XLOC_014638 (CR450687.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014638
gene name CR450687.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 13364536 ~ 13370153 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00028931
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>TCONS_00028932
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>TCONS_00030173
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>TCONS_00030174
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117596

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00028931 False 882 lncRNA 0.39 2 13364536 13365511
TCONS_00028932 False 1036 lncRNA 0.41 2 13364536 13366234
TCONS_00030173 False 3456 lncRNA 0.36 7 13364785 13370153
TCONS_00030174 True 3617 lncRNA 0.36 4 13365128 13370153

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014637 zfpm2b coding downstream 77798 13193215 ~ 13286738 (-)
XLOC_014636 NA coding downstream 175808 13185953 ~ 13188728 (-)
XLOC_014635 slc25a32a coding downstream 355121 12937066 ~ 13009415 (-)
XLOC_014633 fam210aa coding downstream 716128 12630414 ~ 12648408 (-)
XLOC_014634 AL928820.1 coding downstream 731273 12633149 ~ 12633263 (-)
XLOC_014639 NA coding upstream 82705 13452858 ~ 13456995 (-)
XLOC_014640 epb41a coding upstream 269333 13639486 ~ 13774502 (-)
XLOC_014641 ccn2b coding upstream 433002 13803155 ~ 13808632 (-)
XLOC_014642 stx12 coding upstream 534915 13905068 ~ 13923104 (-)
XLOC_014643 trnau1apa coding upstream 553447 13923600 ~ 13933204 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc upstream 6358537 19728690 ~ 19728755 (-)
XLOC_014632 NA non-coding downstream 740574 12620926 ~ 12623962 (-)
XLOC_014626 CU468824.1 non-coding downstream 1227665 12136736 ~ 12136871 (-)
XLOC_014625 CU468682.1 non-coding downstream 1233356 12131045 ~ 12131180 (-)
XLOC_014646 NA non-coding upstream 691889 14062042 ~ 14066550 (-)
XLOC_014657 NA non-coding upstream 2656740 16026893 ~ 16031105 (-)
XLOC_014658 CR385068.2 non-coding upstream 2657266 16027419 ~ 16027490 (-)
XLOC_014659 CR385068.1 non-coding upstream 2658303 16028456 ~ 16028590 (-)

Expression


Co-expression Network