G520020


Basic Information

Item Value
gene id G520020
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000364
NCBI id null
chromosome length 520240
location 56322 ~ 119677 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU596543
TTTTTTTTTTTTTTTTAAAATAATCAGATTTTATTGGCAAAATTTTCAGAAAATGAGATCAGTTACAAGAATGAATCCATTCACCAGCATCATATTGATTAGTAACAAAACATTTTACATGTCCCTGAAGAATTGTGTGATTATAAATTCAGCACAGTTTCAAGTAAATGGTTTCACAGTTTAGTTTTTTTGTTACATTTAATCAGAGAGAAGCATAAAATAGGGCATGTTCCTGATCTACACTACAGAGCAGTAATGTGTACATCAGTCTACTGAAGAGAAGCTGAACATTGCTTTTTGAACATTGCATTGATTTTATTACTGTTACATATA
>TU596536
GCGGCTGCTTGGGCCTGTAGTTAAAGCTCGTCTGTGATCTTGTCCCAGAACCTCCATGGCAATCAGGTTCAATCCATTGTTGTCATTCTTTATGCTGCTGATCAGTTTATAAAGCTCCGGGTTTTTATTTTTAATCTCGCTCACTGAGTTTGAGTTTTCTATGACCGTCTGAGCCAGTCTGATGGAGTCCTTCGGTGGAATATGGCTCGTGTTGAGTGTTCCTTTGTTGTTCTCACTGGACCTCCGAGCACTTTGA
>TU596539
GCGGCTGCTTGGGCCTGTAGTTAAAGCTCGTCTGTGATCTTGTCCCAGAACCTCCATGGCAATCAGGTTCAATCCATTGTTGTCAGTCTTTATGCTGCTGATCAGCTTATAAAGCGCTGGGTTTTTATTTTTGATCTCGCTCACTGAGTTTGAGTTTTCTATGAGCGTCTGAGCCAGTCTGATGGAGTCCTTCGGTGGAATATGGCTCGTGTTGAGTGTTCCTTTGTTGTTCTCACTGGACCTCCGAGCACTTTGAACACTTTTATATTCACCAACAAATCCAAGATGGTACATTTTGATTAGGATACGTTCATCACTTCTGATGAATTTAACACTCTGTAAGTATTCCTGCAGTGCAACGTCTGTCTCCTTTCTACTTCCTCCAGTTATGCTGTATTTTCTGGGGTTTTGGTGACAGAAGTCGTATCCTCTCTGGAGAATAAGCAGGGGTGTGTACGAATCAAGGTTCGTCTGGATCTCATTTTTCACTTTGTTGCGTAGCATCAATGCTTCCTCCATCTTGCTGCCAGTTGCTTGTGCTACAGCATGATAAAGAGCATTCTGATGATCCGAGTTAACGCTGATTATCTTGCCATCATCCTGGACAATGTCAAAATGGCCGTTGTACAACTGTGCATCAGCTCTGTTTTTAAAATAAAAAGTAACTACATTCAGTACACAAAGGTTATAAACATTAAAGGGGACCTATTATGCAAAATTCACTTTTGCATGGTGTTTGGACATAAATGTGTGTTGGCAGTGTGTGTACACAACCACCCTATAATGATAAAAATCCAACCACTCCTTTTTTTAATCCCCATAAATCATAAGCAGTGTCTCAGAACAAGCCGTTTCCAGATCCCTGGCAGTGTGACGTCACATTAGCCACAGGCCCCGCCCATGAATGTTGACAGACATAGAACCATTGACCGTTTGAACATAGAACCGCCCTGAGCGAGTTCACAATTCTCAGTTCCTCAATTCTTCCTCAATTCTACTGAAATTCGTTTATATCTGTGCAAATCATTTCACACTGGACTGTTGTGAAATGTTCATGTTCATGTCAATACAAAGGGACAATACAAAACAGAGATTGTGATAAAAATTTGTTACTCAAGGACAGATCAGTAAACTGTTCCTGATCCAGCTTACAGCCTCCAGAGTGATACTGGATACGGCAGTAAAGAAGGTGAGAGCACTTTATTACAGTTCATCAGAGTTTATTTACGAATATAAAGTTTACCAGTTTATTAAACACTACCTGAAAAGGCATAAGGTCTTTATATATTTGTTTACTGTTAGTTGTAACGAGTGTTTCTGTGTACTTCACTGTGTATGTTGATGATAATGCAAGAGAGAGAGAGAGAGTTTATGGATAATATTTTAATGCACACTTGCACTGTGTTTTATTAAGCTCTTACCGTGATTTTCTAGAGTGAAAACGTGTGCTTCATCTTTTGTGTGAAGTACAATAAACGTCATAAAACTCATTAAGTAAAGTCGAACAGGGTCCGGTACAACAGGCATATATTAATATAGTGGATAAAAACAAGACGACAATATAAGTTATAACCGTAATTGAACTAAACTATACTTGTTCTATCTCCATTCAGCATATATTTGCAGCTTCTGTCATTATAGTGCGTCCTGACTGAATCCTGAAACCGGAGAATCAGCTCTTGAAGCTCCGCCCTTTTAGGCAGAGCACAGCAGGTCATTTGCATTTAAAGGGACCACACTGAAACGGTGTGTTTTTGCTTAACCCCAAAAAGTGGCAATTTTAACATGCTGTAAAAAATGATCTGTGGGGTATTTTGAGCTAGACTTCACATATACACTCTGGGGACATCAGAGACTTATTTTACATCTTGTAAAATGGGGCATAATAGGTCCCCTTCAACACTAAAATGTATTTCTACACATAAGCAGTGTAATGCTCTAGTGATTAGTCTTACTGTGATGTATGAGGGGCTTTTGCAGATTTGGTTACTCTCAGTTTTATATCGCCTGCTGATTTGGTGGTTCCTGGGTAACGTTCCTCAGTGAGCTGTTTTCCATTTTCATCAACGACAGTGAGTTGAATCCCTTTTCCATCGAGCAGGTTACTTTTTGTGAGCACATATACATCGAGGGCTGTAACAGGATGATCAGTTTTGCTCATATCTTCTGTATACTGCATTAGTTTTGTTTTGTCCTCATCTGACAGCTGTTCCACTTCCTTGTGGCTTGCAGATTTCTTGTTGTGTTTTCCTCTTTGGTCATCAAAGAAACGCTGAGTCTTATGTCTGCGCATGACTTTGTCTACTGCCTGTTCTGCAGCACTGTTCAACTCTTTCTTAAATGTGCTGGTCATTAAAGAAGTTATATGTTCAGAACAGGAACTGATGAATTGCTCAGAAACTTTCTCTGCGATATCCTTTAGAAGGTCTCTTTTAAGGCGTTGTACATCCTGTAAACTGTGTCGTCCATCTTGGTCATACTTTGTCATTTCTTTCTCAAGCTCACTGATCCTCTCCAGTAAATCAGGAACAAATTTCTGTTGTATTATCTCCTTTGTGGGTATGGCACCCAATATTTGAGAGAGACTTGTTGAGTACTCAGATACTTTCAGGGCCAGCTTTGCCATTTCAAGCACACCTGACAGTTTTGCTTTATTCATAATCTCTGTTGCTGCTTTACACACATCAGAAAGTTTGCTGATAACGTCCTGTGCTGTGGTACAGTCCAGTATGAGGTGAGGAGTTATCTCTTCACAGAACATATCAAATGTTTTTTTTATTTGTTTCTCATAATTCTGGTCAATCTTGAAATTCTCTTTTTCCAAGGCAGCTTTCGGAATGCCTGAGCTGATAAATTCGACAAGATTCTGATCCAGGTCACTGCTTTGCTTCACTGATGAAGTAATGACATTCTGAAAACTGCTTTGTAAAATCTTCTTAAAGACTTCCTGAAGTGCTGCATCGATTGTGTAGTTCATGACAGTGAGCACAGACTTTTTCCCGATTTCCTGAACTGCATATTTAGTCGCAGCTTTTAAGTTCTGTCTGACCACTGTTGAAGATGTCGTGTTTTTCATTGCAGACTGAAAAGATTCTTTACCAAGTGATGATAAACCAGACTGAACGCCTCCTTTAAATGAAGTAAACATTGCCTTTCCTGATTTGATGAATTCATTTGCAACAGAAGAGAAAGACTTTGTACCATTGAGAAGACTTTTTGTCACTTTAAACACTGTGGTAACTGCTTTCTTGATAATGCTAAAGCCAGCTGTTAGCAAAGAAAGCCCGATGCTGATACTCTTAGATATTGCCCATGACGCCCAATCAAATGTGCCCTTTATCATCCCGTCTATTCCATTGATCATGTCAGACACTCCTTCTGCAATCAGGCCCATTCCGAACTGGCTTGCTGTTCCAAGTGTCAGGGCACAAACAAGAACCCCAGCAAGAACCTGTACCACCCCGAGAAAGAAACATATCAAAGCATCAAAGCAAAATTTGGGCTTGTTTTTCACCTCAAAAACAATACCGAGGCCATAGTCGTATAACGATCTCAGCTCATTAGTGATGATGAAGTTCTTTTCTTCAGACAGCATGTAGACTGAACAGTCTTCTGTAGTGGCTTTGCTGTTGTTTTTCTCCACCTCTTTAAGTTTATTCAATGCATTATCAATGTACGTCATCCAAGACTTAAAGATATTCATTCTGGCCTCCATTTGACTCTGAAAGTTGTTATTGTCTGTACTCTGATCTTTGTTACCAGTGACTGATAAGTTACATGAGACCATTGTGTTTGAGACTTCTGAGACGTAGACGCCAATTGATTTCTTTGCATCTTCCAGCAGTTTCATAGCGTCTGCTTTATAGTTACTCTTACCAAGGTTGATGGTGATGTACGCCTGGTTATAGAGTGCCACAGCCTGGAAGTGTGGGTCAGAGTTAACAACTTTTTGCCAATAGGATTTGGCTCCAAAGGCATTGTTGGATTTGTCGCGGCAGTGTAGATCAGTTCTTACAATTGCCTGTTTGACATGATCGTAGAAATTATCGCATTCTCCTCGCAGCAGCTTTCCACTTGTTTCATTTACTGTCCTGATAAGGTCTGCTTCAAGTTCTCCTAAGTCATCATGTCTATTGATGTGATCCTCGTGAAGGGTCAACCACAAGGCCCAAGATTCTTTCAGAGCATTGATGGCAGGCTGATAATCAAACTTAAGCTGATGATGTTTAAAGCATTCAGGAATATTTTTAAGCTGCATTCGCATGGGGTCCAGTTTTTCTTCCTGAGTGTAATGCTTATCAAAGTCCTTCAGCAATTTACAAAATGTGGAGAACAGATTTTCCTTTAGGTTTATTTCAACCAGCTCATCACTTTCCATGTCGTGGATTCGTTTAATTTCATAGTCCTCTCTTAGCTGGCGCATAATTTCCACAGACTGACCTTGGTAAGCTGGTGCGAGATGATCACAGTTCACAACCATCTGGACCATCCCAGGATTGCCTTTTCGAGATGTACGACCAAATATTTGTTTCTCGACTCTTCGGTTTTGAGGAAAGTGAGTAAGAAGAACAAAAAGACCACCACACTTATTCACACTTTCATCAACCTTTATGTCTGTCCCCCGACCTCCGAGATTT
>TU596541
GCGGCTGCTTGGGCCTGTAGTTAAAGCTCGTCTGTGATCTTGTCCCAGAACCTCCATGGCAATCAGGTTCAATCCATTGTTGTCAGTCTTTATGCTGCTGATCAGCTTATAAAGCGCTGGGTTTTTATTTTTGATCTCGCTCACTGAGTTTGAGTTTTCTATGAGCGTCTGAGCCAGTCTGATGGAGTCCTTCGGTGGAATATGGCTCGTGTTGAGTGTTCCTTTGTTGTTCTCACTGGACCTCCGAGCACTTTGAACACTTTTATATTCACCAACAAATCCAAGATGGTACATTTTGATTAGGATACGTTCATCACTTCTGATGAATTTAACACTCTGTAAGTATTCCTGCAGTGCAACGTCTGTCTCCTTTCTACTTCCTCCAGTTATGCTGTATTTTCTGGGGTTTTGGTGACAGAAGTCGTATCCTCTCTGGAGAATAAGCAGGGGTGTGTACGAATCAAGGTTCGTCTGGATCTCATTTTTCACTTTGTTGCGTAGCATCAATGCTTCCTCCATCTTGCTGCCAGTTGCTTGTGCTACAGCATGATAAAGAGCATTCTGATGATCCGAGTTAACGCTGATTATCTTGCCATCATCCTGGACAATGTCAAAATGGCCGTTGTACAACTGTGCATCAGCTCTGTTTTTAAAATAAAAAGTAACTACATTCAGTACACAAAGGTTATAAACATTAAAGGGGACCTATTATGCAAAATTCACTTTTGCATGGTGTTTGGACATAAATGTGTGTTGGCAGTGTGTGTACACAACCACCCTATAATGATAAAAATCCAACCACTCCTTTTTTTAATCCCCATAAATCATAAGCAGTGTCTCAGAACAAGCCGTTTCCAGATCCCTGGCAGTGTGACGTCACATTAGCCACAGGCCCCGCCCATGAATGTTGACAGACATAGAACCATTGACCGTTTGAACATAGAACCGCCCTGAGCGAGTTCACAATTCTCAGTTCCTCAATTCTTCCTCAATTCTACTGAAATTCGTTTATATCTGTGCAAATCATTTCACACTGGACTGTTGTGAAATGTTCATGTTCATGTCAATACAAAGGGACAATACAAAACAGAGATTGTGATAAAAATTTGTTACTCAAGGACAGATCAGTAAACTGTTCCTGATCCAGCTTACAGCCTCCAGAGTGATACTGGATACGGCAGTAAAGAAGGTGAGAGCACTTTATTACAGTTCATCAGAGTTTATTTACGAATATAAAGTTTACCAGTTTATTAAACACTACCTGAAAAGGCATAAGGTCTTTATATATTTGTTTACTGTTAGTTGTAACGAGTGTTTCTGTGTACTTCACTGTGTATGTTGATGATAATGCAAGAGAGAGAGAGAGAGTTTATGGATAATATTTTAATGCACACTTGCACTGTGTTTTATTAAGCTCTTACCGTGATTTTCTAGAGTGAAAACGTGTGCTTCATCTTTTGTGTGAAGTACAATAAACGTCATAAAACTCATTAAGTAAAGTCGAACAGGGTCCGGTACAACAGGCATATATTAATATAGTGGATAAAAACAAGACGACAATATAAGTTATAACCGTAATTGAACTAAACTATACTTGTTCTATCTCCATTCAGCATATATTTGCAGCTTCTGTCATTATAGTGCGTCCTGACTGAATCCTGAAACCGGAGAATCAGCTCTTGAAGCTCCGCCCTTTTAGGCAGAGCACAGCAGGTCATTTGCATTTAAAGGGACCACACTGAAACGGTGTGTTTTTGCTTAACCCCAAAAAGTGGCAATTTTAACATGCTGTAAAAAATGATCTGTGGGGTATTTTGAGCTAGACTTCACATATACACTCTGGGGACATCAGAGACTTATTTTACATCTTGTAAAATGGGGCATAATAGGTCCCCTTCAACACTAAAATGTATTTCTACACATAAGCAGTGTAATGCTCTAGTGATTAGTCTTACTGTGATGTATGAGGGGCTTTTGCAGATTTGGTTACTCTCAGTTTTATATCGCCTGCTGATTTGGTGGTTCCTGGGTAACGTTCCTCAGTGAGCTGTTTTCCATTTTCATCAACGACAGTGAGTTGAATCCCTTTTCCATCGAGCAGGTTACTTTTTGTGAGCACATATACATCGAGGGCTGTAACAGGATGATCAGTTTTGCTCATATCTTCTGTATACTGCATTAGTTTTGTTTTGTCCTCATCTGACAGCTGTTCCACTTCCTTGTGGCTTGCAGATTTCTTGTTGTGTTTTCCTCTTTGGTCATCAAAGAAACGCTGAGTCTTATGTCTGCGCATGACTTTGTCTACTGCCTGTTCTGCAGCACTGTTCAACTCTTTCTTAAATGTGCTGGTCATTAAAGAAGTTATATGTTCAGAACAGGAACTGATGAATTGCTCAGAAACTTTCTCTGCGATATCCTTTAGAAGGTCTCTTTTAAGGCGTTGTACATCCTGTAAACTGTGTCGTCCATCTTGGTCATACTTTGTCATTTCTTTCTCAAGCTCACTGATCCTCTCCAGTAAATCAGGAACAAATTTCTGTTGTATTATCTCCTTTGTGGGTATGGCACCCAATATTTGAGAGAGACTTGTTGAGTACTCAGATACTTTCAGGGCCAGCTTTGCCATTTCAAGCACACCTGACAGTTTTGCTTTATTCATAATCTCTGTTGCTGCTTTACACACATCAGAAAGTTTGCTGATAACGTCCTGTGCTGTGGTACAGTCCAGTATGAGGTGAGGAGTTATCTCTTCACAGAACATATCAAATGTTTTTTTTATTTGTTTCTCATAATTCTGGTCAATCTTGAAATTCTCTTTTTCCAAGGCAGCTTTCGGAATGCCTGAGCTGATAAATTCGACAAGATTCTGATCCAGGTCACTGCTTTGCTTCACTGATGAAGTAATGACATTCTGAAAACTGCTTTGTAAAATCTTCTTAAAGACTTCCTGAAGTGCTGCATCGATTGTGTAGTTCATGACAGTGAGCACAGACTTTTTCCCGATTTCCTGAACTGCATATTTAGTCGCAGCTTTTAAGTTCTGTCTGACCACTGTTGAAGATGTCGTGTTTTTCATTGCAGACTGAAAAGATTCTTTACCAAGTGATGATAAACCAGACTGAACGCCTCCTTTAAATGAAGTAAACATTGCCTTTCCTGATTTGATGAATTCATTTGCAACAGAAGAGAAAGACTTTGTACCATTGAGAAGACTTTTTGTCACTTTAAACACTGTGGTAACTGCTTTCTTGATAATGCTAAAGCCAGCTGTTAGCAAAGAAAGCCCGATGCTGATACTCTTAGATATTGCCCATGACGCCCAATCAAATGTGCCCTTTATCATCCCGTCTATTCCATTGATCATGTCAGACACTCCTTCTGCAATCAGGCCCATTCCGAACTGGCTTGCTGTTCCAAGTGTCAGGGCACAAACAAGAACCCCAGCAAGAACCTGTACCACCCCGAGAAAGAAACATATCAAAGCATCAAAGCAAAATTTGGGCTTGTTTTTCACCTCAAAAACAATACCGAGGCCATAGTCGTATAACGATCTCAGCTCATTAGTGATGATGAAGTTCTTTTCTTCAGACAGCATGTAGACTGAACAGTCTTCTGTAGTGGCTTTGCTGTTGTTTTTCTCCACCTCTTTAAGTTTATTCAATGCATTATCAATGTACGTCATCCAAGACTTAAAGATATTCATTCTGGCCTCCATTTGACTCTGAAAGTTGTTATTGTCTGTACTCTGATCTTTGTTACCAGTGACTGATAAGTTACATGAGACCATTGTGTTTGAGACTTCTGAGACGTAGACGCCAATTGATTTCTTTGCATCTTCCAGCAGTTTCATAGCGTCTGCTTTATAGTTACTCTTACCAAGGTTGATGGTGATGTACGCCTGGTTATAGAGTGCCACAGCCTGGAAGTGTGGGTCAGAGTTAACAACTTTTTGCCAATAGGATTTGGCTCCAAAGGCATTGTTGGATTTGTCGCGGCAGTGTAGATCAGTTCTTACAATTGCCTGTTTGACATGATCGTAGAAATTATCGCATTCTCCTCGCAGCAGCTTTCCACTTGTTTCATTTACTGTCCTGATAAGGTCTGCTTCAAGTTCTCCTAAGTCATCATGTCTATTGATGTGATCCTCGTGAAGGGTCAACCACAAGGCCCAAGATTCTTTCAGAGCATTGATGGCAGGCTGATAATCAAACTTAAGCTGATGATGTTTAAAGCATTCAGGAATATTTTTAAGCTGCATTCGCATGGGGTCCAGTTTTTCTTCCTGAGTGTAATGCTTATCAAAGTCCTTCAGCAATTTACAAAATGTGGAGAACAGATTTTCCTTTAGGTTTATTTCAACCAGCTCATCACTGTCCATGTCATGGATTCGTTTATTTTCATAATTCTCTCTTAGCTGGCGCATGATTTCCACAGACTGACCTTGGTAAGCTGGTGCAAGATGATCACAGTTCACAACCATCTGGACCATCCCAGGATTGCCTTTTCGAGATGTACGACCAAATATTTGTTTCTCGACTCTTCGGTTTTGAGGAAAGTGAGTAAGAAGAACAAAAAGACCACCACACTTATTCACACTTTCATCAACCTTTATGTCTGTCCCCCGTCCTCCGAGATTTGTAGCAATGATGATTCTGCCTGCACAGAATTTCTCTCTTTCAATGTTGTGCTTCTCACTGATTGTGTACAGAGTAATCTGTTCTGCCTTGAATCTGCCTCCTTTTATTTTCTCATGTAGTTCATCTGCTGTTTTAACATCTTCACAAATTACCAAGACAACTTGTCCTCTCTCTGCTACTTTCCATGTAGTTTCACAAATAGTCTGGATCCACTGGTGATTCCCACCTTTTACCTGGATGACTGGAAGCTCCACCACCCTTTTATGGCGATGTGCAGGTACAGTGTAGCTCTGTGCTTTATAATGTCTTGCCAGAAAATCTCGATCTGCCTTACCTCCTAATGTACCAGAAACACCAAATATACCACTCCTACTGAGATACCTTTTAAAATAATGAAAATTTGACATGTAATTTGTCACAGTGGATATCGGTGAAATCGCAAGTTGGTGCTTGAACTCCAAAAATTGTTGCAGACCATTACCCCACTTCTTATTTTTCTCTAGCACACCACTCGCTTTGAAGTCTACTGGAATTATTGCATTATACTTGTCTCTGTCATGAATGCCAGCAACTTCTCTTTCAGCGGCCGGTGAGGTGTCGATCATGTATTCCCGGCCCCGTGACATCTCAACAGCCCTTAGTGCATTCTCAACAAAAACTGGTAACTGATTCTCAACGTAGCTTTTCAAGAAAACAGGGATGACAATGAAGTTGTTGGATTCTTCAGCTGTTTGAAGGTTATCAGAGTACTTGATAGATGACTTTATTGTGCTTACAGTTGCATCAACAAGCAATTTCTCGGACATGATTTCACATGCTAGTCCTCCTTCCAGCAGTAGCATTTCAACATTAAGGTCACCTTGTTTTTCCTGAGCTTCAAAACATTTTGCTTTCTTGTTCTCTAAAGAATAGCACTTAAACACTGCACTCTTTTCCAAGACCTCCTCAAATATGCACAGAAGATCGTACTGTTGTGAAACTACAAGTTTCTTCATGACTTCAGATAATGCTTTAGACGACATGTCCTCTTTCACATCATATTGATGTATCATTTCAATATCCTCCTGGGTGTAGAATCCCAAATTCACTCCAGGTAGCAAGATCTCATTTGCTGAAAAGCTTTCTGATGTTTCTAGTCCCATAACGGCTGTTGTTGCAGCTTTATGAAAGTACTGTATCCTTGTCGCCCATTTTATTTCCCTTGTTTCAAGCATTTCAATCGGTTGACAAGTAGATATCATGGCCCATATGTTGGAAAGGACTTGCTCCACATGCCTAAATCCACTAGATTCATGGGACAAGAATGTTACTTGAACGCCACTGTCTAAGGTCATGTAGTCCACTTCATCCACTATTACAAGCTCAAATGGCCTTGTATCGCGAGTAGTCCTCTTCTCAAATTCCTGTTTAAGTATGTCTGCTGCAAAGACTCCCACTGTGCCATATACTATTTGTTTCCTGTAAGCATCTTTAAGATGTTCATCTTGTTCCTGTTGTGAATAGGCACTTGCATACTGTGGAGGTACTACAGACGAGGTGACGCCAAACATTTCGAAAAACTTTTTCCACTCTTCTTGATCTCGCCTGGCTAGAACCGGAGAGCTTGTCACAATGTCCACTTTTGTTCCACGAATGGCCAGAATTGTTGCAAACATGGCTAAGATACAGGACTTGCCCTCACCTGTGCCAATCTCTAGAAGACATCCTTTATCTTCTGTCAGCTGTGCCAGGAGGAGCAAAAGCAATGATGCTAGTTGTGTACATCTTGGAAAATAACCTTGAATCTTCGTGTTGTCTTTTTCGGTAATTGTTGAGCAGTCTTGCACTGCTATTGACATTCCAATTAATACATCTTTCAGAATGTTGATATCTGGGTTTGTAAGATTAAGGGATGTTATCTTCCTTTTCAAATCTGCGATTTGTTCTTCAGTAAGGTCCACCAATTGATATTTTGGGAGTTCCAACTCTACGTATCTAAGCACATCCTTCAACAGCACCAAGACTTTCTCTGGGCAGTTTGCTTCACGAAGTTCCTTCACAATTGTATCAGCATCTTTGTCCTTGTCATTTTTAATTTGTTCTTGAAGAAACATTAAAGGATTTTCATTCGTAAGAGCAGAGAGAACGAGGATGCAGTCCAGGTGGTAGGTTTGTGCTGTGTGGAGAACTGAATCGAGTTGATCACATTTGATAGCTGGACTTTTGCAAATGAAAAGCATTACTTCTGTTGGTGTCCAGATCCTGTTGAACAACATTTGACCCAAAATCTTCCTACTTTGTGGTGAAAGCTCTGAGATCATGTCAAGCACATTTAATAAAATGTGTTCTGCCAAAGTTGGATTTGTGGAATGAAGCTGCTCCACCAAACCAAAGAGAAAGTCATACTTCTTCTCCCAGCCAAGCTGCTGATCTTCATCATCTTTAGCATCTGCACTGCTACTGTTCAGAATGAACTGTAGAGATGCCTCAAGAACTGTGAGCTTCTCTGTAAGAGACAGTTCGCTATATCCTATAGCATGATCAAAGCTAAACTGAGACCATACTGAAAGGTAGTTTTCTCTACAATATTGATCTAGAAGTTCATTCTGGAGCGTCTTAATCCTGTCCCAGATCTGGTAGTGCTGTATCTCTTTATCTTCTGTGATCTGGTACTTTAACAAAATGTCTTTGAATTTTTCTTCAACATCAGTAACCTTCATAAATGTGCAAAACATAAATGGGTCTCAGTAAAAAGTGATATTTTATCACATGCTGTATACATATTGCTCAATCCAAATTAAAGTCATACCTCGTCCCTCTCGATTGCAGCAGCGTCGTCTTCTATTTGTTGATGGAGAGCTTGTGTGCGTTCATGATGTTGCTTGCGACCTCTGAAGCTTTGTTTTTCACGAAGCCGCTCAGTTGCTCGAGAAAGCTTGAGTCTGGATGATTCACTCTCTCGGTCCAGCTCCTGTTGAATCCTTTGCTCGCGTTCCAAACGTTCCAAACGTCTTCTCTCCTCCTCTTGCTGTCTCTGTTTTTCATCTTCTTCAATTTGTCCTGTTTAAAGATGTAATCAAATAGCATGGTATTGGAAACAACATATAGATACTTTATAAATCATTCTAATATGCTGATTTGCTGCTCAATAAACATTTTAAATTATTATCAATGTTGATAGCAGTTTTTGCTACTTAAAGAGATCAATGTTCACCCAACAATGAAAATTAGCCCATAATGTACTCACCCTCAAGCCACCCTAGGTGTATATGATAGTGATAGGTGTATAATAGAAGTGATTTTCTAGGATGAAAAAAAAGTGCATCCATCGATGATAAAAACGTACTCCATGCAGCTCCGGGGGTTAATAAAGACCTTCTGAAGTGAAGTGATGCATTTGTGTAAGACAAATATCCTTGTTTAAAACTTTTTAAAGTAAAATAACGAGCTTCCGGAGCAACATCCATACGCATTAGACATACGTCCAAAAAGTAATTCACAATGACATGATGTACTATGCGTTACAACGTAGGACATGGGCGCCCAATAGGTCGATCGCGATCTACCAGTCGATCGCAAAGACAATGCTGATAGATCGCACACAATTATAATAGATGCTTCTGTTAAATTTTAATAAATAGAAATATAAGGATGCCCTTTGTTATCCTTTTAGTGTCTGTCTGATTTGCATTTGACTAATACATTTTTACCAGGCAAGATTTTTGTTTATATTTGTATTACATCATAAAAAGAAAAATTAATTTTCTGAATAAAGTACATTTCATAGGACTCTATGATAATAATAATTGTTTAATTCCATATACTGTGATATTTCCTGAGACTGTTATCATACTATGTTAATTACAACATGCCATTACAACCGTAGTGTGTTTGTGTGTACATAATGTAAGGTTCCCTTTCATGGGAACATCGACGCTGCATTGAAT
>TU596542
GCGGCTGCTTGGGCCTGTAGTTAAAGCTCGTCTGTGATCTTGTCCCAGAACCTCCATGGCAATCAGGTTCAATCCATTGTTGTCAGTCTTTATGCTGCTGATCAGCTTATAAAGCGCTGGGTTTTTATTTTTGATCTCGCTCACTGAGTTTGATTTTCTATGACCGTCTGAGCCAGTCTGATGGAGTCCTTCGGTGGAATATGGCTCGTGTTGAGTGTTCCTTTGTTGTTCTCACTGGACCTCCGAGCACTTTGA
>TU596547
GCGGCTGCTTGGGCCTGTAGTTAAAGCTCGTCTGTGATCTTGTCCCAGAACCTCCATGGCAATCAGGTTCAATCCATTGTTGTCAGTCTTTATGCTGCTGATCAGCTTATAAAGCGCTGGGTTTTATTTTTAATCTCGCTCACTGAGTTTGAGTTTTCTATGACCGTCTGAGCCAGTCTGATGGAGTCCTTCGGTGGAATATGGCTCGTGTTGAGTGTTCCTTTGTTGTTCTCACTGGACCTCCGAGCACTTTGA

Function

GO:

id name namespace
GO:0016071 mRNA metabolic process biological_process
GO:0000375 RNA splicing, via transesterification reactions biological_process
GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome biological_process
GO:0016607 nuclear speck cellular_component
GO:0005681 spliceosomal complex cellular_component
GO:0005685 U1 snRNP cellular_component

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU596543 False 333 lncRNA 0.29 2 56322 74905
TU596536 False 256 lncRNA 0.46 2 76113 111638
TU596539 False 4637 lncRNA 0.40 4 76113 115748
TU596541 False 8563 lncRNA 0.40 4 76113 119677
TU596542 False 255 lncRNA 0.47 2 76113 111638
TU596547 True 255 lncRNA 0.47 2 76113 111638

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000364_00151094_00203772 NA coding downstream 31141 150818 ~ 203857 (+)
CI01000364_00263052_00264410 NA coding downstream 143308 262985 ~ 264747 (+)
CI01000364_00287825_00289294 NA coding downstream 167370 287047 ~ 291072 (+)
CI01000364_00294611_00295771 NA coding downstream 174724 294401 ~ 295950 (+)
CI01000364_00382475_00385399 NA coding downstream 262798 382475 ~ 386117 (+)
G520005 NA non-coding upstream 4914 20274 ~ 51408 (+)
G520008 NA non-coding downstream 115607 235284 ~ 236338 (+)
G520068 NA non-coding downstream 128764 248441 ~ 251073 (+)
G520004 NA non-coding downstream 135435 255112 ~ 260688 (+)
G520089 NA non-coding downstream 214224 333901 ~ 334264 (+)
G520206 NA non-coding downstream 254900 374577 ~ 374830 (+)
G520007 NA other upstream 10476 44426 ~ 45846 (+)
G520002 NA other upstream 23343 31744 ~ 43714 (+)
G520009 NA other downstream 121644 241321 ~ 324231 (+)
G520012 NA other downstream 130623 250300 ~ 255006 (+)
G520013 NA other downstream 189691 309368 ~ 337107 (+)

Expression


Co-expression Network