XLOC_014291


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014291
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 43546647 ~ 43549011 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00030040
ACAAAAGTTACAATTTATTCATTATAAACATTTTCCATAAAACATCTCATCATTTCAACAATAAAACATTCACTCATTTGGACAGTTTTTTGTGCAACATTTATACATTGTAAGTGCAAACGAGACATTTATGACGTATAAAACCATCagtcagaataacaaatgacaattTGATCATTAAAAACAAGTCAAGTCATTGTCGTAAAGTGCAAATGATTTTGATTCCATCAGTAAACTCTGAAACTGGACTTCAGAGGAAGAAAAATGAGGCACAAATCTGAGACATGTAAGCGGAGAGGAGGGTTTCTGCTTGGACCCTTTAGTTGGCAACTACAGTAGCTAAAAGGATACAGTGGCAGTCTTCAGTAAAAAAAggacacacatttacataaacattttcatatttaaataaattgatgGAGAGTAATTTGTTAACACCATTTAGACAGCAGATTTGGCACAGTGATTTCCccaaacaggaacaaacacaaaATGTTTAAGACAGGGTGGGTGAAAAATAACTgggtgttaaagggatagttcacccaaaaaaagaatttactcacccttcactgtgAGCaaacctgtgtgaattgtaatGGAAGTCATGGgctactggttttcaacattctttgaaatatcttcttttgctaaATAAAGGAATTCAAGCAGGTTTGCAAAAAgggagtaaatttacatttttgtgtgaactacccctttaaaaataagtaaaaaagttCATATCTCTAATACTGCCTTTGGAGGCCAATGCCTGTGCACTGAAATGGGAAATATGAAATCTTATTACCTACTGGCTGTTTTCTGCATGATGCTACGAGTTCTAGCTATTAAAACTGCCAAGTTGTTTTTCACCCATGTTTTACAAATGCTGGATTATTTCAACCTAATTTTGGGTAAAATAAGGACTAAACCAACACTGTAAAGagcaattagttactttaattttgtctttactttaaaaagtgagtgaatCTGTTCATGTTATTTTGTGTAATTATACACAcagtttatttaatgattttaagGCAATGTGTTTACTTTAAGTagagtcaactaattgttttaaatacaatgggtttactttaaGGTTaggcaactaatcgctttaaaagatATGTATTtactttaagttgagtcaactaatcatttttaaaagcaatggttttacccacttttttaagttgagtcaactaacCGATTCAAAAGCACTGGTTTTACTTTAAGTTgggtcaactaatcgcttttaaaagcAACGGgtttactcacttttttaagttgagtcaactaatcgcttcaaaAGTAAAGGGTTtactttaagttgagtcaactaattgcttttaaaagcaacgggtttactcacttttttaaagttgagtcaactaatagctttaaaagcaatgggtttactcactttttaactcaactcaactaattgctttacttaaagtgagtaaactcaatgCTTTTAGAGTGAActtattgcttttaaaacaatgggtttactcaattGGTTAGTATTAAACTAGTCAATTTATAAAGTAATacaattttgaaaaattaaacACCAAGTTTAACCCAACAACTGAAACTGTCCTAATATTTTACCCAGTATTTTTAGAGCGCACCCTGTGGTCTATTATATGGCACCATAATAATCATTTCCAGAGCTGCCTGAGTTCAGACGTCGCTGggggtgtgtgtgtttttgttgggTGTGTTTGGCAGACAGCAGCACACAGTCTGTCGCAGCACTCTCTGGATGTGTGTGTTCCTG
>TCONS_00030039
ACAAAAGTTACAATTTATTCATTATAAACATTTTCCATAAAACATCTCATCATTTCAACAATAAAACATTCACTCATTTGGACAGTTTTTTGTGCAACATTTATACATTGTAAGTGCAAACGAGACATTTATGACGTATAAAACCATCagtcagaataacaaatgacaattTGATCATTAAAAACAAGTCAAGTCATTGTCGTAAAGTGCAAATGATTTTGATTCCATCAGTAAACTCTGAAACTGGACTTCAGAGGAAGAAAAATGAGGCACAAATCTGAGACATGTAAGCGGAGAGGAGGGTTTCTGCTTGGACCCTTTAGTTGGCAACTACAGTAGCTAAAAGGATACAGTGGCAGTCTTCAGTAAAAAAAggacacacatttacataaacattttcatatttaaataaattgatgGAGAGTAATTTGTTAACACCATTTAGACAGCAGATTTGGCACAGTGATTTCCccaaacaggaacaaacacaaaATGTTTAAGACAGGGTGGGTGAAAAATAACTgggtgttaaagggatagttcacccaaaaaaagaatttactcacccttcactgtgAGCaaacctgtgtgaattgtaatGGAAGTCATGGgctactggttttcaacattctttgaaatatcttcttttgctaaATAAAGGAATTCAAGCAGGTTTGCAAAAAgggagtaaatttacatttttgtgtgaactacccctttaaaaataagtaaaaaagttCATATCTCTAATACTGCCTTTGGAGGCCAATGCCTGTGCACTGAAATGGGAAATATGAAATCTTATTACCTACTGGCTGTTTTCTGCATGATGCTACGAGTTCTAGCTATTAAAACTGCCAAGTTGTTTTTCACCCATGTTTTACAAATGCTGGATTATTTCAACCTAATTTTGGGTAAAATAAGGACTAAACCAACACTGTAAAGagcaattagttactttaattttgtctttactttaaaaagtgagtgaatCTGTTCATGTTATTTTGTGTAATTATACACAcagtttatttaatgattttaagGCAATGTGTTTACTTTAAGTagagtcaactaattgttttaaatacaatgggtttactttaaGGTTaggcaactaatcgctttaaaagatATGTATTtactttaagttgagtcaactaatcatttttaaaagcaatggttttacccacttttttaagttgagtcaactaacCGATTCAAAAGCACTGGTTTTACTTTAAGTTgggtcaactaatcgcttttaaaagcAACGGgtttactcacttttttaagttgagtcaactaatcgcttcaaaAGTAAAGGTTTTACTTCAAGTtgagtcaactaattgctttaaaagcaatgggtttactcacttttttaagctaggtcaactaatcgctttaaaagcaatgggtttactcacttttttaagctaggtcaactaatcgctttaaaagcaatgggtttactcacttttttaagctaggtcaactaatcgctttaaaagcaatgggtttactcacttttttaagctaggtcaactaatcgctttaaaagcaatgggtttactcacttttttaagttgagtcaactaacCGATTCAAAAGCAATGGGTTtactttaagttgagtcaactaattgcttttaaaagcaacgggtttactcacttttttaaagttgagtcaactaatagctttaaaagcaatgggtttactcactttttaactcaactcaactaattgctttacttaaagtgagtaaactcaatgCTTTTAGAGTGAActtattgcttttaaaacaatgggtttactcaattGGTTAGTATTAAACTAGTCAATTTATAAAGTAATacaattttgaaaaattaaacACCAAGTTTAACCCAACAACTGAAACTGTCCTAATATTTTACCCAGTATTTTTAGAGCGCACCCTGTGGTCTATTATATGGCACCATAATAATCATTTCCAGAGCTGCCTGAGTTCAGACGTCGCTGggggtgtgtgtgtttttgttgggTGTGTTTGGCAGACAGCAGCACACAGTCTGTCGCAGCACTCTCTGGATGTGTGTGTTCCTG

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00030040 False 1795 lncRNA 0.33 3 43546647 43549011
TCONS_00030039 True 2088 lncRNA 0.33 3 43546647 43549011

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014290 wasf2 coding upstream 3519 43523690 ~ 43543128 (+)
XLOC_014289 BX649384.3 coding upstream 31251 43504480 ~ 43515396 (+)
XLOC_014288 ahdc1 coding upstream 46348 43439401 ~ 43500299 (+)
XLOC_014287 yrk coding upstream 114232 43359075 ~ 43432415 (+)
XLOC_014286 sesn2 coding upstream 189190 43341115 ~ 43357457 (+)
XLOC_014292 cd164l2 coding downstream 14168 43563179 ~ 43572298 (+)
XLOC_014293 si:ch211-199g17.2 coding downstream 30775 43579786 ~ 43603932 (+)
XLOC_014294 si:ch211-199g17.9 coding downstream 55245 43604256 ~ 43611880 (+)
XLOC_014295 CR356238.1 coding downstream 116380 43665391 ~ 43665511 (+)
XLOC_014296 si:ch211-193k19.1 coding downstream 120111 43669122 ~ 43707261 (+)
XLOC_014282 NA non-coding upstream 295453 43250553 ~ 43251194 (+)
XLOC_014280 CU207343.3 non-coding upstream 465587 43080925 ~ 43081060 (+)
XLOC_014279 CU207343.4 non-coding upstream 468768 43077744 ~ 43077879 (+)
XLOC_014274 dre-mir-128-2 non-coding upstream 631106 42915419 ~ 42915541 (+)
XLOC_014267 NA non-coding upstream 973520 42565358 ~ 42573127 (+)
XLOC_014300 NA non-coding downstream 237992 43787003 ~ 43791576 (+)
XLOC_014301 NA non-coding downstream 238131 43787142 ~ 43790716 (+)
XLOC_014302 NA non-coding downstream 251821 43800832 ~ 43804410 (+)
XLOC_014314 NA non-coding downstream 1368088 44917099 ~ 44959698 (+)
XLOC_014266 NA non-coding upstream 943358 42560956 ~ 42603289 (+)

Expression


Co-expression Network