGAGCAGATTCTGCTGCACACTGATGCATCTCACAGTCAGGAGGGTCAGTCACAGGAGGACAGTCATGTAGAGATCCTAGACAGCGAGAGAGGAGGTGGTTCAAAAAAGTCTATGTCATGCTGGAACAAACATACCTGAACGGGTCGACACGGCTTGTCAGCTACTTACATTCACACTCTAACATCTCTAACCCAGCAGTTTCACTTCAATTCACACTCTGCAGCGGCTGTGACAGACAGGATCAACCCTGGGAAGACCCGCCATTCACAACTTCAGTTAAGTGATTTAAAGCAGTTAATGTGTGAAGGACCTTTAAataaagaCTACATCATGAGGGACAGATGGGCGGAAATTTTAGGGGAAA
>TCONS_00027380
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095600

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00026673 False 435 processed_transcript 0.46 3 37409823 37415353
TCONS_00027380 True 4729 lncRNA 0.31 1 37410717 37415445

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_013549 cep126 coding downstream 2588 37380125 ~ 37407235 (-)
XLOC_013548 yap1 coding downstream 54157 37283765 ~ 37355666 (-)
XLOC_013547 six5 coding downstream 157787 37245331 ~ 37252036 (-)
XLOC_013546 six9 coding downstream 168708 37237714 ~ 37241115 (-)
XLOC_013545 map3k10 coding downstream 402529 36948879 ~ 37007294 (-)
XLOC_013551 NA coding upstream 126270 37541715 ~ 37551134 (-)
XLOC_013552 luzp2 coding upstream 421515 37836960 ~ 38088099 (-)
XLOC_013553 si:dkey-10o6.2 coding upstream 793610 38209055 ~ 38245062 (-)
XLOC_013554 caprin1b coding upstream 831495 38246940 ~ 38271298 (-)
XLOC_013555 NA coding upstream 874636 38290081 ~ 38297955 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 17867592 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013544 NA non-coding downstream 490836 36902021 ~ 36918987 (-)
XLOC_013543 NA non-coding downstream 522354 36849149 ~ 36887469 (-)
XLOC_013542 NA non-coding downstream 675921 36714639 ~ 36733902 (-)
XLOC_013541 BX950224.1 non-coding downstream 944357 36455307 ~ 36465466 (-)
XLOC_013536 CU138549.1 non-coding downstream 1836528 35573181 ~ 35573295 (-)
XLOC_013556 NA non-coding upstream 961233 38376678 ~ 38378205 (-)
XLOC_013557 NA non-coding upstream 1343889 38759334 ~ 38768498 (-)
XLOC_013558 BX936456.1 non-coding upstream 1443674 38859119 ~ 38865170 (-)

Expression


Co-expression Network