XLOC_014661


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014661
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 16036012 ~ 16044582 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00030188
ATTAGggacaaagcaagtctcatataatatatcagaaagaaagacagaaaatattacaaatttgtCAAATTATAAATCATATAGACATTTTCGTATTActaaactgtaaaacccaactaTCAActgtattaaatgaaatgagtgtggttattaaatttacaaacagttaattttatttatttgaaaagagttttgaactgtgttgaaggtaatgagtttattaaatacCACAATACCTCAACTTAAATGTTCACAGTCCTCATATAGTTATTTGTTTAACTCAAACGTtataagttgccttaacttattgggttttactaaCTCAGTtggttttttaacttaaatgatttgtagcAATCGTTTTCCTCAATTAATTAGTGTTACCTTgacattttgggttttacagtatagtCTTCAAAACTGATACACACCAAGTTTACCTACCAGCGCTTATACCacttgcaaaaacaaacaaacaaaaatcccaAAAAAGAGAAATGCACATAGTGTGGGGATTAATTTACACAGTATTGGAAATCATTTCACATAACATGCTTTGTcctcaaaataaaagcacaaCTCAATGAAGAGATTAAAAGAAAACTGATCTAAATcctaattttatttaaacataatgAAATTTATATGACATTTACCAAACCACAATGCAAAGATATTGACAGTTTACAATGCCCAGAGCTTGATGTACATCTTTACTATTGACTTTAGCATTCATTACAGTTGATTAACATCTaaaatgtacaatacattttacTCTGCTGATCCACGTCAGTGAGCCCCTATAAAGGCCTGTACAGATGTGTTTATATGGACAGTGAGTGTGGATGACTAATCAACGTCCTGCTGCTATAATGAAATGTTCTattatctataatccataatcatcttgtttcatttacattgtttatttaagATCACTGTGATAAATTTCCCTGGAGCCCCTTCTTATTATTAATTGAAATCATAGGCCTGACCACCAGGGGGAGTGTAAAATGTTTTTGGCACCACCATTTTGAAAGGCTTTAGGGAAATACACATCTCTTATTTTTAAATCACAATGAATTCATCTGGGAATTAGTACACGAGGAACATTGTGCAGTTAATATGGCATGTGTGTTTAATGAATGCGGTTGCCATAGAAACTATAGCTGTCAAATTGTGCAAAACCATTTAGTGACCACAACGCAACAGAAGcagtcacttttttttaaatccatttttaaacaatactcTATTTAAACAAACTCCTTTTAAAATTGATGATTTTGATCATTTCCTCAACATATTATAATTGTAAATATCTTGTTCAGAATGTGATTCCACAAGTCTTTTCACACTGCATTTGGTTATTTTCACATGAGTGATttgcattaacatttttttatccGATTGCATTCATCCTCTATTTCTCATCCTTGTAAACTATTTACAGATCCCAATTTTCCACAAGCAttattgtaaacaaagagtcattGCCAAGTCTCAGCCAAAGCATTTATGTTACAGCAAACATCATGtaatagaaaacaaacaaaaaaataaaataaaaaatctgcacAAATAAACCCTGTTCTAGAAGTGTTTATTTCGGATGAGGAGAAAAGCCTGAGAATGAGTTGCAGTTGCAGATTTGATAAAGAGATAGTTCTACATTTACACTCTATTTACGCACCCACAAGTGATTCTAATCCTAACCTTTATTGTTCTGTTTTATTCTTTTgatcacaaatgaagatattttgaagaaagctgagaCCAGTATCTATtgactgagtaaatgatgacatacacACCGGTGAAAGTTTGgggtcttttttttaaaaatatgttttatttggtgctttttaaagaaaactctcCTGTTTATCAAGGCAGCatctattaaatgtaaaaacaaaaatggttaaatacttatttattaaacatgtatttattacttattgtgtgtattttcaaatgaaattattattccAGTCATTACTGCTTGTATttctattaccattaataatattaataataataataataatagtaataataataataattataataaaacaagtgatttctgaaggatcatgtaacTTTGAAGACTGGAGTTCaagaagctgaaaattcatcaataaaatcactggaataaattattaaaataaatgataatctaTTTATTACTTTATAGTGCAATAATTGGTGAGcaggaaaagcttattttaaaacattttaaaatcccaCTGACCCCAAACTATTGACCAGTAGTGTAATTCAAATTTTTTTGTGAACTCTTCCTTGAAATACTTTAAAAGCTGCAgccctgtttatttaattatcttgtatAACATTAATCAATTTCATTACtttataatatatcatattttatcatattgttacatttttttgattattttctaATTTACCGATTTCAGTTGTGTTGATTTTAGTTTACGATTGTACTACAAAAGTTACtgaattcaaatgtaaaaaaaaataaataaatattgttttgtgtACATTGTGCTTCATTTTAATACCCTGTTTTAAAAACCACAATGGGTCTGCTAATGATACTTTATTGCAGTTTAGCAAAATCTAttaggtaaatttttttttacaaatttatggaATGAACAGTAAAATGTTTCTGTATAAACATTGACTTAAGAGGAGGTAAATTGTACTCAGTATATACTGcaaatttacaaaattaaaacatttaaatcaagCAATAACTTAACAGAAAATATACTGGCAAAAAAATTACTTGGtttcttctgtgtttttttttttttattggactTGTTTTTACAGTGGCATCACGGTCAcgcagtgggtagtacaatcAAACAGCAAGAAAGCAAGaagttggaagggcatcccctgcataaaacatatgctggataagttggctgttcattcggctgtggcgaccccggattaataaagggactaagccgaaaagaaaatgaaagaatgttttttttacagtgtacaagaaATACTGAAGTCAGTGAAttctggtttccagctttcttcaaaatatcttcttttgtgtttaatggtAAAAggtaagtcaaacaggtttgaaacaaatgaatGGTGAGTAATTGATCAAATAGTTTTCAGTTTttgttgaactatcccttcaaatgAACTGTCATTTAGTCATTTGACTGTAAACAGCCTTTTGTTTCCTGCAACTTCATTCACAAATTTTCTGATGGCTTTTCATCTGCACAACAAAAGAGCACAGAAACCTGATTGTCCTAAAGCACTTGGATCAAACTCAACAGAATTTACTCTTAGTTTTCTTTGCACATTCTGTGGGGAAGTCTGTGGACTTGGTGAAGAGTTCAGATGTCATATCAAATCATGTAAAAAAaacccgattttttttttttcccacaggtTCCTGTGTGTACGTTCAGTAATATAATTTTTATGGTGATGAATGGGTTCTTTTTGTTACCTTTAAAATGAAATAGTAGAACATTTCGGATTGCATTTAgcctttttttgcatttaaacactTAAAGTATGACTCTCTCTCTACTGTATATGTTACATAGAAGTTAATTTGGCATTTTCTGAAAATCTTTAAAATCAAAAGATGTGCAGTTACAATGTTCTGCTGGCACAGAAAATAGTTTCCTGTAtgtgaccatggaccacaaaaAATGTCTTACTTTGCAttgataaattaaaaatacattgtatgggtcaaaacgAGCAACTTTCCTTTCAAGCCAAAACTTATTAGAACCTTAAGATCATTTTCCATtaagatatttaataaattttctactgtaaatataccAAAGCCCAAATGTTGCATTCCTAAGAACTTCATTTGTacaactttaaaggcaattttcccAGTAATTTCTTTTTCAGATTGCCTTAAGACTTTAGATGTAAATATTTCAGATGCAAATAGTTGTATCTCAcccaaatattgtcctatattaaaatgtatacatcaattttaaaattgtatattcagctttcagatgttatagaaacattaaaaactgattttttattaTGACTAATAACTCTttttgtggtccatggtcacaTATTCTATTCCCACAATGGCTCTGAATTACCCACTAAGTATGTGTACTATATAAGGCTAAACCACATAAACCTTTAGCTTCCACCAAAGCCTCACCTGACATTTAAGTACATGGTGCCCTCCTGctatttacaatacattttgttGTGCATACAGACACGCGCACCCATTAAAGCCAACAGCACATGATAGAGCTTAAGACGCTTAGCTATGCTGGATGCTAAATCTCTTTACAGCCGGCATAACTCAAGTCTTGCTGACATGCTGGTGAAATGGAGTGTCTTATATCTGTTCAGGCTCTGTCCTGATCGGAAGTGCATTGTCTGGGCTACTCAGAGACACTTTTGGCTTCTTATGTACTCAGTGCCTGAAACATGATCGATGCTGACGGTATCAAAATCTTAATGTTGGTGAGTtcagaaaataaaagaaagtacATTTTGAAAAGCGCTTGTGAGCGGCTGCAGGGGCATTGCTGCTATATTTAGTTATTTGAAAGCATGactaaaTGGTTAGCAAAAGTCAAAAAAGCCCACTTAAGGGTCTCTATGATATTAAGGTTTATAGATATGCTTGGGTCCCTCCTACAGTAATATTTCCTGTTAAATTGCTGCTGTTGGAAATTGTAATATCGAcgctatctcacagcaattcaaaACTTTTTAATTTGGTagataattttaatgtatttgcatGATCTCATTAGTACAaaagggtatatgcagaagtatgcagaaggacttttaattttgtaGTAACCTAGGTCAGGCACTTCCGGTTAACTGTATGCAGTTACAAAATCAGCACGTTAAGGGggaattctttaaaaaatcaaCGATCTcaactgcctgattgatatacgatataaagagGGTCTTaaattgtacaagaagcactgcattaaatt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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00030188 True 7795 lncRNA 0.33 2 16036012 16044582

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014657 NA coding downstream 4907 16026893 ~ 16031105 (-)
XLOC_014660 CR385068.3 coding downstream 6569 16029308 ~ 16029443 (-)
XLOC_014659 CR385068.1 coding downstream 7422 16028456 ~ 16028590 (-)
XLOC_014658 CR385068.2 coding downstream 8522 16027419 ~ 16027490 (-)
XLOC_014656 cited4a coding downstream 180585 15851226 ~ 15855427 (-)
XLOC_014662 CU633478.1 coding upstream 385056 16429638 ~ 16434043 (-)
XLOC_014663 NA coding upstream 714792 16759374 ~ 16765817 (-)
XLOC_014664 CR318590.1 coding upstream 955045 16999627 ~ 16999742 (-)
XLOC_014665 NA coding upstream 1065011 17109593 ~ 17113603 (-)
XLOC_014666 NA coding upstream 1156093 17200675 ~ 17201052 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc upstream 3684108 19728690 ~ 19728755 (-)
XLOC_014646 NA non-coding downstream 1969462 14062042 ~ 14066550 (-)

Expression


Co-expression Network