LOC110520098 (LOC106573710)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110520098
gene name LOC106573710
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 27205911 ~ 27215251 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_021597149.2
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>XM_021597157.2
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Function

NR:

description
interleukin-34-like

GO:

id name namespace
GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation biological_process
GO:0001934 positive regulation of protein phosphorylation biological_process
GO:0005615 extracellular space cellular_component
GO:0005157 macrophage colony-stimulating factor receptor binding molecular_function

KEGG:

id description
K22633 IL34; interleukin 34

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_021597149.2 False 3449 mRNA 0.43 7 27205911 27215251
XM_021597157.2 True 4550 mRNA 0.42 6 27205911 27215251

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118966748 NA coding downstream 62498 27143360 ~ 27143413 (-)
LOC110520062 NA coding downstream 266587 26926298 ~ 26939324 (-)
LOC110520038 LOC106573702 coding downstream 704420 25895216 ~ 26501491 (-)
LOC118966628 NA coding downstream 1458692 25732955 ~ 25747219 (-)
LOC110520015 LOC106573699 coding downstream 1493473 25679909 ~ 25712438 (-)
LOC110532124 LOC104966864 coding upstream 10912 27226163 ~ 27299859 (-)
LOC110532131 aars coding upstream 101421 27316672 ~ 27321126 (-)
LOC110520123 LOC106573712 coding upstream 117297 27332548 ~ 27342006 (-)
LOC110520135 ar2bp coding upstream 158011 27373262 ~ 27375453 (-)
LOC110520144 rspry1 coding upstream 160589 27375840 ~ 27392581 (-)
G27481 NA non-coding downstream 68581 27137100 ~ 27137330 (-)
G27476 LOC106573708 non-coding downstream 70890 27132927 ~ 27135021 (-)
G27478 NA non-coding downstream 73982 27131682 ~ 27131929 (-)
G27462 NA non-coding downstream 84992 27120706 ~ 27120919 (-)
G27414 NA non-coding downstream 125849 27079861 ~ 27080062 (-)
G27969 NA non-coding upstream 8236 27223487 ~ 27232530 (-)
G28024 NA non-coding upstream 136054 27351305 ~ 27351655 (-)
G28033 NA non-coding upstream 188603 27403854 ~ 27404723 (-)
LOC110520201 NA non-coding upstream 270260 27485485 ~ 27486881 (-)
G25117 zfpm1 other downstream 1923893 25281604 ~ 25282018 (-)
G25115 zfpm1 other downstream 1924881 25280592 ~ 25281030 (-)
LOC110518671 klhl36 other downstream 2254524 24944908 ~ 24972465 (-)
LOC118956210 NA other downstream 2267210 24910984 ~ 24938701 (-)
znf276 znf276 other downstream 2341077 24853824 ~ 24865158 (-)
LOC110520292 gnao1 other upstream 420837 27631001 ~ 27781768 (-)
G28870 NA other upstream 842192 28057443 ~ 28066305 (-)
G29355 NA other upstream 1488636 28703887 ~ 28704356 (-)
G29906 mef2a other upstream 2065025 29280276 ~ 29280700 (-)
LOC110520932 LOC106573529 other upstream 3916642 31131151 ~ 31132900 (-)

Expression


Co-expression Network