XLOC_013557


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_013557
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 38759334 ~ 38768498 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00027384
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>TCONS_00027385
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>TCONS_00027386
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00027384 False 6182 lncRNA 0.38 3 38759334 38765900
TCONS_00027385 False 9158 lncRNA 0.37 1 38759334 38768491
TCONS_00027386 True 1048 lncRNA 0.42 4 38759334 38768498

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_013555 NA coding downstream 461379 38290081 ~ 38297955 (-)
XLOC_013554 caprin1b coding downstream 488036 38246940 ~ 38271298 (-)
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XLOC_013552 luzp2 coding downstream 671235 37836960 ~ 38088099 (-)
XLOC_013558 BX936456.1 coding upstream 90621 38859119 ~ 38865170 (-)
XLOC_013559 NA coding upstream 100905 38869403 ~ 38870587 (-)
XLOC_013560 mapk6 coding upstream 401629 39170127 ~ 39288894 (-)
XLOC_013561 leo1 coding upstream 524413 39292911 ~ 39321484 (-)
XLOC_013562 NA coding upstream 614228 39382726 ~ 39389542 (-)
XLOC_013384 BX323829.1 misc downstream 19217103 19542102 ~ 19542231 (-)
XLOC_013551 NA non-coding downstream 1208200 37541715 ~ 37551134 (-)
XLOC_013550 AL627088.1 non-coding downstream 1343889 37409823 ~ 37415445 (-)
XLOC_013544 NA non-coding downstream 1840347 36902021 ~ 36918987 (-)
XLOC_013565 BX908722.2 non-coding upstream 818048 39586546 ~ 39586665 (-)
XLOC_013566 BX908722.1 non-coding upstream 847277 39615775 ~ 39615905 (-)

Expression


Co-expression Network