XLOC_017965 (zpax2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017965
gene name zpax2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 14096858 ~ 14114151 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00035416
ATGAGGTGCTTTGAAACAGGGTATGTGTGGGGATGTTTAAATATTAAGGTTTGGACCACGAGgtgttttgattattatttttttcatgtttgtagAGCTTTATGGCTTATGACCACACTAATAAGTACGTTTGCGGATACCTTTGAAGAAATTCAAGCTGAATGTCTTGGAAACCGGGTGCAGTTTACCCTCCCTGGTTCTTTGAGTCTTCTTGAGGTTTATGCAGTCAATAACACCCAGACAGTCCTTCTCACACCTTTCCTGGCGGCTCAGTGTGGATACACACAGAAATCTGATCCCTGGGGCAATATGATAGTGTCAGCTTCCCTACAGAGCTGTTTTGCAGAGAAACAGGGTGACAAGGAAATTAAAGTAGCTATGAAGTTTAAACTGTACAAACTCTCTACGCTGTCTGAGAAAGTCCATGAAGTGTCCAAGTCCTGCAGTTACACCATGGCATCACGTGAGATTCTGTGTGATACCAACTTCATGGAGGTATCCATAAGGAACGCAATACCAGATGTGAAGGCTGCACCAGTAAAACAGTGGTCCATAGATATGCCTAACTTGAAACTCTGGAGGATTATTCTGTTCACCCCTGAAGAGAGGGCTTTTGATAAAGAGACTATCGAACAGAAGGGCTACAGTCTTTACAGTTCTCCAACGCGACTGGTAATGCGAAGTCCTTACAACATGGCGGAAACCTATGCCCGACATATTGAAGAGATTGATATGATGGTGTTCAAATCAGTGGTCTTGTTCCGAGAACGCTGGATGATGACTATAGTGGAGTCTGCAGCCGTTTGTCCAACAAGTGGAGCTTCTGTTGAGGGGGACACTATTTTTTGGCGCCTTCCTCTGCGCATAACTCCATTGGTGTCCTCTGAATTTGAAATCCTGGAGGTGCATATGGGTGTTAATGGCAGAAGGCTAACACCCAATGAAATGGCCAGCCACAGCTATAACATGAGATTAACAGAATCCCATGTAGTTGTTGGGATTCCCATCGGGGCACCTGATGGATATTTCAAGAGCCATACTCTTAAGGATCAGTATCATATCAGTTACACCATAGAGCCCATGCTTGAGTTACTGTGGCGGGAGGGAGTCGACAAGACCAAATATACAGTCTTGTTCCCCATGACCACTCCTTTGACACCATGGCCACCTCAAATCGCAGACAAAACTGAACCCGATCAGAAGATGTTTGATGTGTTTTTGGGGTACTTCCTACCTGATGTGGAGCTGCTGAGTGTCACCATTGGCTCTGAATTGATCACTGTTCCGGAGCTCATTTTTAAAGGAATTGTGCTACAAGAGCACAGCTTCCCCAATGATACAAAGGCCTTTTCTCTTCAGATTCCCTTCTCTGAACCACATGTCCAAATAAAGAAAGTTCACCTTGATAAAACAACCTACACTCTTCCTGTTGTCTTTGGATTCACTGTCTTGCCTGATCATTCATCATTTTCACACTCGGCAGAACTAGAAACGTCTGTAACTGACACTGTACTTCCAAAAGCAGAGGGAAGCTGTCATCAGGACCATTTTGACATGCATGTTGCTTTTGGAAGTGTTCCTAGTTCAGAGTTAAAGATCAAACTGGGACAAACAGAGCTGAATGATGAAATTTTGCAGCAGTTTGAACACCATTTAAACAAAACCCATCTGACAATAGTTGTGCCGTTCCTGTCCCCGGTTGTGGCTCTTGAGTCAGTTCAGTTGACTGGAATTGAAGGAAGAATTGATGTGAAAATGTACAATTCCATGAATAACTGGAAATTTAATGATGTCTCCCTTACATGCACCTTTTTGGTAAAATTATCAGAGTGTTTTCCTAATGGAACGGTTACTGTGGTGCTTCCCAAACTGGAATCGGTGCAGTATCTTCCCGGTGAACTTTCTTTAAGGGACCCCACTTGCAAACCCTACTACAATGAAGACCACTTTGCTTATTTTCGCTATAATGTCACCAGTTGTGGAACCACACGAAAGTTTGTTGAGGACACCATGATATACGAGAATGAAATCACCTCGAAGACTGATCCTTTGCCTCAGACTTCTGAATTGGAACCTGAGCCAGAATACAGGTTCATAGTGTCCTGTGTTTATGTTGCTAATGCTACGGAGAGTATGATCTTCCATGCTGTTTCACACTTTAAAGAGCCTCATGCGGATGTGGGGAAGGGTGAACTATCTGTTAGCCTCAAGCTCTCTCAAGATATGGTCTACAAACTTTTCTATCATGAGGGCGATTACCCACTTTTAAAGTTTCTGAAGCAGCCTCTATATTTCGAGGTGGGTATGGATCACTCCAGGGACTCCAAGATGGCAGTAGGCCTGGAAAACTGTTGGGCAACACTCACCAAGGACAAAGAGTCCAAACCTCGATGGGATTTAATAGTAGATGGATGTCCTAAAGGACCAGAGCAGACCAAGATCCGACCTGTAATTGCGGATGATCGAATAGACATCCCAGATCACTTCAAAAGGTTTGAGGTTAAAATGCTGGATTTTACAGAGAAGGATAGGAGCTCTACAAATGATGCTGCCAACACGATGAGACGGGTGTTTATCCATTGTGACGTTCTCATTTGTCATACTGAAAACACTGCTGATGGACGCTGTTACAAACAATGTATGAGTCCTCTCAATCCACAGATCAGCTCAAGTCGAGTTCGCAGAAGTTCACGCCTTTCAGAGGAAGACCTGCGGCATGTTTCTTTAGGCCCAATTCTGTTGATATGAGCGTGTGTCAGTTTTCCAGAAACATGCTTCAGGCTCATTTTGAAGctgaaacaaattatttttaaccacCACTTGATGCGAAATGAGACTCTTGTTGTCATGAAAATGAGATTTTGGACCTTTTCCAACAAGTTCTGTGATCAATCATCTACTTTTACACACACAATAAAAGCCTGTCACACTGGCGTTGCAATTAATGTAGATGTTTTGGTTGTCCACAAGATGGCGTTTCGAGATAATAAATCTTTTTAACCCAGGTTTTTGTGGATTCACGTAATTAATGACTCCGTGTTTGTCATCATGGGTGGTGTGCTGGAGCACTTATGTCTTTAAATTTATAAAGACTAATTAATCTTTTCATTGGTGGGAAAATGGTAAAATACTAAGCATATAGCATATAAAATCTTAAGAATGTAGgctattaaaatgtacaaatgtgatGATTAAAGATGGTTTAAGGCTGACCAAGcaatcaaattttttttcttctgtactACCAGTCTATGATGCCTTTtgttattaacattaaaaaataaataaataaagaattgtCGAACGCAAGTATAAACTATTGCTAACTTTTGTGGGAGAAAtgtcatttatacaaaatatgataattcAGCATAACCAGTATATTTCTAAGGAATtggaaaaaattatttattctttatgctaagaaattaaaaaaaaaactagtagtTTGAAGGGCATTGACCAAATGTAAAGTTTACAACTATAATTGTTGtgtatttgatttaataaatgttgactttttaatgtgttaaattgTGTTTCATTATCATGGATGTATGATTACTTGttgaatgagatttttttttcctttatttttaatgtctgcTAAAACTGTTTAGGCTCAAAGAGggcaaatattttaaactttttaaatgtatttcattgTCCAAACATCAGCAAATGACAACTGTTCCAGCAAAGCTACactgttaaataaaatttaaaaaaagattttgtacagttttatgattaaaaaaactgcatttgttGTGGCCTAACAATAAAGTTAAAAATACAACAgcaatgtaatataaataaatttttttttttttttttttttttgctttagtagtacatttctcagatcagaattgaaaatttcaaaacagtaaatatatttctcaaaacaatgcatacaaatagcaaaacaccatggattaccatcaaaaaataaaaaattctctcaAAACGCAGTTTCTATGTCAAAGAATGTGTCCGAATGACAAGTCCTGCTGTCAGTGTTAGGATAAGACAGGCAAATTATTTGGTCATGTTGTCAATATAACAGTGTTCTCTGTAGGGCTGgtttgatgttttttgttttgctgtttgtactTTAATTTGCTGCCAGATCTTGTCATTGTAATACAAAAAGGAAAGGACAGtataaagaacaaacaaacaaaacaaaagtagaaatgtgaacacgGGAC
>TCONS_00035417
TCTCTCATCCCTCTCGCGTTTGTGTAGAAAACATAACTTTGACGGTTTATATACACTTTAAAAGAATCCAAGAATGAGGTGCTTTGAAACAGGAGCTTTATGGCTTATGACCACACTAATAAGTACGTTTGCGGATACCTTTGAAGAAATTCAAGCTGAATGTCTTGGAAACCGGGTGCAGTTTACCCTCCCTGGTTCTTTGAGTCTTCTTGAGGTTTATGCAGTCAATAACACCCAGACAGTCCTTCTCACACCTTTCCTGGCGGCTCAGTGTGGATACACACAGAAATCTGATCCCTGGGGCAATATGATAGTGTCAGCTTCCCTACAGAGCTGTTTTGCAGAGAAACAGGGTGACAAGGAAATTAAAGTAGCTATGAAGTTTAAACTGTACAAACTCTCTACGCTGTCTGAGAAAGTCCATGAAGTGTCCAAGTCCTGCAGTTACACCATGGCATCACGTGAGATTCTGTGTGATACCAACTTCATGGAGGTATCCATAAGGAACGCAATACCAGATGTGAAGGCTGCACCAGTAAAACAGTGGTCCATAGATATGCCTAACTTGAAACTCTGGAGGATTATTCTGTTCACCCCTGAAGAGAGGGCTTTTGATAAAGAGACTATCGAACAGAAGGGCTACAGTCTTTACAGTTCTCCAACGCGACTGGTAATGCGAAGTCCTTACAACATGGCGGAAACCTATGCCCGACATATTGAAGAGATTGATATGATGGTGTTCAAATCAGTGGTCTTGTTCCGAGAACGCTGGATGATGACTATAGTGGAGTCTGCAGCCGTTTGTCCAACAAGTGGAGCTTCTGTTGAGGGGGACACTATTTTTTGGCGCCTTCCTCTGCGCATAACTCCATTGGTGTCCTCTGAATTTGAAATCCTGGAGGTGCATATGGGTGTTAATGGCAGAAGGCTAACACCCAATGAAATGGCCAGCCACAGCTATAACATGAGATTAACAGAATCCCATGTAGTTGTTGGGATTCCCATCGGGGCACCTGATGGATATTTCAAGAGCCATACTCTTAAGGATCAGTATCATATCAGTTACACCATAGAGCCCATGCTTGAGTTACTGTGGCGGGAGGGAGTCGACAAGACCAAATATACAGTCTTGTTCCCCATGACCACTCCTTTGACACCATGGCCACCTCAAATCGCAGACAAAACTGAACCCGATCAGAAGATGTTTGATGTGTTTTTGGGGTACTTCCTACCTGATGTGGAGCTGCTGAGTGTCACCATTGGCTCTGAATTGATCACTGTTCCGGAGCTCATTTTTAAAGGAATTGTGCTACAAGAGCACAGCTTCCCCAATGATACAAAGGCCTTTTCTCTTCAGATTCCCTTCTCTGAACCACATGTCCAAATAAAGAAAGTTCACCTTGATAAAACAACCTACACTCTTCCTGTTGTCTTTGGATTCACTGTCTTGCCTGATCATTCATCATTTTCACACTCGGCAGAACTAGAAACGTCTGTAACTGACACTGTACTTCCAAAAGCAGAGGGAAGCTGTCATCAGGACCATTTTGACATGCATGTTGCTTTTGGAAGTGTTCCTAGTTCAGAGTTAAAGATCAAACTGGGACAAACAGAGCTGAATGATGAAATTTTGCAGCAGTTTGAACACCATTTAAACAAAACCCATCTGACAATAGTTGTGCCGTTCCTGTCCCCGGTTGTGGCTCTTGAGTCAGTTCAGTTGACTGGAATTGAAGGAAGAATTGATGTGAAAATGTACAATTCCATGAATAACTGGAAATTTAATGATGTCTCCCTTACATGCACCTTTTTGGTAAAATTATCAGAGTGTTTTCCTAATGGAACGGTTACTGTGGTGCTTCCCAAACTGGAATCGGTGCAGTATCTTCCCGGTGAACTTTCTTTAAGGGACCCCACTTGCAAACCCTACTACAATGAAGACCACTTTGCTTATTTTCGCTATAATGTCACCAGTTGTGGAACCACACGAAAGTTTGTTGAGGACACCATGATATACGAGAATGAAATCACCTCGAAGACTGATCCTTTGCCTCAGACTTCTGAATTGGAACCTGAGCCAGAATACAGGTTCATAGTGTCCTGTGTTTATGTTGCTAATGCTACGGAGAGTATGATCTTCCATGCTGTTTCACACTTTAAAGAGCCTCATGCGGATGTGGGGAAGGGTGAACTATCTGTTAGCCTCAAGCTCTCTCAAGATATGGTCTACAAACTTTTCTATCATGAGGGCGATTACCCACTTTTAAAGTTTCTGAAGCAGCCTCTATATTTCGAGGTGGGTATGGATCACTCCAGGGACTCCAAGATGGCAGTAGGCCTGGAAAACTGTTGGGCAACACTCACCAAGGACAAAGAGTCCAAACCTCGATGGGATTTAATAGTAGATGGATGTCCTAAAGGACCAGAGCAGACCAAGATCCGACCTGTAATTGCGGATGATCGAATAGACATCCCAGATCACTTCAAAAGGTTTGAGGTTAAAATGCTGGATTTTACAGAGAAGGATAGGAGCTCTACAAATGATGCTGCCAACACGATGAGACGGGTGTTTATCCATTGTGACGTTCTCATTTGTCATACTGAAAACACTGCTGATGGACGCTGTTACAAACAATGTATGAGTCCTCTCAATCCACAGATCAGCTCAAGTCGAGTTCGCAGAAGTTCACGCCTTTCAGAGGAAGACCTGCGGCATGTTTCTTTAGGCCCAATTCTGTTGATATGAGCGTGTGTCAGTTTTCCAGAAACATGCTTCAGGCTCATTTTGAAGctgaaacaaattatttttaaccacCACTTGATGCGAAATGAGACTCTTGTTGTCATGAAAATGAGATTTTGGACCTTTTCCAACAAGTTCTGTGATCAATCATCTACTTTTACACACACAATAAAAGCCTGTCACACTGGCGTTGCAATTAATGTAGATGTTTTGGTTGTCCACAAGATGGCGTTTCGAGATAATAAATCTTTTTAACC

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040724-123 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000017188

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00035416 False 4214 mRNA 0.39 20 14096858 14114078
TCONS_00035417 True 3000 mRNA 0.43 21 14098070 14114151

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017964 rhag coding downstream 42775 14014813 ~ 14054083 (-)
XLOC_017963 si:ch211-22i13.2 coding downstream 83999 14003060 ~ 14012859 (-)
XLOC_017962 NA coding downstream 95857 13998311 ~ 14001001 (-)
XLOC_017961 BX469908.1 coding downstream 200186 13894918 ~ 13896672 (-)
XLOC_017960 BX248403.1 coding downstream 278348 13818395 ~ 13818510 (-)
XLOC_017966 dlgap2b coding upstream 30138 14144289 ~ 14259032 (-)
XLOC_017967 dlgap2b coding upstream 144394 14258545 ~ 14321359 (-)
XLOC_017968 BX465225.1 coding upstream 340757 14454908 ~ 14455626 (-)
XLOC_017969 C20H12orf57 coding upstream 344779 14458930 ~ 14463012 (-)
XLOC_017970 scrn2 coding upstream 518341 14632492 ~ 14680917 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc downstream 4043157 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_017955 BX470123.1 non-coding downstream 727515 13369227 ~ 13369343 (-)
XLOC_017953 NA non-coding downstream 783848 13309282 ~ 13313010 (-)
XLOC_017973 BX470128.1 non-coding upstream 758879 14873030 ~ 14873330 (-)
XLOC_017980 NA non-coding upstream 1517087 15631238 ~ 15634114 (-)
XLOC_017981 BX842702.1 non-coding upstream 1611508 15725659 ~ 15726265 (-)
XLOC_017987 BX890559.2 non-coding upstream 2242116 16356267 ~ 16357360 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000051_05955881_05966250 NA coding CI01000051 null 5955417 ~ 5966425 (+)