XLOC_014713


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_014713
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 19780147 ~ 19786187 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00030207
CTCGTGGTTGCCACACTGACAGAACTTTGGGCCCGGAACTGATTAACGTCGCACCATTCACCCTGGGTTGAGCCGAGGCACCCTTCTGCCTCCTTCAATCAGTCGTGGATTGGAGGTGTTCGGGCGCTAGTGATATGAATGACCAGTGACAGTCACGTGGGCTGGGTCAGCCAGTGATCAGTTGTGCTGTCTCATCTTGATCTTAAGTGGCCTTGCACTGACAGGTTGTCGTTAAAGACCAGGCTTATGCAAATGCCGACCTCTTGTCCATCAACGTTACGTAGGCCCACCTTTACTTCTGCTGAAAGGATAGATTCGCTGGCAGATACGCTAAGAGGGACGTTGTCTCACAGACAGCGTCCCGGCAGCATCAGCTTCTCGGtgtgtggattttttttaaagaaatgcttcAGGGCTGTCCGGCGATGGATGACAGGTTGTTTTAAAATGAGTTCGACTCTTCGTCCACAACGACCAATCTGCCATGACTTGGGCCACAAATGAAGGCTTCCTCGTCGCTCTTTGCACCACACTCATCGACATTTTTCCTGCCTAGTTTTCTGTAGATGTCCATAGTTTTGGTTTGACGTTTATGTTTTATTCGTCGGTTTTAGAACCAGACTTTGACCTAGCGTTCCGCTAGCTCGAGCAGTGTGACTATTTCCACACGGCGTGGTCGGCTAAGGTATCTGTAGTGGTACTCCTTCCTGATCCAAAAGCTGTTTAATGGTGCTGTTCTCAGGCGGCGCGAACCTCCTCGTCTACAAGACAAACCACTGTAGGGAAGCTCCGATGAGCCTGGAAAAATAAGTCGACAAAAGAGCAGTCGTTTCAAAGTTAACATTATGTAACATAGCAATGCTTTACAACACCTAGAATTTTAAATGCCAACAAGGAAATGTGATATTACAATCTTCACTTAAAAGTTTCAAGAAAAACACTGTAGACGCAAACAGCATGGACCGTCTTCATGGTACTGACTAGCAGTTTATAATGAATGCATGAGCGCCACTTGTGTTTAAACAGCAATATATCATTCTTCATTAAGCTTATCGATTCAATATCGGAGTCAGACATTTTGCAGAATTTTCACCCAGGCTTTATGGGTAATATTGTAAATAGCAGATGTAAAGAATGACCTTAAATTACCCTATTTTTTTCTGGTAAAACTTACCTTTTGGTGAGAAGCAAAATATACCGGCTTAACCCATTCCTGTGGAAGGACAATTTTCTTGTTGGTATTTTTTCGAGCATCCAAGGTTTTAGACAACTGGCGTGCAATGGGCTTTCACAATTTAAGCTATGCCGAGGCCCTACATGGCGCTGCTGACTCCCGTGACTCAAGCTTGGAACGTTGTGCTCAAAAGGAGGAAGGATGAGAGGGTGAGGGTTCGTAAGTGCTGAGCGTTTGATTGATGACTTCTGAAAATAAACCACCAACAGAGGAAACAGAAGATACTCCGCGAGCGATGGCCGACTATTAAACCCGTCTCACGCTCAAAGTTAACGTGTTGTTTGACGATTGGAGAGGCCTTAATTTAAATTTTCGCTCTTGATTTAAACATAGTAACATGCTATAGTGGGGCTATTAAGAAATATAATTATACCCGCTGACATTTGACAAAATTACATTCAAAGCCAGTTTGAAGTTTTGCAGAATTACCATTACCTGATGGCAGTTTGTGGTTTATTCCAATGTTCAGGTCAATCCGTAGAACTTTTTTGAGCAACTCCACTCTCAAGATAGATGCTGGCGCTTTGGTCATCGTTGTCATTACAATCGTTAAAAAAGCAGTAGTCAAAAAACGAAAGTCAAAGTGTTTTTATCGGTTATGTGACGAGATAAGTCTTTCCCCAATACTGTAACCAGTGAGGCTAAGTTATgtctgttatgtttttttttatcgcaTGCGCCCTAGGCCAGAATTTCAGCTCATCTCATATTACTATAAATAATACACATGAATGAAATCTCTAATTCCCCTCACACACTTTTACCTTAAGGTTTAGGCTGTTACTTCTTAAGAgtaagacttttaaagatagCAAATTGCTATAAATACAAAGAATCGGCATAgaatacattatttataaaacgaTCCTTATTTAAATGACTTATGCAGTACCTCAATGCAATACTATCATGAAAGATAAATTCATTTATATTCAATATTCTGAAGGATTCACAGTCTCTCATTCAGTCTTGTTTCAACGGAGTACTGCGTAGTCCTCTGTAAATTATACGCTTCATACGAAATATTCAATTGGAGCCTTATTAAGCATGCACATCCTTAATGTTTGGACAGTGAGGAGTGTTAATACTAAAACTGAATTTCACAAAATACCTTATCTGTGCTCTCTTTTGTTTCACAATTTAGCTTCCACTAAACCTTACATTGTATGTTATAGTCTGCAGTGAAAATGTGGCTCTGTGACAAATTGGTTCTTTACGATCTTTATTCACATTGGATAAAAGCGTCTCCTAAGTTAATGAATTGAAATACAGCTAGCTTATTTGAATAGTAGAACTGGCGTGCGTGTTGTCTGGCACTTTTAGATTATTAAAAACGTTGTTAGCGATTTACATTTCTGTGTAGGCTATTTGTGGATAGTATGTGTATTCTGATTGAACGTTATGGAAAAATGTGCTTGTCGTTTGTAGTTTTAGTGGTTATTTACTAAACAAAGAGTTCCAGGCTTGCACATGATCAATCTTACTTGCCAAAAGGTCTGACCGACTCCCCCGCAACCCATTTTAAAGCTTCTAGCTGTGCTCGAATCAAATCCTGGCAGAACAGGGGGTGAAAAAGCTACATTTGATAGATTCACGTGTTTGTCTTGAAGTAATGACTTAGCAGTTTCATGTTTAGCCTACACTTACATACATTAACGTTTAACGACGTTATTTGCTTTGGATGTTTTTGGTTTAACTATTTTTCATTGCATTATTCTATgaatgaaaatagaaaaaaaaaagttagcgtACTGGGTGATGGAGCTTTTCACACGTTGTCGAAAACATCCtgttaattcaacaaaacttatTTGAGTTTATCAAATTAAGGTTTACACACTATCCCCTTTATCCCCTATGTTCAACGCACGCTAAGTTATTTGTTATGGATCGTCTTGTTAAATTTACGAATAAAGTGTAGATTGGTAAATTATTGTGGATGTcagttattattaattgtaaagtTATTATTGTTGGCCTTAAGTGAATAAATTATAAACTGTCaaactttttttctattattattatcattattattattattattattagcaacacCAACATTAATTAATTGAACTGCTTATGTTGCTAATGTTTTTACACATCGCATTGTTGTTGGcctaaaaatggcaaaaaaaaaggcatttaaaaCATTTCTCCCACAGGCACCACGAAAGGCCTATAGAAGACTGTTAGGACAATCAATGGGATTGCTTGCACTTTTCAAAACATCCAGTACTGCAGGAAATGACGTCGCACCATTACACTGTGGCCGTTTAGTCTTTTCTTAATGTCTTTTAAAACCAATTTTGCTAAATTTTCCTTATTTGAACTAAACAGCCGCATTTGAGCAAGATATCAGATTCTGATTGTCTATTTTCTGTTTCTGATCCTTTTGTTGAGTGATTCAAATGCAAATACGTAACCCCCTcagattctttctttcttttatttattttttcagaagtTGAGCAGCATGGAATATCTAACATGGAATGTCTaaatatttgaacaaataaaaagtaTGAGCATTT

Function

GO:

id name namespace
GO:0044424 obsolete intracellular part cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00030207 True 3768 lncRNA 0.38 2 19780147 19786187

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_014712 NA coding downstream 39751 19738779 ~ 19740396 (-)
XLOC_014709 CR382300.5 coding downstream 70105 19709927 ~ 19710042 (-)
XLOC_014708 BX601646.1 coding downstream 115404 19596605 ~ 19664743 (-)
XLOC_014707 tax1bp1a coding downstream 180775 19549062 ~ 19599372 (-)
XLOC_014706 NA coding downstream 267810 19510557 ~ 19512337 (-)
XLOC_014714 mpp6b coding upstream 275705 20061892 ~ 20106486 (-)
XLOC_014715 npy coding upstream 324512 20110699 ~ 20114149 (-)
XLOC_014716 NA coding upstream 351492 20137679 ~ 20143137 (-)
XLOC_014717 znfl1c coding upstream 357663 20143850 ~ 20148469 (-)
XLOC_014718 NA coding upstream 367483 20153670 ~ 20154323 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc downstream 51392 19728690 ~ 19728755 (-)
XLOC_014704 NA non-coding downstream 318850 19459051 ~ 19461297 (-)
XLOC_014701 NA non-coding downstream 440810 19275813 ~ 19339337 (-)
XLOC_014720 NA non-coding upstream 405697 20191884 ~ 20199210 (-)
XLOC_014725 BX927400.1 non-coding upstream 652955 20439142 ~ 20439260 (-)
XLOC_014728 BX511212.1 non-coding upstream 1330224 21116411 ~ 21116543 (-)

Expression


Co-expression Network