XLOC_015571 (BX323559.6)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015571
gene name BX323559.6
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 32604847 ~ 32608027 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031118
aaggttcattgcgatcccaaggttcactgcggttttccacaagatgcagaaactTTTGACATATGAATTCATCTTGATTAAGGaactCTTCACAGCACTGCACCTGAACAGTCACAACCTCACAGAGCTGCACAACTGCCCCACTCAAGATCAGTGTTGAAGCTGGAACCTCATCTTGTGTACAGCAAAGGCAGAGCTGAAAATTCACTGTTTGTCTTGTATTGTGTGtggcaaaacctggaataacacatgggagccctccaggaattcctgacactttacgcccaagtctcctcatgctaaccggattgcaatatgacagtctagtcagcataaacacctggactcaccaagcacactttggttctcagtgttttgtaaaaatagtttttgctattcttcagtaaatacttgaatatgttttgaacttattctacttttgatgtttaagttcagaaagttgttattataaacataatttgcatttgtcatgaacttgacttcttgttgttgtgaaagctgtttattataatggcatttccaaaggcatcatttgaaaagattttttgctgtgcagttttacttcagcttgacataccagatgtatgacatgaataaatatcacaaaataaatataataataataatacaaaatatatatttccttcaattataatagtttttaatcatttatatatgtatggtaatatattattgcattaaaaactgttataaaatatatatttttggtttttgcaTTTTTgcgtgatttttattatttattttatttgtggcattataaataaattataaatgtttca
>TCONS_00033587
ggttcactgcggttttccacaaggtaagtaaaaagtaaacaaataaagacgatttgttgataaagcatgtactgtaaactagcgacgttatctaattacatcaagtccatttattaaaaacatatttttctcacatataacgttggtcatgcattagaacaatatatacatttcaagataaggaacagtgtaaccagattgttgttttccacaatagaattcgtgcaaaatctatatataatatgcaatatgcaactctaataatacaaatgtattcgtaattgtttcaatgttaaagaacatcaagtgtttccaaacgtttaaaggctacattgtaaaaacaattattttccatgcctttaaacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacatacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgtaagcaTAACAAAAACTCAAGTATAACATAAGCTGATGTATGTCACACAATGAATATCATACTATTACCAGTATAATTTGgcctttaccaatttatttaataaaagaaagaatctttcatctctaaattgtggtaaagaggcacaacaagctgtcttctttgtcaaatattatgtcaGTCGGGATGGTAATGGTAAAACTCAAGGATTACCTTGCACCTTCTCAGAAATTTACCATTGATCATATGTATTATAAGTGGctggattgtttttaacacaagcaacgtttttttaaatcattatcctAAAGAGATTAAGGCTCATTTTGGACTACACTTACATTACTTTACAACTGCTTAATGCAGTACTGATGTATCTAGTAGTTTAGTGGGTTTAACTaatgtcacatctgtttttattcatttcagatgcagaaactTTTGACATATGAATTCATCTTGATTAAGGGTAaggtttttgttcagaattaatcattatttaaaatcattgtattttctttGCTATTATGTACAGCTTTTAAAAGAATAtactttcttttaataaagaactCTTCACAGCACTGCACCTGAACAGTCACAACCTCACAGAGCTGCACAACTGCCCCACTCAAGATCAGTGTTGAAGCTGGAACCTCATCTTGTGTACAGCAAAGGCAGAGCTGAAAATTCACTGTTTGTCTTGTATTGTGTGGTAAgtcatagttttattaatttttaaattgtattgcaacactaagtagtccattctgtggccaatatgatataaagggcctaaaatgggactgacgtgatcattgttttgatttctagATAAGTACTCATGGGGCAGCACATGCAGCTGAAGTTAGCTACATTGAGTAGGACATTTCTTTCAgtatactcttaaagagattcaccCAAAAAGAAAAATTCTGTCAATAATGACTCatacttcacttgttccaaatatgtctgagttcctttcttcagttaaacacaaaaaattaaattttaaagaaagatgaaaacctgcaaacactgacttccatagtatttgttttttcctactatgtatgtcaatgttttcagcttttcagctttctttaaaaaaaataaaaaaaaaaaaccttcatgttcaacacaaagtaacttggaagttttttaaaaaggtttacaaccacttaaaggagagtaaatagtgaactattcctttaacccaatctagttgactttactagaaaattgtatagaaacccagtggcttaaaccccttacattttatacaaggtacaacttaacagccatacttgaattaaaatattactgtaagttcaagaagattgtaaaggttctaggttaatttaaagtgggctgtttagtttcaccttgtgtaaaaacattaAGGGTTTAAGGCAACATGTTTCGATGCAGTTTACACTCTTAACCCaaactagttgactttattagAATAAAGTCAACTAGTTTGGGTTAAGAGTGTAATGGTTTACAGTAAAAGCAGTAAATCATgcaggcataaaataaatgtttagcccTGTAAAGCAATAAACTTGTtacaatttagaaatatttttagggTGGAGCACAGTATGCTGTTGTAGTTTTCATATAATTGATGAGTCAAACGTgagatgtgtgttttaaattgcaagaagtgaattaacaatatgttcatcaagattcaaatcttgcatcttatatttttttaaggttttggcccaataatacccatattctgctatttaaaaaaacatgctggaatttgtgtcagcattcccttcaatgaaaactacagcagtggacatcagtggtgataaaaatgtatgaGAAGCATAAGGGTGTTCATAATGAGAAGAGCAGTCACTATCCTGATCTCTGAGTTTATAGAACTGACAGATCTGCTTGGAATACATGGaaacatgctggaaatgtttaacctattatacagttaattcaagagtgccaggtttaatgacactttacatatataaattaatatcactgaactttctaaatgaaacctaacactcattctttgttcagtaatggtattgtgcacttctaatactttacagtggcaaaacctggaataacacatgggagccctccaggaattcctgacactttacgcccaagtctcctcatgctaaccggattgcaatatgacagtctagtcagcataaacacctggactcaccaagcacactttggttctcagtgttttgtaaaaatagtttttgctattcttcagtaaatacttgaatatgttttgaacttattctacttttgatgtttaagttcagaaagttgttattataaacataatttgcatttgtcatgaacttgacttcttgttgttgtgaaagctgtttattataatggcatttccaaaggcatcatttgaaaagattttttgctgtgcagttttacttcagcttgacataccagatgtatgacatgaataaatatcacaaaataaatataataataataatacaaaatatatatttccttcaattataatagtttttaatcatttatatatgtatggtaatatattattgcattaaaaactgttataaaatatatatttttggtttttgcaTTTTTgcgtgatttttattatttattttatttgtggcattataaataaattataaatgtttca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000094100

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031118 False 821 processed_transcript 0.33 4 32604847 32608027
TCONS_00033587 True 3161 lncRNA 0.31 1 32604867 32608027

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015570 NA coding upstream 213873 32385688 ~ 32390974 (+)
XLOC_015569 NA coding upstream 338175 32264355 ~ 32266672 (+)
XLOC_015568 NA coding upstream 415856 32149121 ~ 32188991 (+)
XLOC_015567 NA coding upstream 476917 32019642 ~ 32127930 (+)
XLOC_015566 mycb coding upstream 586476 32016256 ~ 32018371 (+)
XLOC_015572 NA coding downstream 29053 32637080 ~ 32637505 (+)
XLOC_015573 NA coding downstream 36898 32644925 ~ 32647404 (+)
XLOC_015574 BX323559.3 coding downstream 93793 32701820 ~ 32719974 (+)
XLOC_015575 klhl18 coding downstream 135780 32743807 ~ 32756706 (+)
XLOC_015576 BX323559.5 coding downstream 150636 32758663 ~ 32760332 (+)
XLOC_015564 NA non-coding upstream 736092 31866499 ~ 31868755 (+)
XLOC_015583 NA non-coding downstream 246174 32854201 ~ 32862149 (+)

Expression


Co-expression Network