XLOC_015735 (cbln13)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015735
gene name cbln13
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 37874771 ~ 37878304 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031335
GACAAACAAATATCTGCTTCTCACACGAGAGTTTATGGGAGTGAGAACGTCAGAAACCTGTGTTATTTTTACTGAATGCAGTACGAAATGTGGAGTGGGTAGCGCTTTCGCATTAAAgtaagaagattgctggttcgagtcccaactagctttAAGGATCTTGACAAAGGTCTCGAGTGATAAACTTGAATCAGTGGAAGCAGaaagtaaagCCAAAAAGGTTGCCTTTTCAGCTGGACTTTTGCAATCCGGATCACAAGAATTTGGACCCTTTGAGACTCGAAAGACTctgatttacaaaaaaatctttGCTAATGCTGGAAATGCTTATGACTCCAGCACTGGTATTTTCACAGCACCAGTGAATGGGGTCTATTTCTTCAGATTTTATGCTCATGCTCATCCTACTAAACAAATGGCTGTCAGCCTCCATAAAAATAATCAGATACAATGTTCAGTGTTTTCTCGGCATCCTGCGAGCAATGCTAATGGCAGCAATGGTGTCGTTCTCTCACTGGACAAGGGCGATCAAGTGTTCACACAGCTGTGGGAGAATAACTGGGTGTATGATGATGATCTCAGCTACACCAGTTTCAGCGGCTTTCTGCTTTTCCAGTTGTAATTGTACACAGAATCCAAGATTTAATTagacaaaacaatatttatattactattctcattataatgatattttaatatttttaatgatatATTTACCTCAATGGACACCCAACATTTGCTATCTGTGGACGTTTGTTCACCAAGTTTGTTTTTTCAGATGTGATTATTTTTCCAATGCATAAAATTATATCCTTTtgtaataaaactttttaaacaaatacaaaattgtA
>TCONS_00031336
aaagcataaaaacagcacaaatgtgtgcagctttgaaaatgttgGCTACTCAAAATATGCTAATATTGGTGTGTGTCGGGGTCTCACTGGCACATGATTTAATTACACCAGAACAGTTAAAAAACATTGAGGCAAGACTAACAGCCACAGAGGAAACACTGAAAGAACTGAAGAGAGAGAATGAAGctttAAGGATCTTGACAAAGGTCTCGAGTGATAAACTTGAATCAGTGGAAGCAGaaagtaaagCCAAAAAGGTTGCCTTTTCAGCTGGACTTTTGCAATCCGGATCACAAGAATTTGGACCCTTTGAGACTCGAAAGACTctgatttacaaaaaaatctttGCTAATGCTGGAAATGCTTATGACTCCAGCACTGGTATTTTCACAGCACCAGTGAATGGGGTCTATTTCTTCAGATTTTATGCTCATGCTCATCCTACTAAACAAATGGCTGTCAGCCTCCATAAAAATAATCAGATACAATGTTCAGTGTTTTCTCGGCATCCTGCGAGCAATGCTAATGGCAGCAATGGTGTCGTTCTCTCACTGGACAAGGGCGATCAAGTGTTCACACAGCTGTGGGAGAATAACTGGGTGTATGATGATGATCTCAGCTACACCAGTTTCAGCGGCTTTCTGCTTTTCCAGTTGTAATTGTACACAGAATCCAAGATTTAATTagacaaaacaatatttatattactattctcattataatgatattttaatatttttaatgatatATTTACCTCAATGGACACCCAACATTTGCTATCTGTGGACGTTTGTTCACCAAGTTTGTTTTTTCAGATGTGATTATTTTTCCAATGCATAAAATTATATCCTTTtgtaataaaactttttaaacaaatacaaaattgtA
>TCONS_00031337
gcagctttgaaaatgttgGCTACTCAAAATATGCTAATATTGGTGTGTGTCGGGGTCTCACTGGCACATGATTTAATTACACCAGAACAGTTAAAAAACATTGAGGCAAGACTAACAGCCACAGAGGAAACACTGAAAGAACTGAAGAGAGAGAATGAAGctttAAGGATCTTGACAAAGGTCTCGAGTGATAAACTTGAATCAGTGGAAGCAGaaagtaaagCCAAAAAGGTTGCCTTTTCAGCTGGACTTTTGCAATCCGGATCACAAGAATTTGGACCCTTTGAGACTCGAAAGACTctgatttacaaaaaaatctttGCTAATGCTGGAAATGCTTATGACTCCAGCACTGGTAACCTGAGTCATTCATTTCTCTTTATGGCATTAACTGTTATGCCaaagtatgtttttaaataacacaaggttttttttatataattcttgAATTATATGTCTTGCAGGTATTTTCACAGCACCAGTGAATGGGGTCTATTTCTTCAGATTTTATGCTCATGCTCATCCTACTAAACAAATGGCTGTCAGCCTCCATAAAAATAATCAGATACAATGTTCAGTGTTTTCTCGGCATCCTGCGAGCAATGCTAATGGCAGCAATGGTGTCGTTCTCTCACTGGACAAGGGCGATCAAGTGTTCACACAGCTGTGGGAGAATAACTGGGTGTATGATGATGATCTCAGCTACACCAGTTTCAGCGGCTTTCTGCTTTTCCAGTTGTAATTGTACACAGAATCCAAGATTTAATTagacaaaacaatatttatattactattctcattataatgatattttaatatttttaatgatatATTTACCTCAATGGACACCCAACATTTGCTATCTGTGGACGTTTGTTCACCAAGTTTGTTTTTTCAGATGTGATTATTTTTCCAATGCATAAAATTATATCCTTTtgtaataaaactttttaaacaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-288 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000026904

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031335 False 851 processed_transcript 0.37 4 37874771 37878304
TCONS_00031336 False 888 mRNA 0.37 4 37875789 37878304
TCONS_00031337 True 959 mRNA 0.36 3 37875815 37878292

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015734 AL954692.1 coding upstream 27922 37836619 ~ 37846849 (+)
XLOC_015733 NA coding upstream 47732 37826734 ~ 37827039 (+)
XLOC_015732 sdr39u1 coding upstream 50344 37815687 ~ 37824427 (+)
XLOC_015731 ltb4r2b coding upstream 62586 37804235 ~ 37812185 (+)
XLOC_015730 ftr66 coding upstream 104440 37762924 ~ 37770331 (+)
XLOC_015736 tep1 coding downstream 18775 37897079 ~ 37906118 (+)
XLOC_015737 LO017954.1 coding downstream 48076 37926380 ~ 37927412 (+)
XLOC_015738 NA coding downstream 89681 37967985 ~ 37971044 (+)
XLOC_015739 apol1 coding downstream 93049 37971353 ~ 37974725 (+)
XLOC_015740 NA coding downstream 96692 37974996 ~ 37990505 (+)
XLOC_015725 NA non-coding upstream 567200 37301408 ~ 37307571 (+)
XLOC_015713 dre-mir-2198 non-coding upstream 1121013 36753649 ~ 36753758 (+)
XLOC_015712 NA non-coding upstream 1130859 36742343 ~ 36743912 (+)
XLOC_015741 NA non-coding downstream 121475 37999779 ~ 38000194 (+)
XLOC_015751 NA non-coding downstream 402678 38280982 ~ 38283096 (+)

Expression


Co-expression Network