G520100


Basic Information

Item Value
gene id G520100
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000364
NCBI id null
chromosome length 520240
location 20310 ~ 318572 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU596654
TTTCAGGTACAGTAGGTTTATTAAACATAGTAAGAAATACAGACAGAGATCATAATACAGTGGGATTGGCTCATCTTTCAGGAAGGTCAAAGGTCATGGTATAGATCACATGGGTCTCATCTCTGAAGGTGCTGCTAGATGCAGAAGAAGCTCATGAGAGTGTTTGACATCCTCTATTGAAACACTTCATCATTGACTCTCTCTGCTCTGATGAAAGTGAAGTATATTAATATATTGAATTATTTGTGTTCATTACAGCACTGAGAGCAGCAGCGGGACGATCACATGACAGATATAGAAAGAAAACACTGACATTATTTGTTTTTATCTTTTCTCAGAGTTGTCAGAGCATCAGGTCTGTAAATTCAGTTCAGGAGGAGGTTTATTTAAAGTAAACTGGATTAGATCAGAATAATTGTGCTCATACTTTCACTGATCAGGAGTTTACTGTATGATCACATGATCTGGGTTTATATATTTTACATTTTTTAATAAACTGACATTTTATCAATTTATTAAATTATTTTTAATAGTATTTAAAATTAAAAGTTTATTTTTTAAAATGATTGTAAATGAATAAGTGTTGTAAATCTGTTTTGAATTCAGTTGTTTTTCAAATAAAGGTTTCAGAGTCAGTGAAATCAGATTTTGTGTATTTTTTATAAACTACATGAAACGAGTATTTCCTCAGTATTTAAAACTTGCAATGGTTTTAGTTTTACGTGCCCTGAACAGAAGATCAAACTAAAACAGCTGCACTTTTGCTATAAAGAATAACTGTATAAATGCACTGATATGAACCCCATCATTTAAAAAAGTCTTTATGTATTGGTCCACTATTATTACAAAAAGGTACACAGTGTATGTTCTCGCTAAATTGCTCCCAAACGTAAGATAGTAATGAATATGTTCCCCTTAAAATATTGTAATAAGTATTCTAAAATACTTACAGTATAAATAATTTGTTAATTTTCCCAGTTGTTATCCCTTTATTCCCCAAACTTTACATATTGTTCCCTTATAGCTACACATACATACTCTATAGATCCACTATAATTACTGAAATTACGCTGTAAATTCATTTACTGACGCAGTACTTTACAGGCTGTAATCTAAAGCGTTACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGTAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGTTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATCCAGAACAATAAACCCAAAACCCAGGACTGAAAAGTTTATAACCAACCCTAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTACTGATGATGGACTCTACAGGGAGTTTAGTCACTATGTTATTGTGTCTGAATGAGTAACTGGAGGAAGAGCAGAACAAACTCCAGGACTGATCATTAGATCCAAACACACACTCATCACCCCGTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATAGACACACCACCACTCCACTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGCCACACGTCATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGGCTGGACTGTGTTAGTGTAAGTAATCACTCTGTCCCCCTCAGACAGACGGAGGTGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGATTGAGCTGATGGGAAT
>TU596657
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>TU596658
TTTCAGGTACAGTAGGTTTATTAAACATAGTAAGAAATACAGACAGAATAATACAGTGGGATTGGCTCATCTTTCAGGAAGGTCAAAGGTCATGGTATAGATCACATGGGTCTCATCTCTGAAGGTGCTGCTAGATGCAGAAGAAGCTCATGAGAGTGTTTGACATCCTCTATTGAAACACTTCATCATTGACTCTCTCTGCTCTGATGAAAGTGAAGTATATTAATATATTGAATTATTTGTGTTCATTACAGCACTGAGAGCAGCAGCGGGACGATCACATGACAGATATAGAAAGAAAACACTGACATTATTTGTTTTTATCTTTTCTCAGAGTTGTTCAGAGCATCAGGTCTGTAAATTCAGTTCAGGAGGAGGTTTATTTAAAGTAAACTGGATTAGATCAGAATAATTGTGCTCATACTTTCACTGATCAGGAGTTTACTGTATGATCACATGATCTGGGTTTATATATTTTACATTTTTTAATAAACTGACATTTTATCAATTTATTAAATTATTTTTAATAGTATTTAAAATTAAAAGTTTATTTTTTAAAATGATTGTAAATGAATAAGTGTTGTAAATCTGTTTTGAATTCAGTTGTTTTTCAAATAAAGGTTTCAGAGTCAGTGAAATCAGATTTTGTGTATTTTTTATAAACTACATGAAACGAGTATTTCCTCAGTATTTAAAACTTGCAATGGTTTTAGTTTTACGTGCCCTGAACAGAAGATCAAACTAAAACAGCTGCACTTTTGCTATAAAGAATAACTGTATAAATGCACTGATATGAACCCCATCATTTAAAAAAGTCTTTATGTATTGGTCCACTATTATTACAAAAAGGTACACAGTGTATGTTCTCGCTAAATTGCTCCCAAACGTAAGATAGTAATGAATATGTTCCCCTTAAAATATTGTAATAAGTATTCTAAAATACTTACAGTATAAATAATTTGTTAATTTTCCCAGTTGTTATCCCTTTATTCCCCAAACTTTACATATTGTTCCCTTATAGCTACACATACATACTCTATAGATCCACTATAATTACTGAAATTACGCTGTAAATTCATTTACTGACGCAGTACTTTACAGGCTGTAATCTAAAGCGTTACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGTAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGTTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATCCAGAACCAACCCTAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTACTGATGATGGACTCTACAGGGAGTTTAGTCACTATGTTATTGTGTCTGAATGAGTAACTGGAGGAAGAGCAGAACAAACTCCAGGACTGATCATTAGATCCAAACACACACTCATCACCCCGTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATAGACACACCACCACTCCACTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGCCACACGTCATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGGCTGGACTGTGTTAGTGTAAGTAATCACTCTGTCCCCCTCAGACAGACGGAGGTGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGATTGAGCTGATGGGAAT
>TU596660
AATGATTGTAAATGAATAAGTGTTGTAAATCTGTTTTGAATTCAGTTGTTTTTCAAATAAAGGTTTCAGAGTCAGTGAAATCAGATTTTGTGTATTTTATAAACTACATGAAACGAGAGTATTTCCTCAGTATTTAAAACTTGCAATGGTTTTAGTTTTACGTGCCCTGAACAGAAGATCAAACTAAAACAGCTGCACTTTTGCTATAAAGAATAACTGTATAAATGCACTGATATGAACCCCATCATTTAAAAAAGTCTTTATGTATTGGTCCACTATTATTACAAAAAGGTACACAGTGTATGTTCTCGCTAAATTGCTCCCAAACGTAAGATAGTAATGAATATGTTCCCCTTAAAATATTGTAATAAGTATTCTAAAATACTTACAGTATAAATAATTTGTTAATTTTCCCAGTTGTTATCCCTTTATTCCCCAAACTTTACATATTGTTCCCTTATAGCTACACATACATACTCTATAGATCCACTATAATTACTGAAATTACGCTGTAAATTCATTTACTGACGCAGTACTTTACAGGCTGTAATCTAAAGCGTTACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGTAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGTTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATCCAGAACAATAAACCCAAAACCCAGGACTGAAAAGTTTATAACCAACCCTAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTACTGATGATGGACTCTACAGGGAGTTTAGTCACTATGTTATTGTGTCTGAATGAGTAACTGGAGGAAGAGCAGAACAAACTCCAGGACTGATCATTAGATCCAAACACACACTCATCACCCCGTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATAGACACACCACCACTCCACTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGCCACACGTCATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGGCTGGACTGTGTTAGTGTAAGTAATCACTCTGTCCCCCTCAGACAGACGGAGGTGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGATTGAGCTGATGGGAAT
>TU596661
TTTATTTCCCAAACTTTACATATTGTTCCCTTATAGCTACACATACATACTCTATAGATCCACTATAATTACTGAAATTACGCTGTAAATTCATTTACTGACGCAGTACTTTACAGGCTGTAATCTAAAGCGTTACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGAAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGGTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATTAACACAGTTTCACTGATGATCCAGGATGATAAACACTAAACCCAAGATAGAGCGGTTTATAACCAACCCCAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCTCTGTGATCCACATACACTCCTATTCTACTGCTGATGGACTTTACAGGGAGTTTAGTCTTTATCTTATTGTGTCTGAATGAGTAACTGGAGGAAGAGCAGTACAAACTCCAGGACTGATCATTATATCCAAACACACACTCATCACCCTCTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATATCCACATCACCACTCCTCTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGACACACATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGGCTGGACTGTGTCAGTGCCAGTAATCACTCTGTTCCTCTCAGACAGACGGAGGTGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGATTGAGCTGATGGGAAT
>TU596665
ACACACACTGATCTCACTGTCTACATGAGGATTCATTACACACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGAAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGGTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATGATCCAGAACAATAAACCCAAAACCCAGGACTGAAAAGTTTATAACCAACCCTAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTACTGATGATGGACTCTACAGGGAGTTTAGTCACTATGTTATTGTGTCTGAATGAGTAACTGGAGGAAGAGCAGAACAAACTCCAGGACTGATCATTAGATCCAAACACACACTCATCACCCCGTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATAGACACACCACCACTCCACTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGCCACACGTCATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGGCTGGACTGTGTTAGTGTAAGTAATCACTCTGTCCCCCTCAGACAGACGGAGGTGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGATTGAGCTGATGGGAAT
>TU596664
ACACACACTGATCTCACTGTCTACATGAGGATTCATTACACACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGAAATGAAGAGAAAATAAGAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGGTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATGATCCAGAACAATAAACCCAAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTCCTGCTGATGGACTTTACAGGGAGAACAGTCGCTATGTTATTGTGAAAGAAGGAGTAACTGGAGGAAGAGCACCTCAAACTCCAGGACTGATCATTATATCCAAACCAACACTCTTTACCCCCTCCCTTCCTGCTGATGCTCTTATATGACACTGATATATACAGGGCAACAAACACATGTCCACTCCACTCAATCTCCCAGTAACAGCGTCGATCACACACACTCTCTCTACACAACACCTGACGCACATCAAATCTGTCTGGATGATCAGGATACGACTGAACTGTATCAGTGTAAGTAATCAATTTGTTACTCTCAGACAGACAGAGGAGTTTATTCACTGTGTTCAGATCCAGAGTGAGCTGATGGGAAT
>TU596663
ACACACACTGATCTCACTGTCTACATGAGGATTCATTACACACATTTATTCTGACATGTTATTTCACTGACAGAAGTTCAGCTGTAGTATTAATGAAATGAAGAGAAAATAAGACTCTATAACATCTCACTGTTACTGATTTATCATGAGCTCAAAGCATTATGGGTAGAATCTCTCTACAGTCTATTCTGATTCATCAACACAGTTTCACTGATCCAGAACAATAAACCCAAAACCCAGGATAGAGCGGTTGAGTGAATGTGGTCTGGACTGTGTGGATGAGGCTCATTGTGTCTCCAGAGACGCTGTAGAAGGACAGAGTTCCTGCACTGTGATCCACATACACTCCTATTCTCCTGCTGATGGACTTTACAGGGAGAACAGTCGCTATG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU596654 False 1833 lncRNA 0.36 2 20310 51409
TU596657 False 848 lncRNA 0.41 2 20310 50438
TU596658 False 1794 lncRNA 0.36 3 20310 51409
TU596660 False 1272 lncRNA 0.37 2 20310 50847
TU596661 False 845 lncRNA 0.41 2 20310 50438
TU596665 False 755 lncRNA 0.43 3 20310 318572
TU596664 False 734 lncRNA 0.42 3 284854 318572
TU596663 True 392 lncRNA 0.41 2 285191 318572

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000364_00002233_00008090 NA coding downstream 12102 2233 ~ 8208 (-)
CI01000364_00373309_00374559 NA coding upstream 54737 373309 ~ 374559 (-)
CI01000364_00391142_00398789 NA coding upstream 72379 390951 ~ 398930 (-)
CI01000364_00455879_00458332 NA coding upstream 137307 455879 ~ 458332 (-)
G520221 NA non-coding upstream 106151 424723 ~ 425045 (-)
G520238 NA non-coding upstream 122831 441403 ~ 441651 (-)
G520248 NA non-coding upstream 132625 451033 ~ 451562 (-)
G520259 NA non-coding upstream 144414 462986 ~ 463228 (-)
G520263 NA non-coding upstream 150148 468720 ~ 468944 (-)

Expression


Co-expression Network