LOC110522569 (LOC106613918)



Basic Information


Item Value
gene id LOC110522569
gene name LOC106613918
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 92012752 ~ 92084472 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence


>XM_036990085.1
ATGGACCACGGGAGGAGCCACAGTCATCATCATAGAGATAACTTCTTTGACGGTCTCCAAGTCGTGTTCGGGACGATGCTTGTGTGGAGTGAGCTGATTACACCCCACGCCATCAGAGTGCAGACCCCACCCAGGCACATCCCAGGAGTCGTGGAAGTCACCCTCTCCTACAAGTCCAAGCAGTTCTGCAAAGGAGCTCCTGGACGATTTGTCTACACTGCTTTGAACGAGCCAACCATCGACTACGGCTTCCAGAGGCTACAGAAGGTCATTCCCAGACATCCAGGAGATCCAGAGAGGCTACCGAAGGAGGTGTTGCTGAAGAGAGCAGCTGACCTTGTGGAGGCTCTGTATGGGATGCCCCACAACAACCAGGAGATCATCCTGAAGCGAGCGGCCGACATCGCCGAGGCCCTGTACAGCGTCCCGCGCAACCACAACCAGATCCCCTCACTGGGCAACACGGCGTCGCACGGCGGCATGATGGGGGTCAACTCGTTCGGCAGCCAGCTCGCCGTCAACGTCTCAGAAACATCACAGGGTAATGACCAGGTAGGATACAGCCGTCAAACCAGCAGTGTGTCCCCTCGAGGCTACGTCCCCAGCAGCACACCACAACAGGCCAACTACAACACCGTTAGCAACAGCATGAACGGCTACGGCAACCCCATGTCCAATCTGGGAGTACCCAGTTCACCAGGCTTCCTCAACGGCTCCTCTGCCAACTCCCCCTACGGCAGTAAGTATCAAGTGAAACAAAAGAGCGCCTTTGCCCCTGTTGTAAGGCCCCAAGCTTCTCCACCACCTTCTTGCACCAGTGCAAATGGCAATGGACTTCAagGGATGTCCGGACTCGTTGTCCCACCCATGTAAAACGAacactcttctccccccccccccccccccccccccccagagcacCAGTCGTCACAAAAGGGGCTGCAGGGGGACTTGTTTAGTACCCTTTAGAAGATTCTGGTTGAATCTGTGTCATCAATCATGAATAAAATCAACAACATTTTCTGTTTATTcagaggagagaaaaaaaggacTTGTTTCAAAAGAGTTTATTCAAACAATTATGAATTGTGACATGCAAGCCACTCTGTCATTTAACAATTTAATTTTATTGACTGATTTCTTGTCATATTTTACCATTTCTCAGTCttgaagaaaggaaggaaggaaaaatTGCTATTTTGTATAAAAAAGTGTCTGGTTTGATCTTGGCTTCGTCTAGTTGTTGCTATGTGTTGGGAGAATCTTTGAGGATGATCAGTTTGATGAACAACGCTGACGACAAAACCTCAGAACATGTTTGTCTTCGCACGATGCACAACAGTTGAGCGTCTCTATAAATGTGAATTCCttatttctttctctttttttaatTTGTGGTAAAGAGAAAAGGGGGGCCAAGACAGTGTGAAAACATTTTACAACTGGAAATAATATGAAATATAtgatttaaaattaaaataaaaaaaataaataaaaaaaacattaacaaGGAAGAGGTAAATACAAAATAATTTGATTGGTCGACTTACTTTATCAACAAAAAACATATTACTTTCTAACTTATTGTAGGTAGGAATTGTAAGtcaattattattatatatattttttttgggcCTTCATAAAGCACACTAACAGAGATGAAaggcgtctgtctgtctgttggtaaaAATGAACTACTTCCACTTCTGCAGCTTACAGTTTAAGCAAATGTGTTTTTCACCTCTTTTTGCCAGCACTGTATAATATTGCATTCTTAGGCTACTGTGAAGTCTATGTCTCTCGTATCAGAAGGTTGTCCATTCACTTCTGTCTCCTTATCCCCTAATGTGTTTTTTGTATGTGGTTATACAATTGTAGACTTTTGTGATTTTGCCAAAGTTGTAGCTAAATATTTATACACTTgtcttgaattttttttttttttttttttttcagatccACTTAAAATATTTAGGACAAGAGTTTTTAAATTCCTTATAGAAACAGTGAGGGGTAAATCATCGTACACATTGCAACACTTTCACATAAACACTTGCGGGTTACTAAGGGAATTTTTTTTGTAACATATCAATTATAAATATTGTATTTATCTTcgaattttttttttgtaaaattgCTTTCGATCATTTAATTTGATCTTGTACGTATTGTTTGTCATGGCCAGATATTGTgatataatacagaacattaagcCAATAACTATTGCTTAcattcaattattattttttgttgtaTCGATAGATCGCAATGTCTAAACGTTTCATTTGTATCTCAAATTGACATTTTACTTTGTCAAAAATAATTCATTTTGTtggtcattgttttttttttcttttgaggaaaaaaaaaactgtcaaagttcattgtttatttttgtattaataTAAGTTATATAaaacaaaatagttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgG
>TU112713
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctcctccttctcattcttcttcttctccttcttcttcttctccttcttcttcttctccttattcttcttctccttattctttttctcctccttcttctcctccttattcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctgctccttattcttcttcttctccttcttccttttctcctccttctcctccttctccttattcttcttctcctccgtCTTCTGCTCCTTATTCttattcttctccttcttcttcttctccttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttcttcttcttctccttctccttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112714
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttcttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112715
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctcctccttctcattcttcttcttctccttcttcttcttctccttcttcttcttctccttattcttcttctccttattctttttctcctccttcttctcctccttattcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctgctccttattcttcttcttctccttcttccttttctcctccttctcctccttctccttattcttcttctcctccgtCTTCTGCTCCTTATTCttattcttctccttcttcttcttctccttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112716
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctccttcttcttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112717
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttctccttcttcttcttctccttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttcttcttcttctccttcttctccttcttctccttcttcttctcctccttatTCTTCTTCttatccttctccttcttcttccttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112719
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttcttcttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAAATAAAGAATGAAATGATGAATGTGCAATGTATGTATTTGCTTTGTGACAGCTCAACAAAGCTAAGTGGGGAAGACTGAGAAGTCACCTTGAAAGAGACATGCAAGGTTACATGAACAACATTTGGGATTTTGATCATTTCTGCAATtagtttatttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttcagctaaTTAGACCATGCACTCATTGCTGTGTTGGCTTCAGTCTGAGGATCTCACTAAACGGTCAGCTATTCATTTGGTTTAACATGTACATTTTTTTGCGTGTTTGCTTAc
>TU112720
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttctttttctcctccttctccttattcttcttctcctccgtCTTCTGCTCCTTATTCttattcttctccttcttcttcttctccttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttcttcttcttctccttcttctccttcttctccttcttcttctcctccttatTCTTCTTCttatccttctccttcttcttccttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA
>TU112721
ttttttttgtttttggaaTAAAACTGTTTGTTGTATAGTCAAATGACTTGTTTGTGACACATGGCTGTATCAATAATAGTAGACTGTGTGCATGTCCAGccgcccccctccctcccccagaggTATGATTCAATTCGTGGTCGTACATTTTGGTTTTTCGTAGAATGTAAAAAGTCATTTTTACCTGCTACCCCATATCACTTAGCAGaactgtcttaaaaacagggatttaaaatttaaaaaaaaacacacatgaaAAACAATCTAATCTGGATTAGAAAATACATATTAAGAATCACTGATGTTTATTACAATCTGTCAGGAGAAGCTCTTTGGAAGGCCCGAGAGTGATCTGCTGGTTGAATGACATCAATCTGTACCTACACCACAATGTCAATCCTTGCTCCATGAACATGATCtatggtgtaaaaaaaaaaaaaaagcacaaacATTGTTTactgaaaataataaaaaataattatgGTGACCCCCTTCAtcttttgactattttgtgcttaaccttttttgttgttgttaatatTTGGCTTAATACTGCCCCCAAATCAGAGTTAACATCTAAAGAGATGTTGAAGAGATGCACACATTCACTATCACTAGACAGAATGATCTGTACGGAACATTCCGGAGAAACTCCATCAAATACTGTAGCATCATACTGTAGCTAAATTCACtcatccttcttctccttctcctcctaccccttcttcttcttcttcttctttttctcctccttcttctcctccttcttcttcttcttctccttcttctttttctcctccttcttctcctccttctcattcttcttcttctccttcttcttcttctccttcttcttcttctccttattcttcttcttctccttcttctttttctccttcttcttctccttcttctttttctcctccgtcttcttcttcttcttctccttctccttcttctccttcttctccttcttcttctcctccttatTCTTCTTCttatccttctccttcttcttccttctccttctccttctcctccttcttctttttctcctccgtcttcttcttcttcttctccttctccttctcctccttcttcttctcctccttcttcttctccttctcctccttcttcttattctgcttctccttctccttcttctccttcttcttcttcttcttccctcaCACTATTGATTTCCCTGGTTGTGCCAAATCAACCCACATGACACATGTttctatcaatatgttttattttcatcTTTTACTTTGCACTTAAcactttgtaaaaaaataaatctcCTATTGTAATGTTAAGTATAATTGAAAAGGGATGTTCCCTCTTGGCAAACTGCGCACAAGTTTTTTTTTTCCATGAGGAAGCACGATGTACGGCAGCTGTACAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036990085.1 False 2911 mRNA 0.39 8 92012752 92082984
TU112713 False 1461 lncRNA 0.38 2 92082501 92084176
TU112714 False 1110 lncRNA 0.37 2 92082501 92084176
TU112715 False 1410 lncRNA 0.48 2 92082501 92084176
TU112716 False 1041 lncRNA 0.36 2 92082501 92084176
TU112717 False 1306 lncRNA 0.40 3 92082501 92084176
TU112719 False 1382 lncRNA 0.37 3 92082501 92084472
TU112720 False 1339 lncRNA 0.47 3 92082501 92084176
TU112721 True 1408 lncRNA 0.38 3 92082501 92084176

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC110531613 LOC106577355 coding upstream 128372 91877562 ~ 91884380 (+)
LOC118966092 NA coding upstream 175539 91833232 ~ 91837213 (+)
LOC110531588 LOC106560822 coding upstream 926160 91076855 ~ 91086592 (+)
LOC110531853 LOC106577418 coding upstream 1100895 90903245 ~ 90911857 (+)
LOC110531710 LOC106592262 coding upstream 1116668 90870561 ~ 90896084 (+)
LOC118964553 NA coding downstream 277014 92359998 ~ 92362861 (+)
LOC110533005 clrn3 coding downstream 944595 93027579 ~ 93034467 (+)
LOC118966102 NA coding downstream 963042 93046026 ~ 93047232 (+)
LOC110501964 LOC106589166 coding downstream 1338796 93421780 ~ 93475392 (+)
LOC110511695 LOC106577385 coding downstream 1639404 93722388 ~ 93770095 (+)
G101208 NA non-coding upstream 17377 91995139 ~ 91995375 (+)
G101204 NA non-coding upstream 24629 91987639 ~ 91988123 (+)
G101203 NA non-coding upstream 28383 91984134 ~ 91984369 (+)
G101196 NA non-coding upstream 34467 91978051 ~ 91978285 (+)
G101107 NA non-coding upstream 42524 91891462 ~ 91970228 (+)
G101275 NA non-coding downstream 33129 92116113 ~ 92116411 (+)
G101285 NA non-coding downstream 68210 92151194 ~ 92151470 (+)
G101286 NA non-coding downstream 70937 92153921 ~ 92154204 (+)
G101287 NA non-coding downstream 71277 92154261 ~ 92154638 (+)
G101293 NA non-coding downstream 74130 92157114 ~ 92157363 (+)
G100377 NA other upstream 901890 91109249 ~ 91110862 (+)
G100371 NA other upstream 930031 91080666 ~ 91082721 (+)
G99880 NA other upstream 1210423 90643871 ~ 90802329 (+)
G101557 NA other downstream 444035 92527019 ~ 92531819 (+)
G101642 LOC106594265 other downstream 784692 92867676 ~ 92872700 (+)
G101737 NA other downstream 932938 93015922 ~ 93016762 (+)
G102505 NA other downstream 1750140 93833124 ~ 93835192 (+)
G101121 NA non-coding upstream 155399 91926360 ~ 91927102 (+)

Expression



Co-expression Network