papolg (papolg)


Basic Information

Item Value
gene id papolg
gene name papolg
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 88178952 ~ 88202158 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036988142.1
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Function

symbol description
papolg Predicted to enable polynucleotide adenylyltransferase activity. Predicted to be involved in mRNA polyadenylation. Predicted to act upstream of or within RNA 3'-end processing; RNA polyadenylation; and mRNA processing. Predicted to be active in nucleus. Orthologous to human PAPOLG (poly(A) polymerase gamma).

NR:

description
poly(A) polymerase gamma-like

GO: NA

KEGG:

id description
K14376 PAP; poly(A) polymerase

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036988142.1 False 6419 mRNA 0.50 24 88178952 88202158
XR_005053261.1 False 6332 mRNA 0.50 25 88178952 88202158
XR_005053262.1 True 6203 mRNA 0.50 25 88178952 88202158

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118966733 NA coding downstream 14341 88159117 ~ 88164611 (-)
LOC100499622 alb1 coding downstream 34486 88131038 ~ 88144466 (-)
LOC118936685 LOC106577316 coding downstream 54225 88092044 ~ 88124727 (-)
pex13 LOC106592834 coding downstream 113829 88054545 ~ 88065123 (-)
LOC110531618 LOC106577176 coding downstream 125062 88029528 ~ 88053890 (-)
LOC118966057 NA coding upstream 25730 88224741 ~ 88230342 (-)
LOC118966058 NA coding upstream 29783 88231941 ~ 88234672 (-)
LOC118936686 LOC106594327 coding upstream 34423 88236581 ~ 88270980 (-)
LOC118966063 NA coding upstream 512715 88714598 ~ 88715755 (-)
LOC118966064 NA coding upstream 514160 88716318 ~ 88717077 (-)
G98488 NA non-coding downstream 11640 88165837 ~ 88167312 (-)
G98478 NA non-coding downstream 64670 88111666 ~ 88114282 (-)
G98473 NA non-coding downstream 76699 88101473 ~ 88102253 (-)
G98445 NA non-coding downstream 151287 88027047 ~ 88027665 (-)
G98399 NA non-coding downstream 157145 88021032 ~ 88021807 (-)
G98501 NA non-coding upstream 2132 88204290 ~ 88204609 (-)
G98502 actr2a non-coding upstream 8803 88210961 ~ 88212201 (-)
G98505 NA non-coding upstream 21173 88223331 ~ 88224678 (-)
LOC110531505 LOC106597820 other downstream 263052 87911053 ~ 87919678 (-)
G97535 NA other downstream 883953 87294357 ~ 87294999 (-)
G97308 NA other downstream 1390900 86787057 ~ 86788052 (-)
G97251 NA other downstream 1555641 86566477 ~ 86623311 (-)
G98510 NA other upstream 16671 88218829 ~ 88220804 (-)
G98549 NA other upstream 112118 88314276 ~ 88314696 (-)
G98616 NA other upstream 349816 88551974 ~ 88644067 (-)
LOC118966065 NA other upstream 575381 88757265 ~ 88782119 (-)
G98878 NA other upstream 873689 89075847 ~ 89076238 (-)

Expression


Co-expression Network