LOC118966057



Basic Information


Item Value
gene id LOC118966057
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 88224741 ~ 88230342 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XR_005053264.1
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>TU109125
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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU109118 False 2071 lncRNA 0.43 5 88224741 88229469
TU109120 False 999 lncRNA 0.43 2 88224741 88226344
TU109122 False 2779 lncRNA 0.44 3 88224741 88229469
TU109123 False 1330 lncRNA 0.44 3 88224741 88226344
TU109116 False 1244 lncRNA 0.41 2 88227636 88229469
TU109117 False 1007 lncRNA 0.50 2 88227636 88229469
TU109119 False 1716 lncRNA 0.43 3 88227636 88229469
TU109121 False 1598 lncRNA 0.30 2 88227636 88229469
TU109124 False 1480 lncRNA 0.43 4 88227636 88229469
TU109125 True 1880 lncRNA 0.45 2 88227636 88230342

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
papolg papolg coding downstream 25730 88178952 ~ 88202158 (-)
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LOC100499622 alb1 coding downstream 83422 88131038 ~ 88144466 (-)
LOC118936685 LOC106577316 coding downstream 103161 88092044 ~ 88124727 (-)
pex13 LOC106592834 coding downstream 162765 88054545 ~ 88065123 (-)
LOC118966058 NA coding upstream 1599 88231941 ~ 88234672 (-)
LOC118936686 LOC106594327 coding upstream 6239 88236581 ~ 88270980 (-)
LOC118966063 NA coding upstream 484531 88714598 ~ 88715755 (-)
LOC118966064 NA coding upstream 485976 88716318 ~ 88717077 (-)
LOC118966065 NA coding upstream 547975 88757265 ~ 88782119 (-)
G98505 NA non-coding downstream 3210 88223331 ~ 88224678 (-)
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G98532 NA non-coding upstream 38661 88269003 ~ 88269227 (-)
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LOC110531505 LOC106597820 other downstream 311988 87911053 ~ 87919678 (-)
G97535 NA other downstream 932889 87294357 ~ 87294999 (-)
G97308 NA other downstream 1439836 86787057 ~ 86788052 (-)
G98549 NA other upstream 83934 88314276 ~ 88314696 (-)
G98616 NA other upstream 321632 88551974 ~ 88644067 (-)
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ghitm LOC100136239 other upstream 992808 89223150 ~ 89270371 (-)

Expression



Co-expression Network