XLOC_014332 (AL953858.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014332
gene name AL953858.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 46824723 ~ 46825683 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00028456
cagctgcgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgctgtgtgtgtgcgcgctacgtgtctgtgctatgtctgtctgcgtgtctacgctatgtatgtgtgtgtgtctgcgttacgtgtctgtgctgtgtgtgtatgtctgcgtGTCTACACTAtctatgtgtgtgagtgtgtgtctgcgctacgtgtctgtactacgtgtctgtgctatgtctgtctgcgtgtctacgctatgtatgtgtgtatgtctgcgttacgtgtctgtgctatgtgtgtgtgtctgcgtgtctacactatctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgcgctatgtgtctgcgctatgtatgtgtgtgtgtctgcgctacgtgtctgtgctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgcgctacgtgtctgtgctatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgctacgtgtctgtgctatgtgtgtatgcgtgtctatgctatgtatgtgtgtgtgtgtatctgcgatacgtgtctgtgctatgtgtgtgtgtctgcgtgtctacactatctatgtgtgtgtgtgtttctgcgctatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgcgcgctacgtgtctgtgctatgtgtgtgtgtgtgtctgcatgtctacgctatctatttgtgtgtgtgtgtctgtgctacgtgtctgtgctgtgtgtgtatgtatctgcGCTACATGTctgtgctttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgcgtgtacgctatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagcgctATGTTTCtgtcctatgtgtgtgtgtctgcgtgtcaacgctatgtatgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtctgcgctacgtgtctgtgctttgtgtgtgctttgtgtgtgtgtgtgaacttatTGTTGCAACTacacaaaaaatgcatcaaatactgatggtaaag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000100195

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00028456 True 961 mRNA 0.48 1 46824723 46825683

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014331 NA coding upstream 386588 46423091 ~ 46438135 (+)
XLOC_014330 med30 coding upstream 413365 46372115 ~ 46411358 (+)
XLOC_014329 slc30a8 coding upstream 462491 46343385 ~ 46362232 (+)
XLOC_014328 rprd1a coding upstream 490913 46309553 ~ 46333810 (+)
XLOC_014327 mapk15 coding upstream 521101 46240171 ~ 46303622 (+)
XLOC_014333 si:ch211-229b6.1 coding downstream 309994 47135677 ~ 47137425 (+)
XLOC_014334 NA coding downstream 362847 47188530 ~ 47191501 (+)
XLOC_014335 tpmt.1 coding downstream 464604 47290287 ~ 47298657 (+)
XLOC_014336 tpmt.2 coding downstream 473483 47299166 ~ 47309383 (+)
XLOC_014337 CU138512.1 coding downstream 480940 47306623 ~ 47306738 (+)
XLOC_014325 NA non-coding upstream 605683 46216335 ~ 46219040 (+)
XLOC_014321 NA non-coding upstream 731071 46091317 ~ 46093652 (+)
XLOC_014317 NA non-coding upstream 1096661 45727214 ~ 45728062 (+)
XLOC_014316 CT737154.1 non-coding upstream 1315742 45508865 ~ 45508981 (+)
XLOC_014339 NA non-coding downstream 511899 47337582 ~ 47338157 (+)
XLOC_014341 NA non-coding downstream 612521 47438204 ~ 47448594 (+)
XLOC_014344 CU695215.2 non-coding downstream 748932 47574615 ~ 47574823 (+)

Expression


Co-expression Network