XLOC_014929



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_014929
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 34660712 ~ 34687552 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00030298
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>TCONS_00030302
ctgagcttcatgtcgaacgcacctaatatCACACCTCGGGCATGTGCTGTTTCAATACGCAATATTTCTTTAAAACCAGTCCTTGTCCACAGATCAATTTGGCTACTACTTTTTGCTCAAAATGCTAACTGTTCAGCTAATGAAACACCTTTCCAAAAACGTTTCCATACAAAGTTTCGTACCAGAACTCCCTAATGTCGAATTGAAGGTtcataatgaattaaattaaagaaaagaaaaaagtggtACAGGTTTGGATCAGcgtaaagACATGAGAAACAGGCGCAATAAATTACTCACTGCATATTCCCATGGCAGAGGTGGTGTTATTTTGCAAGGTCAAGGGACCATCAGCTACTGGGGGTACAATGCCTTCTACTCTTAGTACAAATCAAATGTTATGTAACCACAGACACctactttttctctctctctccgttcGCCTCTTGTTTCATGTGTGTTTTCTTTCTGATCTCTGCTATTTCTCACTACCATTTGAATGAGTTTGTACAACAGAATGCACACATATGAGCTAAAAGCCCTGTAGGTTGTGAGATGGAGCTTGTCCAATATATCCTACGGATGTTTAGTTTCATTGAGCTTTGGAGAATTTGGAAATCTAGGGTAACACCTTGAAGCTTTCATTATGTTCTTCAAAAATTCCTAAAGAATATGTCCAATGTGAGAGGGTGGACAATCCTGATGAAGAGGCCACACAATAGGGAATGCCACTGTCATGACTTTCATGTAAGGTTCTTCAAGGTAGCATGTGTAAAATTTTCATTCACATGAATAGCCAGACCCCTAGGGTTTCCCAGCAGAACAGAACATCACACTCTCTCCACTGGCTTATTGCCATCCAACACTGCAATATGTTGTCTTTAATACTCCAATTAAATGGCTCAAATATACACAGCCGTCCATTTTTTGTAAAACGGGACTCATTGGGGTAACCATCTGGTACAGTTCTGATGCTTACATACCCATTTTAGGCACTCTTGATTGACGGGTCATTTTTGGCTCTCTGACTGGGCA

Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00030302 True 1035 lncRNA 0.40 5 34677004 34687552

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_014927 NA coding downstream 430427 34188192 ~ 34230285 (-)
XLOC_014926 si:dkey-184p18.2 coding downstream 543656 34091552 ~ 34117056 (-)
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XLOC_014923 elmo1 coding downstream 597145 33887589 ~ 34063567 (-)
XLOC_014930 elp2 coding upstream 4093 34691645 ~ 34742440 (-)
XLOC_014931 ctnnal1 coding upstream 64135 34751687 ~ 34873566 (-)
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XLOC_014933 ndrg1a coding upstream 272415 34959967 ~ 34979837 (-)
XLOC_014934 si:rp71-45k5.2 coding upstream 306881 34994433 ~ 34995629 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc downstream 14931957 19728690 ~ 19728755 (-)
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XLOC_014942 BX957241.1 non-coding upstream 733283 35420835 ~ 35420951 (-)
XLOC_014948 NA non-coding upstream 2022946 36710498 ~ 36731093 (-)
XLOC_014949 NA non-coding upstream 2141399 36828951 ~ 37120328 (-)
XLOC_014951 BX571837.1 non-coding upstream 2540358 37227910 ~ 37228025 (-)
XLOC_014953 NA non-coding upstream 2835025 37522577 ~ 37569033 (-)

Expression



Co-expression Network