XLOC_015757 (FQ377660.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015757
gene name FQ377660.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 38731696 ~ 38741768 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031362
TGACTTGTTATCAACAAGAAACTTTTACTCTTGgattaaacattttgttttttatagccTTTATCTGTAAACCCTAGGCATATTTGTGTGTAAAATTCCCAGATTGTATCATTTTTTTGATTGTACTTTATGTATTTTTAGCTTGTTGTTTTAGTGTGGCTTCTTTCATTGGTTTTGTCAATTGTGATCCTCTGAGTCACTACCCTGCTCCCGGGCTGAAACCACACCCTTATCCTTAATATTAGAATTCCGCATTGCCAGTGCCATAATCATACTTACTAGGAAATGAAACTCAAGTCAAATATGGCCACTGCCAGCACATCCACAGCCATGGAGGAAGCAGATCCAGACCTTAATTCAAGTGGACCTCAAGATGTAAACTGTTCGTCGTGCATTGGAAAAAAGCGCAAGGCTGAACAGTTCTGTCTGCAGTGTTCGGAGTCATACTGTGATTTTCATCTTGACTTGCATAACACTTTGCACGTTGGGAAGAGGCACAAACTAATGGAGCCATGTACAGCCCTGCTGGAGAACATCTGTGTTGATCATGGCAGGAGGCTGGAGGTGTATTGCCGAACAGACCAAAAGTGCATCTGTCACCTGTGCATTACTGATAAACACACAGGTCATCATGTCATCTCAGTGCAAGAGGAGGTGGCCAACAAACAGGGTAAGCTGTGGGAGTTGCAGAAGAAGGCCATTGACATAATTGAAGCAAAAGAGAAAGACGTGCAAGCGCTGAAACAAGCCATTGAGGTTTTCAGGGCTTCAGAAAATAAGGCACTGGTGAACAATGAGAAGAGCTTCACTGAGCTGATCCAATCTATGAAGGACAATCAAAACAAAGTGACAGCTCTGATCCAGGGTCAGGCAAAGTCTGCTGTGAAGCAAGCAGAGGGCTTCATACAGATCCTACAGCAAGAGATCAGCGTTATAAGGGCAAAAAATACTGATCTTATGGACCTGGAGCTGCTGTCTCAGTCAAACAATGATGTTCGCTTTCTTCAGAGTGCAGTGTTCATGCCTTTACTGACTGCGTATAAACAGTCATTCGTCTTCCATGTTCATCCATACAATTCTTTTGAGCGTGACTCCATGTTTGTTGATGAACTGGTTAAAAAGCTAAACACAACCAGCAAGCAGAGTTTACTCAGAGTTTCCAGAAAAGTGAAAAACACTAGAATTGTGGCATCACCACCGCCAAAGACAAGAGAAGAGTTTCTACAGTATGCAACAAAGCTCTCTTTCAATACCAACTCAGCGCATAAATATCTGCTCTTCAGAAATGACAACCAAGAGGTGATGGCCTCAAACCAGCTTCAGGACTATCCTGAACACACTCAGAGGTTTAACTGCAGGGCACAGATCCTGTGCAACGAAGCCCTGAGAGGGTCCTCAAAATACTGGGAGGTGGAGGTTGGAGGGGGTTCTTGGGTCTGCATTGCTGTGTCCTATCAAGGAATCCACAGAAAAGGCAAACCACGTACTCTTTTTGGGAGAAATGCCAACTCGTGGGGACTGCGCTGTTTCTGGTCCACCTATGAATTCTGGCATGACAATAAGACAACATTTACAAAGCACGAATCTCGTGCACCCAAAATAGGAGTGTATTTGAACTATAGGGCTGGGGTCTTGGCATTTTACAGTGTTTCCGGGGTCAACATGAGTCTCATTTATAAGCACAAAACTGTTTTTAAAGAGCCTGTGTATGCTGGGTTTGGACTGGCTGGGAAAGGTTCTTACGTGAGACTCTGCAATCCTGTGAAAACTGAGACAATAACGTCTCTTCCTTTTCCATTTAAGTTTGAATCTAAAACATCTCCCTTCTCTCCATTTAAATTTGGCAGtttgtaatgccgagttcagactgcatgattatagccccaattttgactcgctgacaggttttgagaaatcgcaaacaaatgcctgaaatcacaagcaaatCAGTGCTCGTGCACTTATCAATTACATAGTGTGAACTATtgaagacgcgatctgagagaataaCCGATGAGTCGCTAACACCCGCGAgttatttggcatgctaaatatctggacctgttgTGCGATTCAAAATCATCACGTGTAAAATGTGTTCTGATCAAACATAACATCGgcaattacctacagccaatgagagagcagcatcaaTGGGTATCTGCAGGAACAacaggaggctgggggagaagttaaaagtgatttattattttttatgtaattttttcagTCTAATTGGACCCAATAAATGTAGGGAAAAAAGGTTTGAGAGAAATTGCTCTTCAAAGGCCAGGTGAGCaaattaagtacattttctaccccactaaagtcgtctttctcattttgtagttaataacaaaagatatactacatgaccTTGCGTTCTTTCCATGTTACTTTTCGCATATGTTTgattgtgagacgtagtttggggACCGAGACAACGTTGTCGGCAATACTTAAAGTCATGCAGAGTGAAACCCTGTCGCCAattcatcttgcagtgtaaacacagcatcgAAAaaatgctaccccagatagtcatgcagcgTGAAAACATCTGacacatttactttaaaaatcgtgcagtctgaactcagcaaaAGTTGTGGTATTTACGTGTGCCACTGTCAACATATCTTATTCTGCATCACATACgctaaaaaaatgatgtctgcaaaactgttgcaaactatttatttgtattgaatttcaaaaaacaaattaattttagtaatgttcaacttaatagtttgtttaaattcagcccaaataattGGTGTATAACctcttaacgtaaaaaaaaaaaaaaaggaaatccaaggaatcatctttaaataattgttttcagtGTACCATACATTGGAGAgggattcatttattttatttttttgtatgtggACACTTGGTGGCAGCACTAGATAAGTTTTACACCTTTTTTATCAGCACATGTACATAGAAACCTAAGTTTAGTGAATATCTCAGAATGCTAGTCAAACTGGAAAAATCCAATGTTTTCTATTGAATTGATAGCTTCAAAATATTAGATGTATACCATTTAACATACTATCACAACATGCCTTATCTCTATTTTTAACATGTCCTGAATATTGCTAAAATGATTGCACATACTGTTCCCCAAACGCACTGTACATGTAAATCATTTGCCCATTTCACATCTGCTGATCTGAACCCAAATCTGTCATTCCATCTAATCCTCCAACCAAATCCACACACTCAGTCCTTTCCCAGTGATCATTGTCTGCTTTTTCTTGTTCCTCCTTTGTGCATTCGTCCATCCCTCCTGTCACTCTTCCCCCTCAGGCTCCACTCTTCCACTGTCCCAACAATTATAGTCTCGTTTTCTCCCTTAAACCACACAAatgcacatgctcacacacacatgcatcattTCATTGAGTAGATACTGAATATGCCGTGGCCTGGAGGCTTGGTCGAGGGGACAAAACCAAAGCCAGTCGCCTCCTGCCCTTCCCCCTGCTGCCCACCCGTccaaacagaacaaaaatcaGCCTTGGGGTAAGTGTAGGGCAGACACGGTTTCAACAGAGCAAGCAATGccacagcaaaaataaaaaataaataatgtgtgtAGAGGAAGGATAGAAACTAATAGAGAACATCATAGAGAAGGAGAGTGAGTGTGTGCGCCTCAGTCTTCAGGGAGCCTGCTTACAGTTCTGCCCAATCACAGACATCATTTGCAGCTTGTATTATCCTTTTATGAGTGACGGGGATTTCAAAATACTCTATTATGAAAAGAACCATTTCTCTCGCTGCCAAGGACATTGACACTACAGTCACACTGCTGCTATAAATACCCATTTTTTAAACTGAGTCACCATATAAACTAAAAACCGCTACACTCACAAACTCCTCCTCCAAGCTATTACCCAGCAGGCAGATGCTGAGGTCTGTCACTCTGCTAACAAGGTGCCTGTTAGAGTAAGTTGCTGTTGCACAGTTTTCTTTCTCGCATTGATGTATTTGCTATTGAAACAGGAGCTTTGGGTGGCATGAATTAAATGGCACctactttctcttttttttactaGCTCAATTGAATTTTGGTTGCTAGTCAGTTGTAGGTCTTGGGAGGGACTCGTTTCAGAGAGCGTTTGATTGGTTGGAAATTTAAATAGTGCAGGAGTCATCAATGTTTTTGGAGACTCTCCAAATCTGCTGCGAGTCAGTCAATATGTAAGAGTACACCAATGTGTTTACTAGCATCAGGGGTAACAAATGTGTATTAAAGCCCACAGAACTGTAAGGgtacattcttcagtatatctttgttttcattcatgcATTGCTGTTGAAACAGGATATTATGGTGGAATGTATTAAATTTcaccttttttcttattttttccctcatttaTTTTAGTAGCTCAATTGAATTTTGGTTGCTAGTCAGTTGTAGGTCTTGGGAGGGACTCGTTTCAGAGAGCGTTTGATTGGACAGAAGTTGTTTAGTGCAAGAGTCATCAATATTTTGAGAGAAACTCCAAATCTGCTGTAAGCTGGTCAATATGTAAGAGTACACTAGTGTGTTTACTAGCATCCAGTCTAACAAATGTATATTAAAGCCCACAAAACTTTTTGGctacattcttcagtatatctttgtTTCATTTCTCGCATTGATGTATTTGCTGTCGAAACAGAATATTTTGGTGCAATAGTATTAAATGGCACCCCCTATTTTTAATTATCTCAATTGAATTTTGGTTGCTAGTCAGTTGCAGGTCTTGGCAGAGCCTTGTTTTAGAGTGCGTTTGATTGAACAGAAATTTCTATAGTGCAAGAGTCATCAATATTTTTGGAAACACTCCAAATCTGCAGTGAGTGAGTCAATATAAGTACACCAATATGTTTACTAGCATCAGAGCTAACAAATGTGTAATAAATCCTACAAAACTCTCAATATATCTTTGTTTTCTTTCTCATATTGATGTTTTTTGCTGTTGAATATTTTGGTGGaatgtgttaaatttcaagttttttttcctcatttttattttttattttttaacttttttattagctcaattgaattttggttgccagtcaGTTGTAGGGTCAGGGAAGGACTCATTTCAGAAAGcgtttgattggacagaaatttCAGCTTAAGAGTCATCAATATTTTGCAGACACTCTAAATCTGCTTTGAGTGAGTCAATATGTAAGAGTACACCAGCATGTTTATTAGCAtctaataaatgtgtaataaagccCACAGAACTCTAAGGctacattcttcagtatatatttttctttctcaCATTGATGTATTTGCTGTTGAAACAGGATATTTTGGTGGAATGTATTAAATGCCACATTTTTTCCTTCTTTCAACTCTCTACTTTTAATTATCTCAATTTAATTTTGGTTGCTAGTCAGTTGTAGGTCTTGGCAGGAACTCATTTTAGAAAGCGCTTTAGTTGAATAGTGTATACTGCGAGAGTCATCAATATTTTTGGAGAAACTCCAAATGTGCTGTGACTGAGTCAATATGTAATAGTACACCAATATGTTTACTAGCCTCACGGCTTACAAATGTGTATTAAAGCCCACAAAACTAAGGctacattcttcagtatatctttgtTTTCTTTCAAACATTGATGTATCTGCTGTTGTATCTGCATTGATGTATCTGAATGTATTAAATGTCTCCTTTTACCTTCTTTTcccccatcttttttttttttttttaaattagctcAATTGAATTTTGGTTGTTTGTCAGTTGTAGGGTCAAGCTGGGGcgtttgattggacagaaatttTAGTGCAAGAGTCAATAATCAATAATTTTGGAGAAACTCCAAATCTGCTGTGAGCCAGTCAATATGTAAGAGTACACCATGTTTGCTAGCATCAGACCAAACAAACGTGTATTAAaccacaaacatacacaaactcaacagatctgtctatccgtctgtctaaaAATagttataatttgtaaaatttcAGCCTCTGTCTTGAAAGTGACAATATTCTTGAcaaaataaagtatattaaaagaatgtcgcctcacagcatgaatgttgctggttcaagtcccggctgggtcagttggcatttttatgtgaagtttgcatgttctcccgtgttcgcatgggttttctccgggagtTCTGCTTTTCTCtacagtccaaacgcatgcgctatataggtcaattaaaaaaaacttaattggctgtatgtgtgtgtggttg
>TCONS_00033618
GTATTAAAGCCCACAGAACTGTAAGGgtacattcttcagtatatctttgtTTTCTTTCAAACATTGATGTATCTGCTGTTGTATCTGCATTGATGTATCTGAATGTATTAAATGTCTCCTTTTACCTTCTTTTcccccatcttttttttttttttttaaattagctcAATTGAATTTTGGTTGTTTGTCAGTTGTAGGGTCAAGCTGGGGcgtttgattggacagaaatttTAGTGCAAGAGTCAATAATCAATAATTTTGGAGAAACTCCAAATCTGCTGTGAGCCAGTCAATATGTAAGAGTACACCATGTTTGCTAGCATCAGACCAAACAAACGTGTATTAAaccacaaacatacacaaactcaacagatctgtctatccgtctgtctaaaAATagttataatttgtaaaatttcAGCCTCTGTCTTGAAAGTGACAATATTCTTGAca

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000111637

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031362 False 6251 mRNA 0.39 6 38731696 38741768
TCONS_00033618 True 453 lncRNA 0.34 2 38739785 38741555

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015756 cdh24b coding upstream 22613 38554260 ~ 38709083 (+)
XLOC_015755 NA coding upstream 309463 38416017 ~ 38422233 (+)
XLOC_015754 psmb5 coding upstream 339121 38373272 ~ 38392575 (+)
XLOC_015753 NA coding upstream 359752 38370535 ~ 38371944 (+)
XLOC_015752 nedd8l coding upstream 441945 38288308 ~ 38289751 (+)
XLOC_015758 carmil3 coding downstream 570 38742338 ~ 38890677 (+)
XLOC_015759 si:ch211-119o8.4 coding downstream 150863 38892631 ~ 38909401 (+)
XLOC_015760 rem2 coding downstream 183207 38924975 ~ 38977298 (+)
XLOC_015761 rbp1.2 coding downstream 279514 39021282 ~ 39028052 (+)
XLOC_015762 AL953896.1 coding downstream 294414 39036182 ~ 39046184 (+)
XLOC_015751 NA non-coding upstream 448600 38280982 ~ 38283096 (+)
XLOC_015741 NA non-coding upstream 731502 37999779 ~ 38000194 (+)
XLOC_015740 NA non-coding upstream 741191 37974996 ~ 37990505 (+)
XLOC_015763 NA non-coding downstream 310119 39051887 ~ 39052229 (+)
XLOC_015764 CU179756.1 non-coding downstream 317867 39059635 ~ 39070308 (+)
XLOC_015767 NA non-coding downstream 1043979 39785747 ~ 39792446 (+)
XLOC_015768 CU929371.1 non-coding downstream 1315131 40056899 ~ 40057016 (+)

Expression


Co-expression Network