LOC118966095


Basic Information

Item Value
gene id LOC118966095
gene name NA
gene type coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048565.1
NCBI id CM023219.2
chromosome length 95772356
location 92849040 ~ 92850460 (-)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>XM_036988731.1
ACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTAGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACCCTACGTTGGGCGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTTCGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACACTATTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGAAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTATGTCTCTACACTATGTTGGGGGAGATGCTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACATTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATTTTGGTATCTATTCTACGTTGGGGGAGATGCTGGTAACTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGATATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGATATCTACACTACGTTGGGG
>XM_036988734.1
ACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTAGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACACTACGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACCCTACGTTGGGCGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTTCGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACACTATTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGAAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTATGTCTCTACACTATGTTGGGGGAGATGCTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACATTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATTTTGGTATCTATTCTACGTTGGGGGAGATGCTGGTAACTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGATATCTACACTACGTTGGGGGAGA
>XM_036988727.1
ATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCGACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGAGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACAACGTTGGGGGAGATGTTGGTGTCTACACTACGTTGGGGGACATGCTGGTATCTACACTAAGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCCACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTAGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACCCTACGTTGGGCGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTATGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTTCGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACATTGGGTATCTACACTATTTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGAAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTATGTCTCTACACTATGTTGGGGGAGATGCTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACATTACGTTGGGGGAGATGTTGGTATCTACACTACGTTGGGGGAGATTTTGGTATCTATTCTACGTTGGGGGAGATGCTGGTAACTACACTACGTTGGGGGAGATGTTGATATCTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XM_036988731.1 False 1078 mRNA 0.46 3 92849040 92850414
XM_036988734.1 False 1013 mRNA 0.46 2 92849152 92850414
XM_036988727.1 True 1245 mRNA 0.46 2 92849169 92850460

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC118966742 NA coding downstream 96 92847464 ~ 92848944 (-)
LOC118966741 NA coding downstream 227038 92617056 ~ 92622002 (-)
LOC118966740 NA coding downstream 304153 92543889 ~ 92544887 (-)
LOC110531398 glrx3 coding downstream 1016661 91791792 ~ 91832379 (-)
LOC118966091 tcerg1l coding downstream 1318593 91317168 ~ 91530447 (-)
LOC110528622 LOC106592985 coding upstream 18142 92868602 ~ 93019314 (-)
LOC110511284 LOC106613906 coding upstream 265233 93115693 ~ 93117920 (-)
LOC110513667 LOC106592544 coding upstream 331945 93182405 ~ 93710353 (-)
LOC110515886 bccip coding upstream 1189780 94040240 ~ 94054157 (-)
LOC118966114 LOC106575478 coding upstream 1362074 94212534 ~ 94217907 (-)
G102143 NA non-coding downstream 29167 92819300 ~ 92819873 (-)
G102138 NA non-coding downstream 48753 92800083 ~ 92800287 (-)
G102133 NA non-coding downstream 59676 92789041 ~ 92789364 (-)
G102132 NA non-coding downstream 60194 92788595 ~ 92788846 (-)
G102126 NA non-coding downstream 80125 92768122 ~ 92768915 (-)
G102161 NA non-coding upstream 34300 92884760 ~ 92885362 (-)
G102167 NA non-coding upstream 64852 92915312 ~ 92915910 (-)
G102172 NA non-coding upstream 80733 92931193 ~ 92931461 (-)
G102174 NA non-coding upstream 90262 92940722 ~ 92941254 (-)
G102178 NA non-coding upstream 98406 92948866 ~ 92949479 (-)
G102119 NA other downstream 109510 92739013 ~ 92739530 (-)
G102083 NA other downstream 210159 92637298 ~ 92638881 (-)
G102060 NA other downstream 253526 92591581 ~ 92595514 (-)
G100582 NA other downstream 1615252 91232740 ~ 91233788 (-)
G102158 NA other upstream 23109 92873569 ~ 92874498 (-)
G102217 NA other upstream 201817 93052277 ~ 93052849 (-)
G102290 NA other upstream 451525 93301985 ~ 93339644 (-)

Expression


Co-expression Network