XLOC_015289


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015289
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 14502058 ~ 14506622 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033502
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>TCONS_00033505
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CAAATGACTTTGATTACCTAATCATCAGCAAAAATAAGCAAATGTTGTCAATTTAGGCGTCAAGAGCTTTCACCTTCCCTGATGCTTTTATtctaatttaatactttttttgttgaaaaaatacAGCATAGCAGTAGACAGTCAGAATATTTTGGCTAATAATTGTCAGTAAAAGATATACTGAAGTGTTGTATAAATTAAGTAGAGTTCAAGAAAACCACATAAATTATTTTCTACTGCTGTGGGCCTGGGCATGGAGCGGAGCTGGAGAAGGCCTGGGCGTGGAGCGAAGCTGAGGCGGGCCTAGGTGTGGAGGGGAGCTGAGGTGGGCCTGGGCGTGGAGCTGAGGCTGAGCTGAGGCAGACATGGACGTGGAGCTGAAGCTGAGCTGAGGTGGGCCTGGGCGTGGAGCTAAGGCTGAGCTGAGGCGGGTATGGAGCTGAGGTGAGCCTGGGCGTGGAGCTGAAGAAGGCCTGGGCATGGGGCTGAGCTGAGGGGCCTGAGGTGGGTCTGGGCGTGGAGCCAAGCCAAGGTGGTCCTGGGCATGAAGCTGAGCTGAAGCAGGCCTGAAGTGTAGCAGAGCACAAAGCTGAGGAGGGCCTAGACGTGCAGCTGAGCTGAGGCAGGCATGGGAGTGGAGCTGAAGCTGAGCTGAGGCGGGCCAGGGAGTGGAGCTGAGGCGAGCCTGGGCGTGGAGCTGAAGCAAGCCTGGGTGTGGAGCTGAGGAGGGCCAGGGCCTGGAGCTGAGGCTGAGCTGAGGCGAGCATGGAGC

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033502 False 4014 lncRNA 0.48 2 14502058 14506622
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TCONS_00033245 True 772 lncRNA 0.55 2 14503216 14504717

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015288 NA coding upstream 169180 14325056 ~ 14332878 (+)
XLOC_015287 NA coding upstream 281421 14220028 ~ 14220637 (+)
XLOC_015286 NA coding upstream 539661 13961129 ~ 13962397 (+)
XLOC_015285 NA coding upstream 543482 13950058 ~ 13958576 (+)
XLOC_015284 cpdp coding upstream 561141 13907452 ~ 13940917 (+)
XLOC_015290 CR388189.8 coding downstream 153734 14660356 ~ 14660546 (+)
XLOC_015291 CR388189.7 coding downstream 158546 14665168 ~ 14665353 (+)
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XLOC_015293 CR388189.6 coding downstream 169173 14675795 ~ 14675985 (+)
XLOC_015294 CR388189.1 coding downstream 206772 14713394 ~ 14713538 (+)
XLOC_015280 NA non-coding upstream 1150759 13347400 ~ 13351299 (+)

Expression


Co-expression Network