XLOC_016702 (si:ch211-122l24.6)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_016702
gene name si:ch211-122l24.6
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 40181633 ~ 40191603 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00032784
CACGTGGTTACATTCACGTGCACGAGCGGCGCTTAGCAAACTTATTTGAACTTGAAGCTGTTTCGAGAGGAGGCACATTACCTTAAGCCTTCATTTGCTGTGATTTTGCCTAATCAAACGAACAACGCAGTATTTTGACAAATTATCCACAAACAGTGGAAAATGGGGTCATTTCTTTCGATCCCAGTAACGCAAAAGCCTGAAATATATGAGCTTCCGAGTCAGGTGCAAAGAGACGATGATGAGATATTCCAAGAATTCAATGAGAACATTTGTAAAACCATGCGTCGCCAGAATTTGCGCTCCAGACAGGAACTGAACCTCTTGAATGcatatagACGTAACTGGAGTTCAGTGGTTGAAAAACTGATGAAAAAATACCCCAAGTGGTCTTCTGAAGACATCTTGAACCTTAGATATCGATATGAGATTGTGGCCAAACGTTATGGCTATCTTCTTCACTTCTGTAATTTCAATGAGCTGCTTGACTCCATTTCTGATGAGTCTTCTCCTGAGCAGCGCAGAGAGATGTTTAGCAGTGTAGACACCCATCACTTCTACGCACTCAACTTCAAGGAATATCTTCAGATAATGGATAAAATAGGCATTGAAACACCAGTACCTAGGCCTCCAGGAGTTGATGAAGACAGAGATGAGATTATGGTCTTAATTGATGATTTATTACAATGTCACATGAGTACCCAGATGGTCTATAAAGTATTCTAAATTTCAGGCTGATCCTTTCGGtaatgaagctcagctgcagttCTTTTAATCCTTAGTTTTGTTTACTCTCCCAACTGGGTTTAACTTTTAAGTAGCatacaaagatttgttttgtttttattgtatttaatttttttcagtattgCTGTTTAAGACAAATCTGTACTGCATCTCAAACTAAAtatattagaaaaaatatataattctgtgaaaaaaacaaaatggagatttattattaaagatgAATAGTCAGAATATATTTAATGCATGATAAAAATAATCAGTGATTAATTCAGTCAATTATATGCTTTGTTCAAAGCCACATTTATCTGTAAAAGCTTCATGGGCTGTTGGTGGTATTTGTTTGAATCACACTATTCGGTCCAGCAGTGGTGAGGCGTAAAGATGCCTTGTTCTCCAGTTTAGCAATTTTAGACCTATACAAAAAAAGGTATAAAATCAGGTCAGGCCTCATAAATAGAAAATCAATAAATGTTTCAGTTGGTCACACTATTCACCAGTCAGTGATGATAAATGTTACCTAGAATGTTTATGGTACATTTGCCACACAATTTAGGtcgtttgtttttaaaatgtcacaCACTTTGGCTGCTTACCTCAGATGTGCGAGTGCAGCTCTCACCCACTGATCCTCAATGCTCGCACATATCTTCTTATTTTTCTGGGTGATAAAACTGAAgagaaagataaaaataaatgtttttggagacagtagtttgttttattttcttctaAAAGTGGCTGAAAGTACGttttttttattaaggtcaaCTGCCTTTTAAAGTGACATCAAAAGTCTGAAACCAGTAAGTTTAGGTCGGTTTGAATATATTCCTTGACACACACTAGTATtcgaaaatatatttaaaaagtatgtgtgtgcgtgcgtgcgtgtgtgtgtgtataaaaatagAATACAAGTATTTAAAATAGAATTAAGTTAAGTGATACAGtagtacttttttttaaaacaatgaataaatattcaTAGCTCCACTAAttgtatcacactgtaaaaatgctcagTTTCACGCAATCTCtccatgttgtccaaacacaaaccaattaagtgaatttaatagtttttacaagtagtttacaacagtttttaaatggattaaacataaacaattaagtcctcgcaaaaaaataagaattgtctctttaaactacttatttaaaatgagcaaaaacaaGCAGCGAACGTCttttatgtatttaatgttttatatttatatgtaatattacaaaatacactTCTATTTAAAAGTAAAGGGGAgctatgatttatttattttatgtttttgaaaaagTGTCTTTTGTTCACTAACCAATATAaagcattttatatttatatgtcaTGTTAAATTGCTttaatcattcttttttttagatttctATGCAAATTGTTACATTAACACAACACTTGAAAATTGAAACATGAACATTCATTTGACTTCTTCTGTATTTTgcccattttattttaatgtcagtAGTTAGCTCAGCTTCTATCTGCATGAAAATGATGCTCTACGCATGATTTCAGAATGATACACTAGAAAAATTCTTGCTTCCTTaaattttttgttgaatcaaattaacttttttcaGTCATCGCAACTTACAGtaatcaaaatgacaaaaaaataattatatatatatatattatatatatataataaattatatactaTAAAAATTTTAAACCTGGTTAGCTTATTAAAGTAAGTTAAAGCAACACACTcacatttgttgtcttgactaATTGTCATAATTTTAACTGAGAGCCTCTAATttgtcctttttaaaaatatataatctacaaattatggatatttttacaactttaatgtttaaacaatagttgttttattttttattaaataatgtcaTCTATTTTTTATAGCATCACTTTACAGTGTACTCGGTGTTAATACCAcgggaacttttttttttgcatccgcTGTTCACCCTCATATTTAAATGCATGGTTAAATGTGCCTATTTTGGTACAAGTGTGGGTGAGTGGGTGAACCTTGATTCTTTCTTGCGGTCAGATAATGGTGACTCACATGATGGCATCTATACGGCACACCTCAAGGGAGCTCTGCTCAATGAAGCCTGCGATCACACCGAAGGGCAAAGGAGTCCGAGTGTATTTCACACAGCAGGCATAGTTCAGCGGCCCATCTGACATcaaacacaacattttttttaaagtcatataCTGATAGATCCATAAACTTAGTATGTTACTCTACTACAGTATATGTTCAAATATTAACAGAAAGGTAACAGCAATCACAATCACAACATATTTATATCTATTAGAAACTTACATGCTTTTGGAGTATGAGGAAGTAGGCTTAGAAAAACGATGCTGATGAGAGTGATTGAAACCAGAGACATTATGGAGCGTGTTTCAGATACACAGAGATGCGTGTTGAGGCTGTGCAGGGTCTTATATATGTACTAGTGAGCGATAAGATCAGTTGCACACGTTCAATAGAATGTCAAATCAGATGCAGTTTTCAAAATGAGGACAGCAACCACGGGAAAAACAGAGGACAGGAAAGCCAATATTGACGATGTTACAAGACTCCAACCACAAATGTGGTGCAGAGTTATAAAAGACTTCTTTCTTAGTATCTCGAGCAAATACACACATCCCATATAAGATGTTACGCtagttttagtatttatttttgtttacattttgtgcCATGTCTGACTGATTGATGTTGTAATTGATGTAactgaataatgaaaaataattactgaaaaaaaaaaaacttgaaattcTGTTTAATTCTGTTTTCCTGAGAcccctttttc

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-34 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112759

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00032784 True 3582 mRNA 0.33 5 40181633 40191603

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_016701 epha4a coding downstream 45609 40067808 ~ 40136024 (-)
XLOC_016700 NA coding downstream 148575 39830685 ~ 40033058 (-)
XLOC_016699 NA coding downstream 354122 39826704 ~ 39827511 (-)
XLOC_016698 slc25a36a coding downstream 422574 39731284 ~ 39759059 (-)
XLOC_016696 spsb4a coding downstream 505804 39584066 ~ 39675829 (-)
XLOC_016703 NA coding upstream 2464 40194067 ~ 40196570 (-)
XLOC_016704 NA coding upstream 7214 40198817 ~ 40199780 (-)
XLOC_016705 NA coding upstream 14305 40205908 ~ 40211792 (-)
XLOC_016706 NA coding upstream 342360 40533963 ~ 40534863 (-)
XLOC_016707 CR931819.2 coding upstream 353343 40544946 ~ 40545061 (-)
XLOC_016697 NA non-coding downstream 569169 39610321 ~ 39612464 (-)
XLOC_016694 BX248328.1 non-coding downstream 810706 39370811 ~ 39370927 (-)
XLOC_016681 NA non-coding downstream 1987154 38192959 ~ 38194479 (-)

Expression


Co-expression Network