XLOC_015872


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015872
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 46943097 ~ 47099564 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00033672
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>TCONS_00033673
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>TCONS_00033675
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>TCONS_00033674
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>TCONS_00033677
TTCTAATTAGGCTGTAACCTTCAGCTGGTGTAATGTGTCGAGTCAGCACTTTTCAGGAGAAGCGTTTAATTGGTGAGTAAAAGTTatgttgctctctctctctcatcttcTTACTCTCTCACAGTATATACTACAGTCTGGCCTGATGGGAAAACGCTCactctgtataaacacacacatacacacacgcgcactAATCAGCGGATTAAAGAGACACGGGAAAGCGAATCATAATGCAGCAACAGAAAGAGAGCGAGTGTGACATTTCTGGGCTATCTGTGCTTTAATTAAATGTTTGAGACTTTCTAAGCACTTTAATTTTCACTTAACTGCATTTCTAATCATGAATCACTGCTTCACATTTAAACTGAACACATTTGATGCTGCTTGAAGGGAAAACTCAGAGGACAGACCACCCTGCGGGGAGAGAGCTGGGGTTTATTTGGCTCAACGCTGCAGCTTAACTTGTTCAGTAACAACAGTTGACATACCAAAAACAGCAGGTAAGCTATACTGTATAGAGTTTTACTGTAAAGTCAATGCACAAAACAAGCACTGTATTGCATGTATTAAACAGTCTTCCAGTAATGGTAATAAAACATGTCAAATATGATCTTAAAGGGACACTTCTCTAtcgcacatttctaaacaaaatagttttaataactaattttttaataactgatttattttgtatttgccatgatgacagtaaataatattttactagatatttttcaagacgctagtattcagcttagtgtcatttaaagggttaactaggttaattaggcacgTTATTCTATaatgttagtttgttttttaaatagtcggaaaaaaaattgcttaaatattgaacttaaaattatcattaaaaaataaaaactgcttttcttctaacTGAAATTAACAAATAAggctttccccagaagaaaaaactgttttaggaaatactgtgaaaaattcctggcTCTTTTACACATaatttagaaaatgtttaaaaaagaaaaaataataataatcataattaattttttcttcttctgttgaacacaaaagaagatatttggaagaatgttagACATACATGATCATAGAATTTTtggttttgggtgaaatatcctttTAAATAATGTTCTTGAAAAGTTGGcacaaacattatatatatatatatatatatatatatatatatatataattcatagaACTGAAATGCTTCAGTTCAATGTGTAACATTTGTAAAATTGATACTATGCAaaattataatttctaaaatggAATGTTCTCAAATGTTCAATTGACATTTGCATGAGCAATAAAACGTTTTTAGCCCATTAAAAAGCAGGACACTCTGAAACTATGTTGTTAAAACTTAATGGGAATGACAGTAACATGTCAGAACATATTTTGGTTGGCAGAAAAATAACTAGGCAACCCTTTCATGATTAAATgttagtacaaaaaaaaaatgagtttttatGCACATGGTCACTGTGTTGAGCCAAAACTAAGGTTGCCAatgtccaaatatatatataagtccctactcttctcaacaagCTAAAGCCGCTCCCCCGCTTCAGtcactaagttggcaacactgacagcaagcaaaaaatctgaattgtgagaTAAAAACTCACAATTACCTTTATATGCATGTGACAAAAACAGGCTttcatataaacataaatatatccCATATGCatctaaaatatcaataatacaCGTTTTATTTTTCCTAGTAATGTAGCCACTTTTTCCTAATGCCTCAAGCAGGGATTttcaaataaacagcaaaactTTCTGCGACACAAATATGTTTACATTCTCTGAGAGCTCTCGTGTATTTGAAATGCGTTTTGCTACATTCATAAGCTTGTGaataattgctttttttattcCATGATTTCATCTTTTTTATATAATTGCTATAGCAACACAAGTACCCTACATTTGTGATGCAAATACAGCCATTTTACAATCCCATCCTGCATTTTGATGAGAGGCAAAGGCAAAGAGATGGAGAATTTAGTGTAACTACTTAAAGTGAAGTAGGGGAGAATAATTGCAGGGTTTTAGTGCTGTGAGTAAAAGTAGAATTATGATGATACTGTTCCTTTCAGCTCTTTCTCTTACTCGGTTCTTTTCTCGGCAGATCCTGATAAATCATCGTTGGCGAATAAAAGACAGTTACTGGTGGTGCGGGTGAGTTTAGTTCAGTGCAGATCAAACAGCTGTGGGTCTATGTGAGGACTAACTCTTGACATCTCATTATCAGTAAAGCCGCCATCATCACATGTGCTTTTACAAACCCCCCTGCTCAAGATATCTGTTCCCTTTACATTCACCCTAACACTGGCTCAACTCGCTGTCAGAGGAATCAAACAGTCTTCATGCATATTCAATAGGAAAGACTGGATTCTGACCGCTAGCTTGATCTGACCTCTGACCTTCCCCTCTCGTattctgctttattattaaaaaataagaattataaatgatGAAAAAGGCAGAAAAGTTTTGGCTCTGGTTGAGATAGTTCAATCAAACTGTGATTAGTTTATTAGTGATAgtcatactttattattattatcaaggtACAGttctattaacaaaccattaacttatGATTTTAGTTTAATGAACTCatcatttgctgcttattaatagctaTTAAGTTGGGTTTAAGGATTGGGAAAGATTAGGGATACATTCATGCAcaatatgtactttataaattGAATAAACAGACATTATTTTAGTAATAGACGGGTAATAAGCCTTATTTGTAGAAATCTGTTCAAAACGAAGGTGTTACCAGCAttgttaaagaaaacaaaaatgtaaatgagtacAAAAAATGCTATGAAGCACATTAAATGAATGTTGGAAGGTCTGATGgcctattaaattaaaatatgcttcACTGAGCATAGATACAACATATGAATTACAGAACAATGTTTAAGTTTTTAACACCTAGAAAGTAAAATGAGAGCATTAATAT

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00033677 True 3010 lncRNA 0.33 1 47012013 47015022

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_015870 NA coding upstream 60898 46846863 ~ 46882199 (+)
XLOC_015869 NA coding upstream 100090 46830234 ~ 46843007 (+)
XLOC_015868 NA coding upstream 128682 46767563 ~ 46814415 (+)
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Expression


Co-expression Network