XLOC_015028


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015028
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 43704915 ~ 43711293 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00030343
tcttttgtaaagctgcaatgaaacaatatttattgtaaaattcgCTATACAAATGAACttgaatttacatttacatttagtcatttagcagacgcttttatccaaagcgaattTTGGTTGCCTTTCCTTTATTGTCCAATGACAAATAAAGTCAGCTGTAAATatattcctttttatttattccaCTCGAATTAGAACAAGTCACATGAAACAGGGAATTCTTCATTAAAAACATCCGaaggaaaacaaaaatgaattaaaaataaaaaatcccttTATTTCCCCCTCATGCATTCAAAATGTGCAAGACTCCGATGTGAGTGGGGAAACATCAAAATAAATCTCACACACGTCATTAATAACATTCAGCCTTTCCCTAACAAAACCAATTGACGAATTCTGACAGAAAGCATCATCAGAAAGCCAAAGAGAGCACACAATGCTTTTGGCAAGTGTAACAAAAGATGATCTATGGATTTGGTGGCTATTCCAGCTTGAGCGAGCCAGACCCCGTCCTGTTTATATTCAATATCAAAACCAGAGGGGGGTAAAAACTAGCAGCTAGCTCTATAGTGCAACACCCAATGCATTTTCCAGTGTACGATTTCCATCCTTAAGATTACAGGAAGCCCTGATGAACATGGCTATAATGCTGCAGGCGTCTCGTTTGCTGGTGTTCGAAGGGGCAAAAACGCACCTCTGACATACAGCAAAGTAGCACACGCACATTTCTATACATGCAAACCATAAAAAAGTGAGAAGATAGAAACCAAAATCTTGATTTCTCATGCAGTCATACATGGCATTTCTGGGGTGCCCCAGGACTCATTTctctgcattattattatcatgtaaaaatatacaaatgaacaGACGTGACAGGCAGTAGTGTTTGGATGCCTGTcatatcacactgcaaaaaatgatttgtttacttgagtttttgtctcgtttctagtccaaatttgTTAAAATACTTAAATTTAGAAGCATTTTATATCTAGACAAGTCAAATGAGAAATAGTTTTGTTATTAGACATAATAAGTCAGAGGTttgttcttaaaacaagctaaataatctgtaaGTAAgtgtgtcctgcaaagtttagctccaaccccaattagacacacctgaaccagaaacgtccaggcaggtgtgttgaagaaagttggaactaaattatgcaggacaccggcccttcaggactgagtttggacacccctgctttacttGAATAGGGtgtttattagattttcattagtcatgaaacctttataatcattacATGACAAGTCAGGAATGTAAATGGGATTTTATGCATGGTtataacaactgttattaagtgtaaTTCGCTcagtaatgtcattttaaatgcaaatatgacattgttatgacaacttgacatacacaaatacattacAACCGGTCTTTGGCAACTTGACACTACcgagacaacataacttgtcataaatctgtcataaacatgattgtcatgaagccaatataatataatataacataatataacataatataatataatataatataatataatataatataatataataaaatataaatataatataatataatataatgaatattttCTGATCACGTTTTCACTGTATTTGTCATTGAAACGTCTCATTAAAGCGTCTTCACTCCgtcaaaaaaaatttaacagcGTCATTactatttaatgacattttaatgttaaattcAGCTTGTGCCACTTTAGTTGAGGTCAAAAAATAgattaatgatgctgttataaaattTCTGACATATTAATAATGGCTTTATGACAGTAATGTTGATGAtggatttatgacaagttttgctgtCTTGGAAATGTCAAGTAATCTTGACAAAGTCAAAAACAGGATGtggtgtatttgtttatgtcaagttgtcataacaaatagAGTCGTCACGATATTTTAGGATATAATTTgctaccaatcggtactgaaattttaaaaaagtaaatttccCGCCAACAATTGAGCGCATTTTTAAATCGCGCTGATTTCCATTGTGTTCACCtgctcaacaaaaatgactgaccgtgaaggtcatcagttcactgaactcactgctgtttactgagtgaaacactccagtgtccctgtatctgtgattacacttagtaaacagcggtgagattggtgaactgatgaccttcaggGCCAATCAAAGTCATTTTTGTAAAGCActggtgaacacaatggcaaatcagcgctgtttaagaaaacgctcaacagcgcttaaatgttagcaggaaatggacgtttttaaaacttcagtattgaTTACACTAATAACGAACAATTtaaatgtctcattaaaagtgTAATTACTCCGTCAAATCATTTTTAAGAGCATCACTACTATTTAATgacaatttttaaaatgtcaatttcaCGTGcagtttaagaacgtgctcaacagtgcttaaatgttagcgggaaatggacgtttttaatttcagtatcgattggtaccgaattccagtattctGACAACACTAATAACAAACAATTGaaatgtctcattaaaagtgTAATTACTCTGTCAAATTTTTTTAACagcgtcattaatattttatgacattttaatgtcaaattcagcttgtaccactgtagttgaggtcTAAAATATAgattaatgatgctgttataaaaatcatgacacatttataatggcttcatgacagATTTATGGCAAGTTTTGTAATCTTGGAAATGTCAAGAACTCATGACAAAGTCAAAAACAgaatgtgatgtatttgtttatgtcaagttgtcataacaaatagggttgtcatgatactggaattttaaaaacgtctttttctcgctaacatttgagcacgttcttaaatagcgctgatttgccattgtgctcacatgctcaacagaaatgactgtgattggctgtgaaggtcatcagttcactaaCCTCACCTCTGTTTACTGAGTGAAACCGcatatacagggacactggagcattttaaagtctTGTCAACCAGctagtttgtctataagctgacataccaCTGATGAATcacagctttaaaacgctccagtgtccctgtatctgcggttacacttagtaaacagcggtgagtttgaaGTCACCTTCACGTACAATCACAatcttttctgttgagcacgagaacacaatggcaaatcagcaatgtttaagaacgcgctcaacagcgctcaaatgttagcgggaaatggacatttaaaaaatgttagtatcgattggtactgaattcagtatcgtgacaaccacTACTAACAAACAATTGCAATGTCTCATTAAAAGTGTCATTACTCTGTCAAATACTTAAATATATTGATATTAATtcaatatttaatgatattaatatgtCATCAAATATTAATGACGCTGATAAAGTCGAAGTCAGCTTGTACCATTATAGTTGAGGTCAAGATATATATTAGTGACGctgttataaaatttaaaaacgtCTATTTCCCGGTAACATTTCAGCCTGTTCTTAAAcggtgctgatttgccattgtgctcacatgctcaacagaaatgactgtgattggctgtgaaggtcatcagttcactaaCCTCACCTCTGTTTACTGAGTGGAAccgcagatacagggacactggagcattttaaagtcacGTCAACCAGctagtttgtctataagctgacataccaCTGATGAATCACAGCTTTAAAaagctccagtgtccctgtatctgcggttacacttagtaaacagcggtgagtttgaaGTCACCTTCACGTACAATCACAatcttttctgttgagcacgagaacacaatggcaaatcagcattgtttaagaacgcgctcaaatGTTAACGAGAaatggacattttaaaaatgttagtatcgattggtaccgaattcagtatcgtgacaaccctactaATGTCATCTTTGCATATAACATGTCATAACTGAGCGAATGACACTTAAGGACAGTtgccataagcatgcataaaatctcattcacatgcACAACATGATTATATGACAACCACAACATGATCGCATTCATGAACACTCCAAGTAAACCAAAAACAATGCTTTTTTtcttacctcattggcagataatttagcgtAAACGAATTTAATTTTGACTTAcgatttctaaaaacaaaacactattttgTACTCGTCtataaaaagcttcttgatttaagaattgttatatatttggactaaaaacaaggcaCAAACTAAAGTAAGAAACACATTTACAGCAGTGCGGGAAGCTTCTTAGGAAGATGACAGTGATGAGGCTCAGTTTTTGAAACGTTTCTCAGATATTCACTCACCGGACACCATCTCTGCACTACAGCAGGTACATTCTCATTGCCTATTCAGTTGCATGGCTTTACAGATCTGACCTGTCGGGTTTAATTCCTTCTCATGTTGGCTCAGGGCTGCGCTTCAATTCACTCCGGAAGTCCTGCAGTTCCTCCATGTGCCAGATAAGGGGTGAATACAGTGTGTTGGTGCAGTACGGGAGCCGTGCTAAAGCAGCTCCTCTCGTGTTTTTTTAGGTTTATGTGGACCCTGGCCGTTACGTAGAGATCCGTTTTGGGGTGGAAGCAGCTTCCCGCGCTCTCGATCTGACCAGGGGATTCCTGCTTGACCGTCGTCACTTTCCAGATCAGAGTCTGAGTGCATGAGTGCAGAAGATGTGGGAGCTGGCACAGACTTCAGACGACCTGAAGGAGCACACAACAGCAGGAGATCAGGTCTAGGTAACTTTAACTCCATAGTCTCTTGATCATCCTCGTTCAACATTTTATAACGGCTCTTTCGTCTCACTTTGCTTTTCC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00030343 True 4872 lncRNA 0.36 2 43704915 43711293

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015027 si:ch211-193k19.2 coding downstream 45136 43654238 ~ 43659779 (-)
XLOC_015026 fam83hb coding downstream 65584 43612179 ~ 43639331 (-)
XLOC_015025 gpr186 coding downstream 152663 43547465 ~ 43552252 (-)
XLOC_015024 NA coding downstream 162347 43429805 ~ 43542568 (-)
XLOC_015023 NA coding downstream 422117 43272241 ~ 43282798 (-)
XLOC_015029 ppt1 coding upstream 24976 43736269 ~ 43757568 (-)
XLOC_015030 klhl43 coding upstream 79639 43790932 ~ 43819610 (-)
XLOC_015031 NA coding upstream 186647 43897940 ~ 43901052 (-)
XLOC_015032 uqcrb coding upstream 338208 44049501 ~ 44065581 (-)
XLOC_015033 rad21b coding upstream 356957 44068250 ~ 44091405 (-)
XLOC_014711 CR382300.3 misc downstream 23976160 19728690 ~ 19728755 (-)
XLOC_015022 NA non-coding downstream 453165 43250524 ~ 43251750 (-)
XLOC_015020 CU207343.1 non-coding downstream 674027 43029382 ~ 43030888 (-)
XLOC_015018 CU207343.2 non-coding downstream 721228 42962095 ~ 42983687 (-)
XLOC_015035 NA non-coding upstream 1292508 45003801 ~ 45007057 (-)
XLOC_015036 FP340497.1 non-coding upstream 1446209 45157502 ~ 45244708 (-)
XLOC_015038 NA non-coding upstream 1977944 45689237 ~ 45690415 (-)
XLOC_015045 NA non-coding upstream 2701320 46412613 ~ 46420558 (-)

Expression


Co-expression Network