XLOC_014320 (si:ch211-153f2.7)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014320
gene name si:ch211-153f2.7
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 45970692 ~ 45980732 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00028439
GACTGTGTGTCCAGTGACAGAGCTGAATCTACAGCTGACCACAAGTCATGGAAGTAGTTTTGAGCAGACTGAGGGATTTCTCCAGCAAGCAGAGCTCTTTTGAGGAGTGTGAAACAGCAATGGTGTGCAGGGATTATTCCTTAACACTGGAGGAGAAGAAAAGGGATGCGGGACGGCTGGACATTCAGACTGCGCTCGTCTGGCTGAGGAAAGAGCTGATGGAGATGCGCTCTCAGGACCAAGCGTTGATTCGCCAGCTGATGGATCTCCATGATGGCATTCAGGAACTGAAGCAGGAGTGTGAAAAAGCcatagaggaggaggaggaagaggaagaagaagcaGGCTGGGACTCTGGCAGTGAAGGAGGAGCGAGCAGCATGTCCTCATACTCTGGAGAAATGAGCTTCTGCACCTCCACCTACTCCTTCAGCTCATGCATGAGTCCTGCTTCTCCAGCGTTCCTCTCAAAACGGGTCTTCAGCAGACGCAGCTCTGTGCCATGAACCAACAATTACACTCATATCCATCTTacattaaagaaacactccatttttttttttttttttggaaatagggtCATCTTATACCTGTTAAACAGCTGAGTTTTGCCATTTtggaatccattcagccaatctccgggtctagctggagcacatttagcttagcttagcatagaccattgaatcagattagaccattagcatttcagaAAAGATCTTTTCAGACAGAAAGTTTGAAGTTGTTATATTCTAGACCGATATGGCCAGAACTATattctcattctggcataataatcaagataTTTGATTAGGGGATTATCAGTAATGATATTACCACATAATATCAGTCCACCTCCTGCAGCCAAACAATAGCAACTTTTGATTTGAGGTCAGTTTTAATAAACAGTGTAAGTCAAACTGTGTGGAAAAATTAACTAAACTCTGATTTATGAgagagatgctaacggtctaatcccaTTCATTCAAGGTAACCTGAAAGTGCTTCCATCAAACCTAGTGATTGGCTCATTTACTAcagagatgctaacggtctaattcgattcaatggcctatgctaagctaagcttaaagtgcTTCCAGTAAACCTAGAGATTGGCTCATTTAtaaaagatgctaatggtctaatctgattcaacgatttatgctaagctaggtTAAAAGTGCTTCCGCCAAACCTAGAGATCATCTCATTTATGAAGGAGATGGTAACGGTCTAATcccattcaatgatttatgctaagctacgaTAAAAGTGCTTCCATCAAACCTAGAGTTCGGCTCACTgagagatgctaatagtctaaaccgattcaattatctatgctaagctaagctaaaagtgcttccagtAAACCTAGAGATTGGCTCATTTAtgaaagatgctaatggtctaatccgattcaatgatttatgctaagctaagcttaaagaACTTCCAGTAAACCTAGAGTTCGGCTCACTTATGAgagagatgctaacggtctaatacCATTCAATGATCTATATACTGAAGTAAACTAAAAATACTTCCCCAAAACCTAGAGATCAGCTTATTTATgaaagagatgctaatggtctaacccAATTCAATAAGCAACACTAGGCTAAGATAAAAGTGCTTCCATCAAACCTAAAGATCGGCTcattgagtgagatgctaatggtctaatcctattcaatgatctatgctaagctaaatgtgcttcTGTCAAACCTAAAGATCGGCTCATTTAttagagagatgctaatggtctaatcccattcaatgatctatgctaagctaagctataagTGCTTTCAGCAAACGTAGAGATCGGCTCGTTTATgagagatgctaacggtctaatctgattcaatgatctatgctaagctaagctaaaagtgcttccatcAAACCTAAAGATTGGCTCATTTGTGTGAGCGAAGCTAATGGTTTAATACGATAcaatgacctatgctaagctaagctaaaagtgcttcccgCCCAACCCCGAAATCAGCTCAtttatgagatgctaatggtctaatccgatccCATTCAATgacgctaagctaagctaaaagtgcttccgccaAACCTAGAGATTGGCTCATTTAtaagagagatgctaatggtctaatccgatttaatgatctatgctaagttaagctaataaacgtcgcctcgtggttccatcccaaagagggaagaaatcactttcccgaactctcgcattcaatctgcccagttggtggaatgatctccctaactgcatcagaacagcagagtcactcgctgtcttcaagaaacgactaaaaactcaactatttagtctccacttaccttcctaatctgcaactgcctctctggctccaccgctaactgtattacagaaaaaaaatactaatgttttgcttcttacactttacatacctgaaacttgcctacagcacttattcattgttgctcttatagttgtgtaagttgcttccttgtcctcatgtgtaagtcgctttggataaaagcgtcggctaaatgactaaatgtaaatgtaagctaaaagtgcttctggtAAACTCAGACATcagctaaatggattaaaaaaatgttaaaaatcaaTAGTTTAACTCTGgaagagctgtaaaatgagcccatTTCCAAAAAAAAGCGGAGTATTCCTTTAATAGAAATCTTATCTCGTCTTACAGTTCGAGATATGTATACATCGTTTATACTGTACTATACAGTATATCAACAAAGTCAAAAAGTGAAAACAAATGTGAATGTTTGAAACTGTGATGAACTTGACAATGTCTTTGGTGACAGACTGCTGCTGAATGTTTGATTGTCACTTGACAAAACTGAAGTGCctcttctttggggcttctccacaacGTAACTCTCCCTGATGTGGGATAGACAGTGATGGTGGATGGTGGACCTCACTGTTCTCAGCACAAGATCTTCCCTGCTGGTATCACTAAAATGGACTCTTTGTAAACACGTATAGAGGTGTACTCTTTGAATGCTGATTAATGAACTTTTCTTTGTATTATGACAGTCATGAGTACAACGTGACAAGATTTAGGTGTTTTTTAAAGCAAGACGTGAACAAATATTCACTGATGATCTAACTCTTCTAAGACACATATCATGTTATTAatgatatacagtataaacaTTAAAACCTGatcagttttggtggaaacatcTCATGAAGCAATGAGTTTAAATCaagacattttaataaacatatgatGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000104929

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00028439 True 3264 mRNA 0.39 2 45970692 45980732

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014319 utp23 coding upstream 2974 45962016 ~ 45967718 (+)
XLOC_014318 FO704771.1 coding upstream 7428 45844363 ~ 45963264 (+)
XLOC_014317 NA coding upstream 242630 45727214 ~ 45728062 (+)
XLOC_014316 CT737154.1 coding upstream 461711 45508865 ~ 45508981 (+)
XLOC_014315 NA coding upstream 604965 45359277 ~ 45365727 (+)
XLOC_014321 NA coding downstream 110585 46091317 ~ 46093652 (+)
XLOC_014322 stmnd1 coding downstream 114478 46095210 ~ 46100763 (+)
XLOC_014323 rbm24a coding downstream 133096 46113828 ~ 46148977 (+)
XLOC_014324 cap2 coding downstream 177346 46158078 ~ 46210904 (+)
XLOC_014325 NA coding downstream 235603 46216335 ~ 46219040 (+)
XLOC_014314 NA non-coding upstream 1010994 44917099 ~ 44959698 (+)
XLOC_014302 NA non-coding upstream 2166282 43800832 ~ 43804410 (+)
XLOC_014331 NA non-coding downstream 442359 46423091 ~ 46438135 (+)
XLOC_014334 NA non-coding downstream 1207798 47188530 ~ 47191501 (+)
XLOC_014337 CU138512.1 non-coding downstream 1325891 47306623 ~ 47306738 (+)

Expression


Co-expression Network