XLOC_017908 (CR848049.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017908
gene name CR848049.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 7646762 ~ 7648325 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00035334
atctatctgtctgtctgtctgtctgtatatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtcaatcaatcaatcagtcagtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtttgtctgtacatctgtctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtctatccatctatccatctatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtttgtctgtacatctgtctatctatctatatgtctgtctgtctgtctgtctgcctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatttatctatctatctatctatcatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtacatcTGTCTAcctatctatatgtctgtctgtctgtctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatttatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatcaatctatctatctatctctgtctgtctgtctgtttgtctgtacatctgtctatctatctatatgtctgtctgtctgtctgtctatccgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctttctgtctgtctgtctgtttgtctgaacatctgtctatctatctatatgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctatctatctatctatctatctatctatctatctatctgtctggctgtctgtctgtctgtctttctgtctgtacatctgtctttctatctatatgtctgtctgtctgtctatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatccatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatctatccatccatct

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000112460

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00035334 True 1564 mRNA 0.34 1 7646762 7648325

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017907 NA coding downstream 8110 7612155 ~ 7638652 (-)
XLOC_017906 usp24 coding downstream 63276 7443224 ~ 7583486 (-)
XLOC_017905 dsc2l coding downstream 352925 7262434 ~ 7293837 (-)
XLOC_017904 NA coding downstream 435566 7191883 ~ 7211196 (-)
XLOC_017903 dhcr24 coding downstream 469952 7149100 ~ 7176810 (-)
XLOC_017909 NA coding upstream 303457 7951782 ~ 7953182 (-)
XLOC_017910 plpp3 coding upstream 316031 7964356 ~ 8024582 (-)
XLOC_017911 si:ch211-232i5.3 coding upstream 433384 8081709 ~ 8094718 (-)
XLOC_017912 si:ch211-232i5.1 coding upstream 452745 8101070 ~ 8110672 (-)
XLOC_017913 NA coding upstream 474368 8122693 ~ 8443425 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc upstream 2405080 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_017902 NA non-coding downstream 507620 7138063 ~ 7139142 (-)
XLOC_017896 CT583652.1 non-coding downstream 1063092 6581799 ~ 6583670 (-)
XLOC_017894 NA non-coding downstream 1166249 6478510 ~ 6480513 (-)
XLOC_017914 CR388209.2 non-coding upstream 1146177 8794502 ~ 8835094 (-)
XLOC_017915 CR388209.1 non-coding upstream 1288578 8936903 ~ 8937004 (-)
XLOC_017925 AL645822.1 non-coding upstream 2257943 9906268 ~ 9906384 (-)

Expression


Co-expression Network