LOC110532813 (LOC106613040)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110532813
gene name LOC106613040
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 84291760 ~ 84331700 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036989962.1
tatatctctccctctctctctctctcccagcgaCATGTTTTTTACCCTTCTCTCTAAGTTCTTTCTCTCCACACAACGGACAACAGACTCTCTCTCATTCGTCTGCAGCCTGTAGTAACCCTCCTAGCTAGATGTCGTTCCTCCATCTCTTCAACCGAAAGATGGAACCTGCAGCAAGTAGATGAACCAGCCGGTTCAGCCAACagcccagagggagagagaatccaGTGCTTGTTTGCGTCGGTGtgctgtatatgtgtatatgtgtgtgtgtctgctgagagaagagaggactgcCTTCCAGTGTATGTGTGTCGAAGTGACAATGTTTCTTTGCTTGAGCGGGAGAGTGAGTGTGCGAGTTTCTTGCTCTGAATAGTAGGAGAACGGCAGCTCACTagtgtgtgttcatgtgaatGGATGCATGAGCGGATGCGAAGGAGAGTGTGTTtttccacagtgtgtgtgtgtgtgtcctcctctcTGAGTAGTAGTCGGAGGGCAACTCTCTCCCCCTGGcgggtgtgtgtgtagatggcagtgtgtgtgtgttttgccctGTCCTCCCTTCTCCTGCTCCTGAGCTGTGGTGTAGCGGGAGGATACCCCTTCAGAGCCCCCATAGACCTGGATGTCACCCCCAGGATCACTATGACTACCAGcgGTCTGTTGGGCTGCAGGCGTTTCCAGTCCTCAGTAGTGAACTACAGTACTCTGCTACTAGAGGAGGACATGGGTCTTCTCTACGTGGGGGCCCGAGGGGCCGTGTTCGCTCTCAACGCCACAGACATCTCAGACAACACAGCTCGcactATTGAATGGGAAGCCTCTGAGGAGCAGAAGCAGCAGTGTCTGAGCAAAGGGAAAGACGATAAgACAGAGTGTTATAACCAcatcaggtttctccagagatttAATTCCACTCATCTCTACATGTGTGGGACTCACGCCTTCAAACCTCTTTGTGCGTACATAGATGAGGAGAGTTTTAAAGTGTCGTCTGAGTttgaggagggtagagagaagtgTCCGTATGGACCTGCAACAGGCTACACTGGCCTCATCGTGGACCAGCAGATGTACACGGCGTCTCAGTATGAGTTCCAGTGCTCTCCGGACATCCGACGTAACGACCCCTATCCCATGGTGAGGACAGAGGAGGCACCCACTCGCTGGTTTCATGAGGCTGACTTTGTGGGCAGTGCCCtggtgagggagagtgagggcaGTACTACCGGAGATGACGATAAAATCTACTACTTCTTTACCGAGAAGAGCCAGGAGCAGACCCCATACTACAGCCACATTAGAGTGGCACGTGTTGGACGAGTCTGtaagGGAGATAGAGGAGGTCTGTTGACCCTCCAGAAGAGGTGGACATCATTCCTAAAGGCCACACTGGTGTGTTCGCTGCCAGAATACAACTTACACTTCAACGTGTTGAGGAGTATTTACACGCTGCCGGGACACACACCTCACGACACACTCTTCTACGGTGTCTTCAGTCCCGAGTGgAAGAACGTGAAGATATCAGCAGTGTGCcggttctctctgtctgaggtcCAAAGGGTCTTTGACGGGCCCTACATGGAGAATCAGGACTCTGGAGCCGAGGGGAGCGAGTACACTGGAAAGGTCCCTGACCCACGACCTGGATCATGTATTACAGACCAGTTGAGATCCAGAGGTATAAACTCCTCCACCTCCCTGCCAGACGACATGCTGAACTTTGTGAGGAGACACCCTCTGATGTCCCAGCAGGTCATGTCTACAGAGCAGCGCCCCCTTTTGTTCAGGAGGACAACAGACTACACCCAGCTGGTGGCTCACAGGGTGGAGGGGCTGGACGGGCAGAACTACCATTTACTCTTCATGGGCACAGACGATGGCTGGCTGCACAGAGctgtagaggtcaggggtcatctACACATTATAGAGGAGCTACAGCTGTTTGACCAACCACAGCGTGTGGATAGCCTGGTTATTtcacatacacagaTGAGTGTGTATGTAGGTTCTCCTTCTGGTGTGGTCCAGCTTCCCCTCTCCACCTGCAATAGGTACAATTCTTGTTACGACTGTATCTTCTCCCGGGACCCTTACTGTGGCTGGGATGGACAGGACTGTTTGGATATCACAGCACAGACTGACAGgtctAACCTGACCCAGGACGTCCTGTATGGGAACAGAGGATGTGATAACgAGCTGGTCCAGCACCGGAGCCGGTCTATAATGGTGGGAGATGACGTGCTGCTCCAGTGTGAAATTAGCTCCAATCTGGCAACCCCAGTGTGGACTCTGGACGGGTCAGAGCTGCAGGGCTATGGCCTGGAGTCTGGCTTCAGGGTGGGCACCGACGGCCTCCTGGTCATCGAGTCCCAACCGGAGCAGAGCGGCGAGTACACCTGCCACGCCCTCGAGAACGGTGTCCGAGTTGCTGTGGTTAAGTACTCTGTGACGGTACGTCTAGATatgccacacacccctcccccaccCGTCGACCAATCCCAAGACCATCCCTactaccctcctcctccacccctcaccCCGCTCTTCCACCCTTCGCCCCCCTCCTCTGAGAGACCCCTGCCACCCTCTGCCCCGGcccctctcccccccacctcaGAGCTGCCACCCTCTGCCCCAGCCCCTCCCCCCCCCACCTCGGAGCTGCTCTCCCCCAGGAGCATGGAGGCTATGTACCTGTCCTTGATCACCATCCTAGGAGGTCTGTGTCTGGTTCTCACCGTGGTCCTCCTCTACCTTGGCTTCTGTCTGCGGGGCAGCCACAGGGGGAAGTACTCTCTCCGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCTGCCAATCACACGGACAGGAAGAGGAAACACAGGAAGCAGCAGCAGAAACGCCACAGTAGCTCCGCCCACCTGGATCTCAAGACCATCTCCAGCCACTGTAATGGGAAAGGGATCTGTAATGGTAACGGCGTCTCCCAACAACCGGGGAACGGTGACACGCACAAAGGGGGCTTCCTCCAGATCGTCCCGAGAGAGGGCCAGCCGTCCCCCAACAAGGACCCACCTCCCCctgccccccctctccccccgccCACTCAGACCCCCCACACCCCCCTCAACCAATCAGAGTGTGACTTGCAAGACTTCCCCAGCCCCAACGGCCTATCGGCGACGTTACCCAGCGTCTTGCGGAGGATGCACGGTAACAGCTACATGTTGTTAAGACAGAGTGAGGCGGAGAGCAGCTCCCCTCTCTGCCGCTCCTTCACTGAGGAACTCAACACGATTCTGGAGAAGAGGAAGCACACGCAGCTGCTGCCAAAACCGAACGAGAGCTCTCTGTAGTAGAGGGAACACCTCTCTGTGTCCGGGAGGTAGCTCCCCCTGTGGTGGGAGGACTGAACTGGACCCACTAATATTgtccatttagcagacgcttttatccaaagcaacgtACATCAGTGAGTGGCCATTGGTGGCCCAAAACAGAGTGCAGTAGAGATCCTTTGAAGATGACCCATGCTGCTCACAGAGTAAAATGTTTTTAAACTAGCCTGGACTGAATTATGAGAGAAGGAGATGTCCTGCTTACGTTTTTTGGACGTAATAAAGGGACACACATCTGGTTGAAGTATCAACTGTGTTTCAAAATAAACTATTTCTGCAAACTATTCGGCCCCCCTATCGCTATCCCCTGTTTGACACCCAAAGCCATGGGTTACAGTGAGTACACAcataagagagacagagagaacctaCCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGATCAACAGGCTAGACCTAACCCAGCTCCAGTCAATACACCTCAGTCTGGATCAATAAAAGATGAGCCCTGGGGGGGTGATTCAAGGGGCAGGCCTCAAATCTCAGCCCCAGATTAAGGCTCCTCGCTGGGCAGGACACGAGGGACAGGGACCCTGGAAGTCTCAACACAGCCCATGATAacaaggaagaagaggaggaagaagaagaggctcACGGGAATATGAGTTCTTGTGAAGTGTGACAATGACTTGACTTTTTTGGTTTTTAAATGGAGGCAGCTGTCCAAAGGAGAGACCAGACGTGTTTTAAGATGTTGTGCTCTACACCTTTGTAGCTGGTTTCATATTGGACATTGAGggcaaaatgtgtttttattcttagaagtttgtaaattatgtgaaCATTGATTACAATGGTAACACAAAATGTAATAACCAAATTTAAGTAATATTATTAACACATATCAACTCTTAAccccagacagagagagtaatCCAATGAAAATACCCTTTGTACATAATTTTTGTGTAATAGGAAATTGGACACTATTAACCGTTATAGTGAAATGTAAATGCCGTTTCCTTCAGACATTCCCTGGTTATTATCTACTCAACTCAATACAAACACATCAGGAATATGAGAGATTCAACCCCATCTGAGTAGGAGCCAATGGATTACCAGAATCCATACACTGCTGTCTCCTATCCAACCCCAACCTAATGGGTCTGAACTATGGTTGGAAAATAGGTCTGAGCTCTACCACGACATCACAGCTCGGCCACAGAGGACCAGACATCATGTACACCTGAGGCCTGAGAGATGCTGTCTAGTTTTGGGCCTGTCTGTTTGAAACAGATCTTGCTAACTTCAACTCCAGACATTCTCAGATATGGTGTGATGTCTGGTACCGTGACACTAATATCTTGCCCACCGGGAATAGCTTCAAAATGTCTGAATAACTTTGAATAGTCACTGTTTGGAATCAAACACAGTTCCAGTACCATTGGAAGACCAATTATAATCCAGAGGGACTGAGGAAACAGTCTAATCATCCATTCTACAACAAACAGCATGCTCTATCCCATGTTAACCTGAGAACTGGATAGTAATATAGGCCAGGGTACAGTACAGCTACTCTGTAACTGTGCGGTTCATCACAAGAGCAAACTGGGGAAAGGGGCATTTAATGGTTCTGGTCTTCACATCAAATCACACTGCCCTCTCTGTAGTCCTCTCTGTAAGGATAACAAACTATGACAAAATGGATGCTTACTAATCATGATCCCCATCCCAACTGTTGCCAGGTTTTAAAATGAATACACTATTAGTGACACTATGTtctttttaagtaaaaaaaaaatacatgtattgtaATTTTGTTCTAGGTTGCTATTCTATTGccagtgttgttgttttggtgcAATTTGTAAGAGGCATTGATGTGAGTGTCTTGTCCATTAGTGTTGCACTAGTAATCTAATAGCACGGTAGAACAACAGGGGTCTCCAACTCTGGTCCTGGAGACCTACGGGCGATGCAGGAATTCTTCCTACCCGGCACTACCACAGCTGATCCAACTTATCATGGTTCAGAGTCAGACTGAAGACTGTGATGAATTGAGTGTGTTTAGTAGGTACGTTAGTGATTGGTTGGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTccgtctctatctctatctctgtctctatctctatctctgtctct
>TU104669
GGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTctgtctctatctccgtCTCTATCtccgtctctatctctgtctctatctccgtctctatctctctctctgtaatATTATGAATATTAAGTACAATGCAGACACAAGATGTCATCCTGCTTTACTAACAGTAAAACATTGAGTAGCAGTTCACCAGTggaggttgctgaggggaggacagctcataataatgtctggaacagagcgaatggaatggcatcaaaaacATGGAaaccactgattccgctccagccattaccacaagcccgtcctctccaattaaggtgccagCAACCTCCTGTGCAGCTCACTGACTTCTGGTTCATTTAAATGTCATTTATCTGAGTTGAAATTCTAATAAACAATGTGTTTCAAA
>TU104675
GGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTctgtctctatctctgtctctatcttcgTCTCTATCTCCGTCTCTATCtccgtctctatctctgtctctatctctatctccgtCTCTATCTccgtctctatgtctctctctgtaatATTATGAATATTAAGTACAATGCAGACACAAGATGTCATCCTGCTTTACTAACAGTAAAACATTGAGTAGCAGTTCACCAGTggaggttgctgaggggaggacagctcataataatgtctggaacagagcgaatggaatggcatcaaaaacATGGAaaccactgattccgctccagccattaccacaagcccgtcctctccaattaaggtgccagCAACCTCCTGTGCAGCTCACTGACTTCTGGTTCATTTAAATGTCATTTATCTGAGTTGAAATTCTAATAAACAATGTGTTTCAAA
>TU104684
CTTTTTTCCCAAGTTATTTCTGTTTCCCATACCTACTGTTGACACATCAAAACATCACCAGGAAGTGAACACAGTGCAGATCTCTGTTTCTGATTCACTGCTGTCTTGTTCTTCCACAGGCCTGAGAGATGCTGTCTAGTTTTGGGCCTGTCTGTTTGAAACAGATCTTGCTAACTTCAACTCCAGACATTCTCAGATATGGTGTGATGTCTGGTACCGTGACACTAATATCTTGCCCACCGGGAATAGCTTCAAAATGTCTGAATAACTTTGAATAGTCACTGTTTGGAATCAAACACAGTTCCAGTACCATTGGAAGACCAATTATAATCCAGAGGGACTGAGGAAACAGTCTAATCATCCATTCTACAACAAACAGCATGCTCTATCCCATGTTAACCTGAGAACTGGATAGTAATATAGGCCAGGGTACAGTACAGCTACTCTGTAACTGTGCGGTTCATCACAAGAGCAAACTGGGGAAAGGGGCATTTAATGGTTCTGGTCTTCACATCAAATCACACTGCCCTCTCTGTAGTCCTCTCTGTAAGGATAACAAACTATGACAAAATGGATGCTTACTAATCATGATCCCCATCCCAACTGTTGCCAGGTTTTAAAATGAATACACTATTAGTGACACTATGTtctttttaagtaaaaaaaaaatacatgtattgtaATTTTGTTCTAGGTTGCTATTCTATTGccagtgttgttgttttggtgcAATTTGTAAGAGGCATTGATGTGAGTGTCTTGTCCATTAGTGTTGCACTAGTAATCTAATAGCACGGTAGAACAACAGGGGTCTCCAACTCTGGTCCTGGAGACCTACGGGCGATGCAGGAATTCTTCCTACCCGGCACTACCACAGCTGATCCAACTTATCATGGTTCAGAGTCAGACTGAAGACTGTGATGAATTGAGTGTGTTTAGTAGGTACGTTAGTGATTGGTTGGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTctatctctatctctgtctctatctccgtCTCTATCtccgtctctatctctgtctctatctctgtctctatctctatctccgtCTCTATCTccgtctctatgtctctctctgtaatATTATGAATATTAAGTACAATGCAGACACAAGATGTCATCCTGCTTTACTAACAGTAAAACATTGAGTAGCAGTTCACCAGTggaggttgctgaggggaggacagctcataataatgtctggaacagagcgaatggaatggcatcaaaaacATGGAaaccactgattccgctccagccattaccacaagcccgtcctctccaattaaggtgccagCAACCTCCTGTGCAGCTCACTGACTTCTGGTTCATTTAAATGTCATTTATCTGAGTTGAAATTCTAATAAACAATGTGTTTCAAA
>TU104689
GGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTctgtctctatctctgtctctatctgtctctatctctgtctctatctccgtctctgtctccgtctctgtctctatctctatctccgtCTCTATCTccgtctctatgtctctctctgtaatATTATGAATATTAAGTACAATGCAGACACAAGATGTCATCCTGCTTTACTAACAGTAAAACATTGAGTAGCAGTTCACCAGTggaggttgctgaggggaggacagctcataataatgtctggaacagagcgaatggaatggcatcaaaaacATGGAaaccactgattccgctccagccattaccacaagcccgtcctctccaattaaggtgccagCAACCTCCTGTGCAGCTCACTGACTTCTGGTTCATTTAAATGTCATTTATCTGAGTTGAAATTCTAATAAACAATGTGTTTCAAA
>TU104690
GGAGGATGCACGGTAACAGCTACATGTTGTTAAGACAGAGTGAGGCGGAGAGCAGCTCCCCTCTCTGCCGCTCCTTCACTGAGGAACTCAACACGATTCTGGAGAAGAGGAAGCACACGCAGCTGCTGCCAAAACCGAACGAGAGCTCTCTGTAGTAGAGGGAACACCTCTCTGTGTCCGGGAGGTAGCTCCCCCTGTGGTGGGAGGACTGAACTGGACCCACTAATATTgtccatttagcagacgcttttatccaaagcaacgtACATCAGTGAGTGGCCATTGGTGGCCCAAAACAGAGTGCAGTAGAGATCCTTTGAAGATGACCCATGCTGCTCACAGAGTAAAATGTTTTTAAACTAGCCTGGACTGAATTATGAGAGAAGGAGATGTCCTGCTTACGTTTTTTGGACGTAATAAAGGGACACACATCTGGTTGAAGTATCAACTGTGTTTCAAAATAAACTATTTCTGCAAACTATTCGGCCCCCCTATCGCTATCCCCTGTTTGACACCCAAAGCCATGGGTTACAGTGAGTACACAcataagagagacagagagaacctaCCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGATCAACAGGCTAGACCTAACCCAGCTCCAGTCAATACACCTCAGTCTGGATCAATAAAAGATGAGCCCTGGGGGGGTGATTCAAGGGGCAGGCCTCAAATCTCAGCCCCAGATTAAGGCTCCTCGCTGGGCAGGACACGAGGGACAGGGACCCTGGAAGTCTCAACACAGCCCATGATAacaaggaagaagaggaggaagaagaagaggctcACGGGAATATGAGTTCTTGTGAAGTGTGACAATGACTTGACTTTTTTGGTTTTTAAATGGAGGCAGCTGTCCAAAGGAGAGACCAGACGTGTTTTAAGATGTTGTGCTCTACACCTTTGTAGCTGGTTTCATATTGGACATTGAGggcaaaatgtgtttttattcttagaagtttgtaaattatgtgaaCATTGATTACAATGGTAACACAAAATGTAATAACCAAATTTAAGTAATATTATTAACACATATCAACTCTTAAccccagacagagagagtaatCCAATGAAAATACCCTTTGTACATAATTTTTGTGTAATAGGAAATTGGACACTATTAACCGTTATAGTGAAATGTAAATGCCGTTTCCTTCAGACATTCCCTGGTTATTATCTACTCAACTCAATACAAACACATCAGGAATATGAGAGATTCAACCCCATCTGAGTAGGAGCCAATGGATTACCAGAATCCATACACTGCTGTCTCCTATCCAACCCCAACCTAATGGGTCTGAACTATGGTTGGAAAATAGGTCTGAGCTCTACCACGACATCACAGCTCGGCCACAGAGGACCAGACATCATGTACACCTGAGGCCTGAGAGATGCTGTCTAGTTTTGGGCCTGTCTGTTTGAAACAGATCTTGCTAACTTCAACTCCAGACATTCTCAGATATGGTGTGATGTCTGGTACCGTGACACTAATATCTTGCCCACCGGGAATAGCTTCAAAATGTCTGAATAACTTTGAATAGTCACTGTTTGGAATCAAACACAGTTCCAGTACCATTGGAAGACCAATTATAATCCAGAGGGACTGAGGAAACAGTCTAATCATCCATTCTACAACAAACAGCATGCTCTATCCCATGTTAACCTGAGAACTGGATAGTAATATAGGCCAGGGTACAGTACAGCTACTCTGTAACTGTGCGGTTCATCACAAGAGCAAACTGGGGAAAGGGGCATTTAATGGTTCTGGTCTTCACATCAAATCACACTGCCCTCTCTGTAGTCCTCTCTGTAAGGATAACAAACTATGACAAAATGGATGCTTACTAATCATGATCCCCATCCCAACTGTTGCCAGGTTTTAAAATGAATACACTATTAGTGACACTATGTtctttttaagtaaaaaaaaaatacatgtattgtaATTTTGTTCTAGGTTGCTATTCTATTGccagtgttgttgttttggtgcAATTTGTAAGAGGCATTGATGTGAGTGTCTTGTCCATTAGTGTTGCACTAGTAATCTAATAGCACGGTAGAACAACAGGGGTCTCCAACTCTGGTCCTGGAGACCTACGGGCGATGCAGGAATTCTTCCTACCCGGCACTACCACAGCTGATCCAACTTATCATGGTTCAGAGTCAGACTGAAGACTGTGATGAATTGAGTGTGTTTAGTAGGTACGTTAGTGATTGGTTGGAGCAAAACCCTGCACATGCAGTCACTCTACAGGGCCGGAGTTGGAGAACCTGTTGTTGAAGCATGGTATCTTCGCTAACAACATGATGAACGGAATACACCACCACAACCATAATGTGACAGAGGATAAGACTCTTCAGTCTGGCCCATTCATCTGGGTTGGCTTAGATAAAGTTCCCCACAGCTCGTTAAGCAACTTCCACAGCATTCATCATTCTGTCTTTTGTTCTCGCTCTCCCTATTGCTCGCTCTGTCTCTATCTTCGTCTCTATCTCCGTCTCTATCTccgtctctatctctatctctgtctctatctctatctctgtctctatctctatctccgtctctatctccgtctctatctctgtctctatctccgtctctatctctctctctgtaatATTATGAATATTAAGTACAATGCAGACACAAGATGTCATCCTGCTTTACTAACAGTAAAACATTGAGTAGCAGTTCACCAGTggaggttgctgaggggaggacagctcataataatgtctggaacagagcgaatggaatggcatcaaaaacATGGAaaccactgattccgctccagccattaccacaagcccgtcctctccaattaaggtgccagCAACCTCCTGTGCAGCTCACTGACTTCTGGTTCATTTAAATGTCATTTATCTGAGTTGAAATTCTAATAAACAATGTGTTTCAAA
>TU104678
gtaaatagacggctacgaataatatagatgagaattctcttggtagatagtgtggtctacagcttatcataaggtactctacctcgccttaccagacgtagctgccctgtcctgcctatgtacggaaaacccagccagctctatattgtcggtgttgtcgttcagccacgactcagtgaaacataagatattacagtttttaatgtcccgttggcagGATATTCTTAATCGTATatcatccagtttattttccaatgattgcacgttggccaatagtactGATGATAGTGGTGGTTTACCCACTCGCCTCCAAATTCTCACAAGGCGCCCCAACCTAATCGTTTCTTCACAcgaatgatggggatttgggcctggtcttgagaatgcagtatatcctttgcgtcggactcattaaagaaaagtTCTTTGTCtagttcaaggtgagtaatcgctgttctgatgtccagaagctcctctcggtcataagagactgtaGCAGCTCCATtatttacaaacaatgcaaaaaaactaacaaaatagcacagttttTTAGGAGCCTGTAAGAAGGCAGCCCACCCCTCCAGCGCCATTCTTAACATACTAAAGAACGGTCGCTAAATGTGTTGTTGGAGCAGgtgtcgatactgataggatcgaaagaaagGCAGCGCTgcgatcagctttctccatttaAATCTTTCCTTTACATTATAGTTATTCAACAATACTGACGACGGATCAGCTCCTGGAGAGATATTACCACCTACGGTTGCAAATATTGAGgcggcttattctaatgcttacccaataaaaatgcacaaaattATCAATTTGGCACATTATTGCGCACATGTAAGGCTACACATCATGGCAGACATGGAGATAAATTatagacagtagcctacaagcaGCAAAATAGAACTCAATATGATTGAAAACACCTGTAGCCTTTTTTTATGAATTCag
>TU104688
gggtggctactttgaagaatctcaaatataaaatatcattacatttgttttaacacttttttggttactacatgatttcatatgtgttatttcatagtttagacctcttcactattattctacaacatagaaaatagtcaaaatgaagaaaaacccttgaatgaataggtgtgtccaagcttttgactggtactgtacattcagTCACAGTGGGGCCGACGTCGTTGATGCGctcattgatgaagccagtgacggaGGTGTTATACTCCTCAATGGCATTGGATGAATCCcgtaacatattccagtctgtgctagcaaaacagtccagtagagtagcatccgcgtcatctgaccacttccgtattgagtgagtcactggtaattcctgttttagttttagcttgtaagcaggaatcaggaggatataattatggtcagatttgccaaatggagggcgagggagagctttgtatgcgtctctgtgtgtggagtaaaggcaGTCTATTTTTTTCCTCTGTTTGCACATGtggcatgctggtagaaatgagttaaaactgatttaagtttccctacattaaagtccctggcaaCTAGGAGCGcctcctctggatgagcattttcttgtttgcttatggccttatacagctcattgagtgtggtcttagtgccagcatcggtctgtggtggtaaatagacggctacgaataatatagatgagaattctcttggtagatagtgtggtctacagcttatcataaggtactctacctcgccttaccagacgtagctgccctgtcctgcctatgtacggaaaacccagccagctctatattgtcggtgttgtcgttcagccacgactcagtgaaacataagatattacagtttttaatgtcccgttggcagGATATTCTTAATCGTATatcatccagtttattttccaatgattgcacgttggccaatagtactGATGATAGTGGTGGTTTACCCACTCGCCTCCAAATTCTCACAAGGCGCCCCAACCTAATCGTTTCTTCACAcgaatgatggggatttgggcctggtcttgagaatgcagtatatcctttgcgtcggactcattaaagaaaagtTCTTTGTCtagttcaaggtgagtaatcgctgttctgatgtccagaagctcctctcggtcataagagactgtaGCAGCTCCATtatttacaaacaatgcaaaaaaactaacaaaatagcacagttttTTAGGAGCCTGTAAGAAGGCAGCCCACCCCTCCAGCGCCATTCTTAACATACTAAAGAACGGTCGCTAAATGTGTTGTTGGAGCAGgtgtcgatactgataggatcgaaagaaagGCAGCGCTgcgatcagctttctccatttaAATCTTTCCTTTACATTATAGTTATTCAACAATACTGACGACGGATCAGCTCCTGGAGAGATATTACCACCTACGGTTGCAAATATTGAGgcggcttattctaatgcttacccaataaaaatgcacaaaattATCAATTTGGCACATTATTGCGCACATGTAAGGCTACACATCATGGCAGACATGGAGATAAATTatagacagtagcctacaagcaGCAAAATAGAACTCAATATGATTGAAAACACCTGTAGCCTTTTTTTATGAATTCag
>TU104677
agagtagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtagagtagagagggtagagtagagaggatagggtagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtagagaagagagggtagagtagagagggtagagtagagaggatagagtagggtagagaagagagggtagggtagagaggatagagtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagagaggatagggtagggtagggtaggatagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtaggatagagtagagggggtagagtagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtagagtagagagggtagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagggtagagaagagagggtagagaagagaggatagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagagaagagagggtagagaagagaggatagagtagagaggatagagtagagagggtagagaagagaggatagggtagggtagggtagggtagggtagagaagagaggatagagtaAAGAGGATAGGGTAGAGGGGGTAGATTTCAGTGAAGCAGAGTAAAAACATCAAAGGCTGCAGGTACAGGGAACGGAGAGGAGATGAGACTAATGTACACCACTCTTTGAATCTGATgctctttctccatttctctctctttctcactctcttgcCTTCTTTACTCATAATGACACATTTCATTTTTCTGCATcttttcttcctcctccctctccctcgtctcctgcctccctctccctcgtcccctgcctccctctccctcgtctcctgcctccctctccctcgtctcctgcctccctgctctctcctccctcacctcgTGCTGCCTCCCTGTTCTCTTGCCTGCTAGGGTGAATTTCCATTGAACTATTTTGTGTGGATAAAAACAGCTGGACATAATGACGTCACACCTAAAACAACTAGTGTTGAATACAAATGCAGTGGTTGAAGTGTTTCCATCACCCATTTAGACAAATTGTGCATTAATACATTGGCCACAGCCTGTATGCCCTCCCACcttcactatatatacaaaagtatgtggacaccccttcaaaatagTGGATTCAGCTATGTCAGCCAcatctgttgctgacaggtgtataaagttgagtacacagccatgcaatctccatagacaaacagtggcagtataatggccttactgtagagctcagtgacttccaacgtggcacagtcataggatgccacctttccaacaagtccgtttgtcaaatttctaccctgctaaAGCTGCCGCGGCcaagtaagtgctgttattgtgaagtggaaaagtctaggagcaataacagctcagctgcaaagtggtaggccacgcaTGCTCCCAAAacgactaaactgcttggagtaaccctgaattgtaaactgtcatggtcaaaacatattgatacaacagtagctaggatggggagaagtctgtccataataaagcgctgctctgcctttttaacaacactatcaacaaggcaggtcctacaggtcctagttttgtcgcacctggaccattgttcagtcgtgtggtcaggtgccacaaagagggacttaggaaaattacaattggctcagaacacgGCACTACTGCTGGACCTTaaaagtacacggagagctaacattaaggatatgcatgtcaatctctcatggctcaaagtggaagagagattgacttcctcactacttgtttttgtaagaagtgttgacattgACTGTTTAAACTACTAGTACACAgattggacacccatgcataccccacaagacatgccaccagaggtctcttcacaatcccaagtccagaacagactatgggaggcatacagccctacatagagccatgactacatggaactttatgccacatcaggtaactggtacaagcagtaaaatcagatttaaaaaacaggtaaaaatacacctgattatggaacagcggggactgtgaagagacacacacaaaggtacagacacacgcatatgCACACAAGCGCTAGCA
>TU104679
TAGATTTCAGTGAAGCAGAGTAAAAACATCAAAGGCTGCAGGTACAGGGAACGGAGAGGAGATGAGACTAATGTACACCACTCTTTGAATCTGATgctctttctccatttctctctctttctcactctcttgcCTTCTTTACTCATAATGACACATTTCATTTTTCTGCATcttttcttcctcctccctctccctcgtctcctgcctccctctccctcgtctcctgcctccctctccctcgtctcctgcctccctgctctctcctccctcacctcgTGCTGCCTCCCTGTTCTCTTGCCTGCTAGGGTGAATTTCCATTGAACTATTTTGTGTGGATAAAAACAGCTGGACATAATGACGTCACACCTAAAACAACTAGTGTTGAATACAAATGCAGTGGTTGAAGTGTTTCCATCACCCATTTAGACAAATTGTGCATTAATACATTGGCCACAGCCTGTATGCCCTCCCACcttcactatatatacaaaagtatgtggacaccccttcaaaatagTGGATTCAGCTATGTCAGCCAcatctgttgctgacaggtgtataaagttgagtacacagccatgcaatctccatagacaaacagtggcagtataatggccttactgtagagctcagtgacttccaacgtggcacagtcataggatgccacctttccaacaagtccgtttgtcaaatttctaccctgctaaAGCTGCCGCGGCcaagtaagtgctgttattgtgaagtggaaaagtctaggagcaataacagctcagctgcaaagtggtaggccacgcaTGCTCCCAAAacgactaaactgcttggagtaaccctgaattgtaaactgtcatggtcaaaacatattgatacaacagtagctaggatggggagaagtctgtccataataaagcgctgctctgcctttttaacaacactatcaacaaggcaggtcctacaggtcctagttttgtcgcacctggaccattgttcagtcgtgtggtcaggtgccacaaagagggacttaggaaaattacaattggctcagaacacgGCACTACTGCTGGACCTTaaaagtacacggagagctaacattaaggatatgcatgtcaatctctcatggctcaaagtggaagagagattgacttcctcactacttgtttttgtaagaagtgttgacattgACTGTTTAAACTACTAGTACACAgattggacacccatgcataccccacaagacatgccaccagaggtctcttcacaatcccaagtccagaacagactatgggaggcatacagccctacatagagccatgactacatggaactttatgccacatcaggtaactggtacaagcagtaaaatcagatttaaaaaacaggtaaaaatacacctgattatggaacagcggggactgtgaagagacacacacaaaggtacagacacacgcatatgCACACAAGCGCTAGCA
>TU104687
CCCAGCCCCAACGGCCTATCGGCGACGTTACCCAGCGTCTTGCGGAGGATGCACGGTAACAGCTACATGTTGTTAAGACAGAGTGAGGCGGAGAGCAGCTCCCCTCTCTGCCGCTCCTTCACTGAGGAACTCAACACGATTCTGGAGAAGAGGAAGCACACGCAGCTGCTGCCAAAACCGAACGAGAGCTCTCTGTAGTAGAGGGAACACCTCTCTGTGTCCGGGAGGTAGCTCCCCCTGTGGTGGGAGGACTGAACTGGACCCACTAATATTgtccatttagcagacgcttttatccaaagcaacgtACATCAGTGAGTGGCCATTGGTGGCCCAAAACAGAGTGCAGTAGAGATCCTTTGAAGATGACCCATGCTGCTCACAGAGTAAAATGTTTTTAAACTAGCCTGGACTGAATTATGAGAGAAGGAGATGTCCTGCTTACGTTTTTTGGACGTAATAAAGGGACACACATCTGGTTGAAGTATCAACTGTGTTTCAAAATAAACTATTTCTGCAAACTATTCGGCCCCCCTATCGCTATCCCCTGTTTGACACCCAAAGCCATGGGTTACAGTGAGTACACAcataagagagacagagagaacctaCCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGCTCAGCAGGCTAGACCTACCCCAGCTCAGCAGAGATCAACAGGCTAGACCTAACCCAGCTCCAGTCAATACACCTCAGTCTGGATCAATAAAAGATGAGCCCTGGGGGGGTGATTCAAGGGGCAGGCCTCAAATCTCAGCCCCAGATTAAGGCTCCTCGCTGGGCAGGACACGAGGGACAGGGACCCTGGAAGTCTCAACACAGCCCATGATAacaaggaagaagaggaggaagaagaagaggctcACGGGAATATGAGTTCTTGTGAAGTGTGACAATGACTTGACTTTTTTGGTTTTTAAATGGAGGCAGCTGTCCAAAGGAGAGACCAGACGTGTTTTAAGATGTTGTGCTCTACACCTTTGTAGCTGGTTTCATATTGGACATTGAGggcaaaatgtgtttttattcttagaagtttgtaaattatgtgaaCATTGATTACAATGGTAACACAAAATGTAATAACCAAATTTAAGTAATATTATTAACACATATCAACTCTTAAccccagacagagagagtaatCCAATGAAAATACCCTTTGTACATAATTTTTGTGTAATAGGAAATTGGACACTATTAACCGTTATAGTGAAATGTAAATGCCGTTTCCTTCAGACATTCCCTGGTTATTATCTACTCAACTCAATACAAACACATCAGGAATATGAGAGATTCAACCCCATCTGAGTAGGAGCCAATGGATTACCAGAATCCATACACTGCTGTCTCCTATCCAACCCCAACCTAATGGGTCTGAACTATGGTTGGAAAATAGGTCTGAGCTCTACCACGACATCACAGCTCGGCCACAGAGGACCAGACATCATGTACACCTGAGGTAACCAGGCTAAGTTTTGTTTTCTGGCAGTTGGTTGGTTCTacagacaggcagccaggcagacagacaggcagacagacagatatcgtGGCCAGATAGTGACATCCAGGGGAACTCTGTCTAGTATGTTTTCCTCTTTTCTTTGAGTGTTGGTTGTGCCAAagagagggtaggagagggtagagtagagaggatagagtagagaggatagggtagggtagggtaggatagagaagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtaggatagagtagagggggtagagtagagagggtagagtagagaggatagagtagagagggtagagtagagagggtagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagagaagagagggtagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagggtagagaagagagggtagagaagagaggatagagtagagaggatagggtagggtagggtagggtagagaagagaggatagagtagagaggatagggtagggtagg
>TU104695
TGTCCTTGATCACCATCCTAGGAGGTCTGTGTCTGGTTCTCACCGTGGTCCTCCTCTACCTTGGCTTCTGTCTGCGGGGCAGCCACAGGGGGAAGTACTCTCTCCGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCTGCCAATCACACGGACAGGAAGAGGAAACACAGGAAGCAGCAGCAGAAACGCCACAGTAGCTCCGCCCACCTGGATCTCAAGACCATCTCCAGCCACTGTAATGGGAAAGGGATCTGTAATGGTAACGGCGTCTCCCAACAACCGGGGAACGGTGACACGCACAAAGGGGGCTTCCTCCAGATCGTCCCGAGAGAGGGCCAGCCGTCCCCCAACAAGGACCCACCTCCCCctgccc
>TU104696
CCGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCTGCCAATCACACGGACAGGAAGAGGAAACACAGGAAGCAGCAGCAGAAACGCCACAGTAGCTCCGCCCACCTGGATCTCAAGACCATCTCCAGCCACTGTAATGGGAAAGGGATCTGTAATGGTAACGGCGTCTCCCAACAACCGGGGAACGGTGACACGCACAAAGGGGGCTTCCTCCAGATCGTCCCGAGAGAGGGCCAGCCGTCCCCCAACAAGGACCCACCTCCCCctgccc

Function

NR:

description
PREDICTED: semaphorin-4G-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036989962.1 False 5818 mRNA 0.51 16 84292293 84331700
TU104669 False 660 lncRNA 0.44 3 84291760 84292623
TU104675 False 702 TUCP 0.44 3 84291760 84292623
TU104684 False 1662 TUCP 0.52 3 84291760 84293583
TU104689 False 706 lncRNA 0.49 3 84291760 84292623
TU104690 False 3005 lncRNA 0.37 4 84291760 84301202
TU104678 False 966 lncRNA 0.42 2 84294496 84295546
TU104688 False 1652 lncRNA 0.46 2 84294496 84296232
TU104677 False 2265 lncRNA 0.47 3 84296936 84299386
TU104679 False 1463 lncRNA 0.45 3 84296936 84298471
TU104687 False 2041 lncRNA 0.53 3 84298702 84301245
TU104695 False 366 lncRNA 0.61 1 84301317 84301682
TU104696 True 263 lncRNA 0.63 1 84301317 84301579

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531033 LOC106577242 coding downstream 35344 84157529 ~ 84256949 (-)
LOC110531009 NA coding downstream 165461 84122691 ~ 84126832 (-)
LOC110530947 LOC106577244 coding downstream 181622 84097627 ~ 84110671 (-)
LOC110530927 LOC106577245 coding downstream 244163 84031554 ~ 84104730 (-)
LOC110532804 NA coding downstream 324788 83966165 ~ 83967505 (-)
LOC110522386 LOC106577258 coding upstream 428398 84760098 ~ 84781879 (-)
LOC118966724 LOC106613591 coding upstream 830050 85161750 ~ 85171855 (-)
LOC110516660 tarbp1 coding upstream 840244 85171944 ~ 85207269 (-)
LOC110510599 LOC106613623 coding upstream 881682 85213382 ~ 85244441 (-)
LOC110510598 LOC106594326 coding upstream 915638 85247338 ~ 85299641 (-)
G94900 NA non-coding downstream 4104 84287756 ~ 84288189 (-)
G94896 NA non-coding downstream 5298 84286789 ~ 84286995 (-)
G94854 NA non-coding downstream 48092 84243960 ~ 84244201 (-)
G94853 NA non-coding downstream 48556 84243538 ~ 84243737 (-)
G94851 NA non-coding downstream 50249 84241807 ~ 84242044 (-)
G94950 NA non-coding upstream 786 84332486 ~ 84332808 (-)
G94951 NA non-coding upstream 1354 84333054 ~ 84333302 (-)
G94963 NA non-coding upstream 10485 84342185 ~ 84342448 (-)
G94977 NA non-coding upstream 17657 84349357 ~ 84349568 (-)
G95179 NA non-coding upstream 54533 84386233 ~ 84412642 (-)
G94821 NA other downstream 87829 84203487 ~ 84204464 (-)
G94613 NA other downstream 489822 83801332 ~ 83802471 (-)
G94201 NA other downstream 806356 83484056 ~ 83485937 (-)
LOC100301648 LOC106577193 other downstream 1330971 82949609 ~ 83267163 (-)
G95494 NA other upstream 397164 84728864 ~ 84729423 (-)
G95624 NA other upstream 648033 84979733 ~ 84980272 (-)
G95784 NA other upstream 826042 85157742 ~ 85159313 (-)
G94947 NA non-coding upstream 28640 84330322 ~ 84331097 (-)

Expression


Co-expression Network